Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12714
- Subject:
- NM_001288751.1
- Aligned Length:
- 1344
- Identities:
- 1272
- Gaps:
- 69
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------------------ATGAT 5
|||||
Sbjct 1 ATGACAGGGTGGGGACAGTGGAGGGCAATCATCCTACATTCCCCGGATCCTCCTTGGGGTCAGCCCCACATGAT 74
Query 6 TGATGTTTCTCAGGCGGTGTGCTGGCGTTCCATGCGACGTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCTGCTGG 79
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGATGTTTCTCAGGCAGTGTGCTGGCGTTCCATGCGACGTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCTGCTGG 148
Query 80 CCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTATCTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCGGGACC 153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTATCTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCGGGACC 222
Query 154 TTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGCCAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTTCCCAA 227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGCCAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTTCCCAA 296
Query 228 AACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGCTGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTGGCTCC 301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGCTGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTGGCTCC 370
Query 302 TGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTGCAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGACTCACT 375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTGCAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGACTCACT 444
Query 376 CACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAACAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCTAGACT 449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAACAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCTAGACT 518
Query 450 GGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACAACTGCACTTCTGGTCAAGTTGTTTCCCTCAGATGCT 523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACAACTGCACTTCTGGTCAAGTTGTTTCCCTCAGATGCT 592
Query 524 CTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTTGGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTGGGCGCTGGCCGTGG 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTTGGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTGGGCGCTGGCCGTGG 666
Query 598 CAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGGGGGCTCTGTGCTAGCGCCACGCTGGGTGGTGACTGC 671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGGGGGCTCTGTGCTAGCGCCACGCTGGGTGGTGACTGC 740
Query 672 TGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGTCCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAGCCACA 745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGTCCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAGCCACA 814
Query 746 GTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGGATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGAATCAT 819
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGGATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGAATCAT 888
Query 820 GACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCTCAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGCCTGCC 893
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCTCAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGCCTGCC 962
Query 894 GGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCTGGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAGCCATA 967
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCTGGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAGCCATA 1036
Query 968 CTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCCCTGCTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTTGCGTG 1041
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCCTTGTTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTTGCGTG 1110
Query 1042 TACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGGCTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAGGGAGA 1115
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGGCTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAGGGAGA 1184
Query 1116 TAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACATGGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCGTGGCT 1189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACATGGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCGTGGCT 1258
Query 1190 GCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTAGCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTGCTCAG 1263
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTAGCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTGCTCAG 1332
Query 1264 GACTCCCTCCTC 1275
||||||||||||
Sbjct 1333 GACTCCCTCCTC 1344