Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12714
• Subject: NM_030770.4
• Aligned Length: 1380
• Identities: 1263
• Gaps: 114

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCCTGATGCTGGATGACCAACCCCCTATGGAGGCCCAGTATGCAGAGGAGGGCCCAGGACCTGGGATCTT  74

Query    1  -------------------------------ATGATTGATGTTTCTCAGGCGGTGTGCTGGCGTTCCATGCGAC  43
                                           |         ||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGAGCAGAGCCTGGAGACCAGCAGCATCCCA---------TTTCTCAGGCAGTGTGCTGGCGTTCCATGCGAC  139

Query   44  GTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCTGCTGGCCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTAT  117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  140  GTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCTGCTGGCCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTAT  213

Query  118  CTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCGGGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGC  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  CTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCGGGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGC  287

Query  192  CAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTTCCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGC  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  CAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTTCCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGC  361

Query  266  TGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTGGCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTG  339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  TGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTGGCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTG  435

Query  340  CAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGACTCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAA  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  CAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGACTCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAA  509

Query  414  CAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCTAGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACA  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  510  CAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCTAGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACA  583

Query  488  ACTGCACTTCTGGTCAAGTTGTTTCCCTCAGATGCTCTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTT  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  584  ACTGCACTTCTGGTCAAGTTGTTTCCCTCAGATGCTCTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTT  657

Query  562  GGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTGGGCGCTGGCCGTGGCAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGG  635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  658  GGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTGGGCGCTGGCCGTGGCAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGG  731

Query  636  GGGCTCTGTGCTAGCGCCACGCTGGGTGGTGACTGCTGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGT  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  732  GGGCTCTGTGCTAGCGCCACGCTGGGTGGTGACTGCTGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGT  805

Query  710  CCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAGCCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGG  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  806  CCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAGCCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGG  879

Query  784  ATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGAATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCT  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  ATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGAATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCT  953

Query  858  CAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGCCTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCT  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  954  CAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGCCTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCT  1027

Query  932  GGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAGCCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCC  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1028  GGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAGCCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCC  1101

Query 1006  CTGCTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTTGCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGG  1079
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1102  TTGTTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTTGCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGG  1175

Query 1080  CTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAGGGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACAT  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1176  CTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAGGGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACAT  1249

Query 1154  GGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCGTGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTA  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250  GGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCGTGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTA  1323

Query 1228  GCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTGCTCAGGACTCCCTCCTC  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  GCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTGCTCAGGACTCCCTCCTC  1371