Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12714
• Subject: NM_001288750.2
• Aligned Length: 1275
• Identities: 1237
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ATGATTGATGTTTCTCAGGCGGTGTGCTGGCGTTCCATGCGACGTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCT  74
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------ATGCGACGTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCT  38

Query   75  GCTGGCCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTATCTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   39  GCTGGCCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTATCTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCG  112

Query  149  GGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGCCAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  113  GGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGCCAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTT  186

Query  223  CCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGCTGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  187  CCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGCTGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTG  260

Query  297  GCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTGCAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  261  GCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTGCAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGAC  334

Query  371  TCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAACAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  335  TCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAACAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCT  408

Query  445  AGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACAACTGCACTTCTGGTCAAGTTGTTTCCCTCAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  409  AGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACAACTGCACTTCTGGTCAAGTTGTTTCCCTCAG  482

Query  519  ATGCTCTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTTGGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTGGGCGCTGGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  483  ATGCTCTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTTGGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTGGGCGCTGGC  556

Query  593  CGTGGCAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGGGGGCTCTGTGCTAGCGCCACGCTGGGTGGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  557  CGTGGCAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGGGGGCTCTGTGCTAGCGCCACGCTGGGTGGTG  630

Query  667  ACTGCTGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGTCCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  ACTGCTGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGTCCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAG  704

Query  741  CCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGGATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  705  CCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGGATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGA  778

Query  815  ATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCTCAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  779  ATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCTCAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGC  852

Query  889  CTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCTGGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  853  CTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCTGGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAG  926

Query  963  CCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCCCTGCTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTT  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  927  CCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCCTTGTTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTT  1000

Query 1037  GCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGGCTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1001  GCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGGCTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAG  1074

Query 1111  GGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACATGGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1075  GGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACATGGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCG  1148

Query 1185  TGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTAGCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1149  TGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTAGCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTG  1222

Query 1259  CTCAGGACTCCCTCCTC  1275
            |||||||||||||||||
Sbjct 1223  CTCAGGACTCCCTCCTC  1239