Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12695
- Subject:
- XR_937151.1
- Aligned Length:
- 2582
- Identities:
- 1977
- Gaps:
- 605
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 GAAGGCGGCGGCCTGAGGCTGCACCGGGCACGGGTCGGCCGCAATCCAGCCTGGGCGGAGCCGGAGTTGCGAGC 74
Query 1 ------------------------------ATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCT 44
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGCTGCCTAGAGGCCGAGGAGCTCACAGCTATGGGCTGGAGGCCCCGGAGAGCTCGGGGGACCCCGTTGCTGCT 148
Query 45 GCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGTGCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAG 118
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCTGCTACTACTGCTGCTGCTCTGGCCAGTGCCAGGCGCCGGGGTGCTTCAAGGACATATCCCTGGGCAGCCAG 222
Query 119 TCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAACCCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGAC 192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCACCCCGCACTGGGTCCTGGATGGACAACCCTGGCGCACCGTCAGCCTGGAGGAGCCGGTCTCGAAGCCAGAC 296
Query 193 ATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGCCAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGC 266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATGGGGCTGGTGGCCCTGGAGGCTGAAGGCCAGGAGCTCCTGCTTGAGCTGGAGAAGAACCACAGGCTGCTGGC 370
Query 267 CCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCCAGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACAC-------- 332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCAGGATACATAGAAACCCACTACGGCCCAGATGGGCAGCCAGTGGTGCTGGCCCCCAACCACACGGTGAGAT 444
Query 333 -------------------------------GGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCCCCGAC 375
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCTTCCATGGGCTCTGGGATGCACCGCCAGAGGATCATTGCCACTACCAAGGGCGAGTAAGGGGCTTCCCCGAC 518
Query 376 TCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGGATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTATTATCT 449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCCTGGGTAGTCCTCTGCACCTGCTCTGGGATGAGTGGCCTGATCACCCTCAGCAGGAATGCCAGCTATTATCT 592
Query 450 GCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGACTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCTCACCT 523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCGTCCCTGGCCACCCCGGGGCTCCAAGGACTTCTCAACCCACGAGATCTTTCGGATGGAGCAGCTGCTCACCT 666
Query 524 GGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTGGGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCCAGAGC 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAAAGGAACCTGTGGCCACAGGGATCCTGGGAACAAAGCGGGCATGACCAGCCTTCCTGGTGGTCCCCAGAGC 740
Query 598 AGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGGAAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTGTTCTT 671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGGGGCAGGCGAGAAGCGCGCAGGACCCGGAAGTACCTGGAACTGTACATTGTGGCAGACCACACCCTGTTCTT 814
Query 672 GACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAAACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCTTCTCA 745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GACTCGGCACCGAAACTTGAACCACACCAAACAGCGTCTCCTGGAAGTCGCCAACTACGTGGACCAGCTTCTCA 888
Query 746 GGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCGGCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACC----------------- 802
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGACTCTGGACATTCAGGTGGCGCTGACCGGCCTGGAGGTGTGGACCGAGCGGGACCGCAGCCGCGTCACGCAG 962
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 963 GACGCCAACGCCACGCTCTGGGCCTTCCTGCAGTGGCGCCGGGGGCTGTGGGCGCAGCGGCCCCACGACTCCGC 1036
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 1037 GCAGCTGCTCACGGGCCGCGCCTTCCAGGGCGCCACAGTGGGCCTGGCGCCCGTCGAGGGCATGTGCCGCGCCG 1110
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 1111 AGAGCTCGGGAGGCGTGAGCACGGACCACTCGGAGCTCCCCATCGGCGCCGCAGCCACCATGGCCCATGAGATC 1184
Query 803 -------------------------------------------------------------------------- 802
Sbjct 1185 GGCCACAGCCTCGGCCTCAGCCACGACCCCGACGGCTGCTGCGTGGAGGCTGCGGCCGAGTCCGGAGGCTGCGT 1258
