Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12714
- Subject:
- NR_110046.2
- Aligned Length:
- 1997
- Identities:
- 1221
- Gaps:
- 753
Alignment
Query 1 ATGATTGATGTTT-CTCAGGCGGTGTGCTGGCGTTCCATGCGA--CGTGGCTGTGCAGTG-CTGGGAG-CCCTG 69
|..||| .||| .|||||| |.||.|| .|..||.|..||.|| ||.|.|| |||||
Sbjct 1 -------AGCTTTAATCA------ATGCTGG-----CCTGAGAACAGGAGCGGAACATTGCCTAGTAGACCCTG 56
Query 70 GGGCTGCTGGC--CGGTGCAGGTGTTGGCTCA-TGGCTCCTA-GTGCTGTATCTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGC 139
.|||| |..| |.|||| || ||.|.|||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 57 AGGCT--TTACAACAGTGC-----------CACTGACCCCTATGTGCTGTATCTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGC 117
Query 140 CCATTTCCGGGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGCCAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTC 213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 CCATTTCCGGGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGCCAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTC 191
Query 214 CCTGCACTTCCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGCTGGAAGCGCAAGTGAGGGATCA 287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192 CCTGCACTTCCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGCTGGAAGCGCAAGTGAGGGATCA 265
Query 288 GCCACGCTGGCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTGCAGATCTGCTGGAGCCTTGGGC 361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 GCCACGCTGGCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTGCAGATCTGCTGGAGCCTTGGGC 339
Query 362 ATCTCAGACTCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAACAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAG 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 340 ATCTCAGACTCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAACAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAG 413
Query 436 CTCTCTCCTAGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACAACTGCACTTCTGGTCAAGTTGT 509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 CTCTCTCCTAGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACAACTGCACTTCTGGTCAAGTTGT 487
Query 510 TTCCCTCAGATGCTCTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTTGGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTG 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 TTCCCTCAGATGCTCTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTTGGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTG 561
Query 584 GGCGCTGGCCGTGGCAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGGGGGCTCTGTGCTAGCGCCACGC 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562 GGCGCTGGCCGTGGCAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGGGGGCTCTGTGCTAGCGCCACGC 635
Query 658 TGGGTGGTGACTGCTGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGTCCAGCTGGCGGGTTCATGCGGG 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 636 TGGGTGGTGACTGCTGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGTCCAGCTGGCGGGTTCATGCGGG 709
Query 732 GCTGGTCAGCCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGGATTATCCCACACCCCCTCTACA 805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 710 GCTGGTCAGCCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGGATTATCCCACACCCCCTCTACA 783
Query 806 GTGCCCAGAATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCTCAACTTCTCAGACACTGTGGGC 879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 GTGCCCAGAATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCTCAACTTCTCAGACACTGTGGGC 857
Query 880 GCTGTGTGCCTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCTGGGTGTCTGGCTGGGGCCACAC 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 858 GCTGTGTGCCTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCTGGGTGTCTGGCTGGGGCCACAC 931
Query 954 CCACCCTAGCCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCCCTGCTCAGCACTCAGCTCTGCA 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 932 CCACCCTAGCCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCCTTGTTCAGCACTCAGCTCTGCA 1005
Query 1028 ACAGCTCTTGCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGGCTACCTGGACGGAAGGGCTGAT 1101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006 ACAGCTCTTGCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGGCTACCTGGACGGAAGGGCTGAT 1079
Query 1102 GCATGCCAGGGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACATGGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAG 1175
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 GCATGCCAGGGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACATGGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAG 1153
Query 1176 CTGGGGGCGTGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTAGCTGAGTTTCTGGACTGGATCC 1249
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154 CTGGGGGCGTGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTAGCTGAGTTTCTGGACTGGATCC 1227
Query 1250 ATGACACTGCTCAGGACTCCCTCCTC------------------------------------------------ 1275
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228 ATGACACTGCTCAGGACTCCCTCCTCTGAGTCCTGCTGTTTCCTCCAGTCTCACTGCACACCACTGCCTCATGC 1301
Query 1276 -------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1302 TTCCTGGGGCCTCCAGCAGCTCCACTAATGGAGGAGAGGCAGTAGCCTCCGACACAGAACGCATGGACCTCCTA 1375
Query 1276 -------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1376 CTACTGTGTGTGAGGAACAGTCACTACCCACTGGCCAGCCACCCAGCCAACAGGTCTCTCCTCTTGGGCCCTGA 1449
Query 1276 -------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1450 TTTCAGAGTCCTCTTTCTCACTAGAGACTCAATGACAGAAGAGAGGCTGGGACTTGGTTGGGCATGCTGTGGTT 1523
Query 1276 -------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1524 GCTGAGGGATGAGGGGGAGGAGAGAGGTAGGAGCTGGAGATGAAGAGGCTGCTAGAAGCAGCAGGAAGCCTGCC 1597
Query 1276 -------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1598 CTTCTGCCCTCTCCCCTCCCTGCCCCTGTGTGAGTCTTTTGGGAGGGTGCTGGGAGGTGCCCCCCGTCCCACCT 1671
Query 1276 -------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1672 TTTTCCTGTGCTCTAGGTGGGCTAAGTGCCTCCCTAGAGGACTCCATGGCTGAGAGGCTCCTGGGCAGATGGGG 1745
Query 1276 -------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1746 TCAAGGCTGGGCCAGCCCAGATGAAGCCTATGGGAGTCAGGACCCTCTCCACTCTCCCTCTCCACTCCCCTTCC 1819
Query 1276 -------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1820 TGTTCTCACCTGGCTGTGGCTGGCCCTGTGTGGGGTGGGTACACTGGAAAACAAGAAGGTTGGAGTTGGTCTAG 1893
Query 1276 ------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1894 GACATTGGTTTTAAATGACAGTTCTGTGAACTGGTCCAAGGAGTTCTGTTATTAAAGTGATATATGGTCTTGG 1966
