Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_12717
Subject:
NM_030793.5
Aligned Length:
1113
Identities:
943
Gaps:
170

Alignment

Query    1  MGPRKKSVKTCIMNNEIPEEMTADETKDYMNQLSHEVLCHIFRYLPLQDIMCMECLSRKLKEAVTLYLRVVRVV  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MGPRKKSVKTCIMNNEIPEEMTADETKDYMNQLSHEVLCHIFRYLPLQDIMCMECLSRKLKEAVTLYLRVVRVV  74

Query   75  DLCAGRWWEYMPSGFTDASFLTLLKKMPDVEQLYGLHPRYLERRRVRGHEAFSIPGVLEALQACPNLVGVETSH  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  DLCAGRWWEYMPSGFTDASFLTLLKKMPDVEQLYGLHPRYLERRRVRGHEAFSIPGVLEALQACPNLVGVETSH  148

Query  149  LELVESIWTYMPHVHILGKFRNRNGAFPIPPENKLKIPIGAKIQTLHLVGVNVPEIPCIPMLRHLYMKWVRLTK  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  LELVESIWTYMPHVHILGKFRNRNGAFPIPPENKLKIPIGAKIQTLHLVGVNVPEIPCIPMLRHLYMKWVRLTK  222

Query  223  PQPFKDFLCISLRTFVMRNCAGPTNSLKYVPLVTGLASARNLEHLEMVRVPFLGGLIQHVVEDSWRSGGFRNLH  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  PQPFKDFLCISLRTFVMRNCAGPTNSLKYVPLVTGLASARNLEHLEMVRVPFLGGLIQHVVEDSWRSGGFRNLH  296

Query  297  TIVLGACKNALEVDLGYLIITAARRLHEVRIQPSLTKDGVFSALKMAELEFPQFETLHLGYVDEFLLQSRMANA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TIVLGACKNALEVDLGYLIITAARRLHEVRIQPSLTKDGVFSALKMAELEFPQFETLHLGYVDEFLLQSRMANA  370

Query  371  DLVKYGLADVVENPGIITDIGMKAVNEVFSCIKYLAIYNCPHLHNPYNWISDHSRWTRLVDINLVRCHALKLDS  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  DLVKYGLADVVENPGIITDIGMKAVNEVFSCIKYLAIYNCPHLHNPYNWISDHSRWTRLVDINLVRCHALKLDS  444

Query  445  FGQFIELLPSLEFISLDQMFREPPKGCARVGLSAGTGIGVSSALVSNQNSNNDDNNAQNNNANIHDNNHHHPDD  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  FGQFIELLPSLEFISLDQMFREPPKGCARVGLSAGTGIGVSSALVSNQNSNNDDNNAQNNNANIHDNNHHHPDD  518

Query  519  SDEENDFRQDLQPGEQQFAADALNEMEDIVQEDGEVVAESGNNTPAHSQAIIPVDVDEEQAGPSGLQRVVKPTS  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  SDEENDFRQDLQPGEQQFAADALNEMEDIVQEDGEVVAESGNNTPAHSQAIIPVDVDEEQAGPSGLQRVVKPTS  592

Query  593  ITVHDSESDDEEDSLELQEVWIPKNGTRRYSEREEKTGESVQSRELS---------------------------  639
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  593  ITVHDSESDDEEDSLELQEVWIPKNGTRRYSEREEKTGESVQSRELSVSGKGKTPLRKRYNSHQMGQSKQFPLE  666

Query  640  --------------------------------------------------------------------------  639
                                                                                      
Sbjct  667  ESSCEKGCQVTSEQIKADMKAARDIPEKKKNKDVYPSCSSTTASTVGNSSSHNTASQSPDFVRTVNSGGSSEPS  740

Query  640  ---------------------------------------------------------------------EVAKT  644
                                                                                 |||||
Sbjct  741  PTEVDVSRQCACSPGGSEDSEAMEEGDAESSVCPRCCCHRPQESQRRTSRCSDEERPSTSRACVVNGPDEVAKT  814

Query  645  KPRHAMKRKRTADKSTSTSDPVIEDDHVQVLVLKSKNLVGVTMTNCGITDLVLKDCPKMMFIHATRCRVLKHLK  718
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  KPRHAMKRKRTADKSTSTSDPVIEDDHVQVLVLKSKNLVGVTMTNCGITDLVLKDCPKMMFIHATRCRVLKHLK  888

Query  719  VENAPIVNRFDYAQCKKLNMDQVLDQILRMPPERNRIIYLRPMQQVDTLTLEQKLFSGPYPYHICIIHEFSNPP  792
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  VENAPIVNRFDYAQCKKLNMDQVLDQILRMPPERNRIIYLRPMQQVDTLTLEQKLFSGPYPYHICIIHEFSNPP  962

Query  793  NVRNKVRIRSWMDTIANINQELIKYEFFPEATRSEEDLKKYPKYPWGREIYTLEGVVDGAPYSMISDFPWLRSL  866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  NVRNKVRIRSWMDTIANINQELIKYEFFPEATRSEEDLKKYPKYPWGREIYTLEGVVDGAPYSMISDFPWLRSL  1036

Query  867  RAAEPNSFARYDFEDDEESTIYAPRRKGQLSADICMETIGEEISEMRQMKKGVFQRVVAIFIHYCDVNGEPVED  940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  RAAEPNSFARYDFEDDEESTIYAPRRKGQLSADICMETIGEEISEMRQMKKGVFQRVVAIFIHYCDVNGEPVED  1110

Query  941  DYI  943
            |||
Sbjct 1111  DYI  1113