Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12695
• Subject: XM_011529366.1
• Aligned Length: 2478
• Identities: 2073
• Gaps: 405

Alignment

Query    1  ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCTGCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGT  74

Query   75  GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAGTCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAAC  148

Query  149  CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGACATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGC  222

Query  223  CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCA---GCTGCTGGCCCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCC  293

Query  297  AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACAC--------------------------------------  332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct  294  AGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACACGGTGAGATGCTTCCATGGGCTCTGGGATGCACCGCCAG  367

Query  333  -GGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCCCCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGG  405
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  AGGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCCCCGACTCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGG  441

Query  406  ATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTATTATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGA  479
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  ATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTATTATCTGCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGA  515

Query  480  CTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCTCACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTG  553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  CTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCTCACCTGGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTG  589

Query  554  GGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCCAGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGG  627
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  GGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCCAGAGCAGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGG  663

Query  628  AAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTGTTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAA  701
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  AAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTGTTCTTGACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAA  737

Query  702  ACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCTTCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCG  775
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  ACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCTTCTCAGGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCG  811

Query  776  GCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACC-----------------------------------------------  802
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct  812  GCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACCGCAGCCGCGTCACGCAGGACGCCAACGCCACGCTCTGGGCCTTCCTG  885

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct  886  CAGTGGCGCCGGGGGCTGTGGGCGCAGCGGCCCCACGACTCCGCGCAGCTGCTCACGGGCCGCGCCTTCCAGGG  959

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct  960  CGCCACAGTGGGCCTGGCGCCCGTCGAGGGCATGTGCCGCGCCGAGAGCTCGGGAGGCGTGAGCACGGACCACT  1033

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct 1034  CGGAGCTCCCCATCGGCGCCGCAGCCACCATGGCCCATGAGATCGGCCACAGCCTCGGCCTCAGCCACGACCCC  1107

Query  803  --------------------------------------------------------------------------  802
                                                                                      
Sbjct 1108  GACGGCTGCTGCGTGGAGGCTGCGGCCGAGTCCGGAGGCTGCGTCATGGCTGCGGCCACCGGGCACCCGTTTCC  1181

Query  803  -----------------GCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGCCTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCA  859
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  GCGCGTGTTCAGCGCCTGCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGCCTTCTTCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCA  1255

Query  860  ATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCTGCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGT  933
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256  ATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCTGCGGGAACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGT  1329

Query  934  GACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGCTTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCA  1007
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  GACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGCTTTGCTCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCA  1403

Query 1008  GTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAAGCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTG  1081
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  GTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAAGCCGGCTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTG  1477

Query 1082  ACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCCACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCA  1155
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  ACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCCACTGTCCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCA  1551

Query 1156  CCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCATGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTG  1229
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  CCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCATGTCCCACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTG  1625

Query 1230  GGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCAGGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACT  1303
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  GGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCAGGTGGTGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACT  1699

Query 1304  GCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAGGGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAG  1377
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  GCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAGGGAGGGATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAG  1773

Query 1378  GGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCAGTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGT  1451
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  GGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCAGTGGACTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGT  1847

Query 1452  GACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCTGGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCA  1525
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  GACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCTGGACCTGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCA  1921

Query 1526  CCCAGTGTGGACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCTGCAGGAAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGC  1599
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  CCCAGTGTGGACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCTGCAGGAAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGC  1995

Query 1600  CTGACTGCCTGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAACCATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACC  1673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  CTGACTGCCTGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAACCATAACTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACC  2069

Query 1674  CTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAGTGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCC  1747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  CTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAGTGGCCCTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCC  2143

Query 1748  TGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCCCAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTC  1821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144  TGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCCCAGGGGCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTC  2217

Query 1822  CCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGAAGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCC  1895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218  CCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGAAGGGACCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCC  2291

Query 1896  ACACAGGGACCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGAGTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCC  1969
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292  ACACAGGGACCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGAGTTGGGCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCC  2365

Query 1970  TGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTGAGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCA-  2042
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 2366  TGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTGAGAAGCCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCAA  2439

Query 2043  --AGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG  2076
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440  GCAGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG  2475