Query 803 -----------------------------------------------GCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGCCTTCT 829
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CATGGCTGCGGCCACCGGGCACCCGTTTCCGCGCGTGTTCAGCGCCTGCAGCCGCCGCCAGCTGCGCGCCTTCT 1332
Query 830 TCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCTGCGGG 903
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TCCGCAAGGGGGGCGGCGCTTGCCTCTCCAATGCCCCGGACCCCGGACTCCCGGTGCCGCCGGCGCTCTGCGGG 1406
Query 904 AACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGCTTTGC 977
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AACGGCTTCGTGGAAGCGGGCGAGGAGTGTGACTGCGGCCCTGGCCAGGAGTGCCGCGACCTCTGCTGCTTTGC 1480
Query 978 TCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAAGCCGG 1051
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TCACAACTGCTCGCTGCGCCCGGGGGCCCAGTGCGCCCACGGGGACTGCTGCGTGCGCTGCCTGCTGAAGCCGG 1554
Query 1052 CTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCCACTGT 1125
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CTGGAGCGCTGTGCCGCCAGGCCATGGGTGACTGTGACCTCCCTGAGTTTTGCACGGGCACCTCCTCCCACTGT 1628
Query 1126 CCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCATGTCC 1199
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CCCCCAGACGTTTACCTACTGGACGGCTCACCCTGTGCCAGGGGCAGTGGCTACTGCTGGGATGGCGCATGTCC 1702
Query 1200 CACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCAGGTGG 1273
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CACGCTGGAGCAGCAGTGCCAGCAGCTCTGGGGGCCTGGCTCCCACCCAGCTCCCGAGGCCTGTTTCCAGGTGG 1776
Query 1274 TGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAGGGAGG 1347
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGAACTCTGCGGGAGATGCTCATGGAAACTGCGGCCAGGACAGCGAGGGCCACTTCCTGCCCTGTGCAGGGAGG 1850
Query 1348 GATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCAGTGGA 1421
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GATGCCCTGTGTGGGAAGCTGCAGTGCCAGGGTGGAAAGCCCAGCCTGCTCGCACCGCACATGGTGCCAGTGGA 1924
Query 1422 CTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCTGGACC 1495
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 CTCTACCGTTCACCTAGATGGCCAGGAAGTGACTTGTCGGGGAGCCTTGGCACTCCCCAGTGCCCAGCTGGACC 1998
Query 1496 TGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTGGACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCTGCAGG 1569
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TGCTTGGCCTGGGCCTGGTAGAGCCAGGCACCCAGTGTGGACCTAGAATGGTGTGCCAGAGCAGGCGCTGCAGG 2072
Query 1570 AAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGCCTGACTGCCTGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAACCATAA 1643
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 AAGAATGCCTTCCAGGAGCTTCAGCGCTGCCTGACTGCCTGCCACAGCCACGGGGTTTGCAATAGCAACCATAA 2146
Query 1644 CTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAGTGGCC 1717
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 CTGCCACTGTGCTCCAGGCTGGGCTCCACCCTTCTGTGACAAGCCAGGCTTTGGTGGCAGCATGGACAGTGGCC 2220
Query 1718 CTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCCCAGGG 1791
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CTGTGCAGGCTGAAAACCATGACACCTTCCTGCTGGCCATGCTCCTCAGCGTCCTGCTGCCTCTGCTCCCAGGG 2294
Query 1792 GCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGAAGGGA 1865
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GCCGGCCTGGCCTGGTGTTGCTACCGACTCCCAGGAGCCCATCTGCAGCGATGCAGCTGGGGCTGCAGAAGGGA 2368
Query 1866 CCCTGCGTGCAGTGGCCCCAAAGATGGCCCACACAGGGACCACCCCCTGGGCGGCGTTCACCCCATGGAGTTGG 1939
||||||||||||
Sbjct 2369 CCCTGCGTGCAG-------------------------------------------------------------- 2380
Query 1940 GCCCCACAGCCACTGGACAGCCCTGGCCCCTGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTGAGAAG 2013
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2381 ------------------------------TGGACCCTGAGAACTCTCATGAGCCCAGCAGCCACCCTGAGAAG 2424
Query 2014 CCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCA---AGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTGCCTCTGG 2076
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2425 CCTCTGCCAGCAGTCTCGCCTGACCCCCAAGCAGATCAAGTCCAGATGCCAAGATCCTG------- 2483