Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12714
- Subject:
- NR_110047.2
- Aligned Length:
- 1868
- Identities:
- 1165
- Gaps:
- 648
Alignment
Query 1 ATGATTGATGTTT-CTCAGGCGGTGTGCTGGCGTTCCATGCGA--CGTGGCTGTGCAGTG-CTGGGAG-CCCTG 69
|..||| .||| .|||||| |.||.|| .|..||.|..||.|| ||.|.|| |||||
Sbjct 1 -------AGCTTTAATCA------ATGCTGG-----CCTGAGAACAGGAGCGGAACATTGCCTAGTAGACCCTG 56
Query 70 GGGCTGCTGGC--CGGTGCAGGTGTTGGCTCA-TGGCTCCTA-GTGCTGTATCTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGC 139
.|||| |..| |.|||| || ||.|.|||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 57 AGGCT--TTACAACAGTGC-----------CACTGACCCCTATGTGCTGTATCTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGC 117
Query 140 CCATTTCCGGGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGCCAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTC 213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 118 CCATTTCCGGGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGCCAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTC 191
Query 214 CCTGCACTTCCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGCTGGAAGCGCAAGTGAGGGATCA 287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192 CCTGCACTTCCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGCTGGAAGCGCAAGTGAGGGATCA 265
Query 288 GCCACGCTGGCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTGCAGATCTGCTGGAGCCTTGGGC 361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 GCCACGCTGGCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTGCAGATCTGCTGGAGCCTTGGGC 339
Query 362 ATCTCAGACTCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAACAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAG 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 340 ATCTCAGACTCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAACAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAG 413
Query 436 CTCTCTCCTAGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACAACTGCACTTCTGGTCAAGTTGT 509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 CTCTCTCCTAGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACAACTGCACTTCTGGTCAAGTTGT 487
Query 510 TTCCCTCAGATGCTCTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTTGGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTG 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 TTCCCTCAGATGCTCTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTTGGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTG 561
Query 584 GGCGCTGGCCGTGGCAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGGGGGCTCTGTGCTAGCGCCACGC 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562 GGCGCTGGCCGTGGCAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGGGGGCTCTGTGCTAGCGCCACGC 635
Query 658 TGGGTGGTGACTGCTGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGTCCAGCTGGCGGGTTCATGCGGG 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 636 TGGGTGGTGACTGCTGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGTCCAGCTGGCGGGTTCATGCGGG 709
Query 732 GCTGGTCAGCCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGGATTATCCCACACCCCCTCTACA 805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 710 GCTGGTCAGCCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGGATTATCCCACACCCCCTCTACA 783
Query 806 GTGCCCAGAATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCTCAACTTCTCAGACACTGTGGGC 879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 GTGCCCAGAATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCTCAACTTCTCAGACACTGTGGGC 857
Query 880 GCTGTGTGCCTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCTGGGTGTCTGGCTGGGGCCACAC 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 858 GCTGTGTGCCTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCTGGGTGTCTGGCTGGGGCCACAC 931
Query 954 CCACCCTAGCCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCCCTGCTCAGCACTCAGCTCTGCA 1027
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 932 CCACCCTAGCCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCCTTGTTCAGCACTCAGCTCTGCA 1005
Query 1028 ACAGCTCTTGCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGGCTACCTGGACGGAAGGGCTGAT 1101
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006 ACAGCTCTTGCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGGCTACCTGGACGGAAGGGCTGAT 1079
Query 1102 GCATGCCAGG------------GAGAT---------------AG-----------------------------C 1119
|||||||||| ||| | || |
Sbjct 1080 GCATGCCAGGACTCCCTCCTCTGAG-TCCTGCTGTTTCCTCCAGTCTCACTGCACACCACTGCCTCATGCTTCC 1152
Query 1120 GGGGGC-----------CCCCTAGTG-------------TGCC-------CAGATGGGGACACATGG-----CG 1157
.||||| ||.|||.|| .||| |||| ||.||||| |.
Sbjct 1153 TGGGGCCTCCAGCAGCTCCACTAATGGAGGAGAGGCAGTAGCCTCCGACACAGA-----ACGCATGGACCTCCT 1221
Query 1158 CCTAGTGGGGGTG-------GTCAGCTGGGGGCGTGGCTGCGCAGAGCCCAATCACC-------CAGGTGTCTA 1217
.|||.||.|.||| |||| ||.|.||..|.|||..|||| |||||.|||.
Sbjct 1222 ACTACTGTGTGTGAGGAACAGTCA-------------CTACCCACTGGCCAGCCACCCAGCCAACAGGTCTCTC 1282
Query 1218 C------GCCAAGGTAGCTGAG-----TTTCTGGACTGGA---TCCATGACA---------CTGCTCAGGACT- 1267
| |||..|.|..|.||| ||||| .|||.|| ||.|||||| ||| |||||
Sbjct 1283 CTCTTGGGCCCTGATTTCAGAGTCCTCTTTCT-CACTAGAGACTCAATGACAGAAGAGAGGCTG----GGACTT 1351
Query 1268 ------CCCTCCTC------------------------------------------------------------ 1275
.|.|.||.
Sbjct 1352 GGTTGGGCATGCTGTGGTTGCTGAGGGATGAGGGGGAGGAGAGAGGTAGGAGCTGGAGATGAAGAGGCTGCTAG 1425
Query 1276 -------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1426 AAGCAGCAGGAAGCCTGCCCTTCTGCCCTCTCCCCTCCCTGCCCCTGTGTGAGTCTTTTGGGAGGGTGCTGGGA 1499
Query 1276 -------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1500 GGTGCCCCCCGTCCCACCTTTTTCCTGTGCTCTAGGTGGGCTAAGTGCCTCCCTAGAGGACTCCATGGCTGAGA 1573
Query 1276 -------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1574 GGCTCCTGGGCAGATGGGGTCAAGGCTGGGCCAGCCCAGATGAAGCCTATGGGAGTCAGGACCCTCTCCACTCT 1647
Query 1276 -------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1648 CCCTCTCCACTCCCCTTCCTGTTCTCACCTGGCTGTGGCTGGCCCTGTGTGGGGTGGGTACACTGGAAAACAAG 1721
Query 1276 -------------------------------------------------------------------------- 1275
Sbjct 1722 AAGGTTGGAGTTGGTCTAGGACATTGGTTTTAAATGACAGTTCTGTGAACTGGTCCAAGGAGTTCTGTTATTAA 1795
Query 1276 ------------------ 1275
Sbjct 1796 AGTGATATATGGTCTTGG 1813
