Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_12717
- Subject:
- XM_006714797.2
- Aligned Length:
- 3438
- Identities:
- 2829
- Gaps:
- 609
Alignment
Query 1 ATGGGGCCACGAAAGAAAAGTGTGAAAACATGTATCATGAATAATGAAATTCCAGAAGAAATGACAGCAGATGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGGGCCACGAAAGAAAAGTGTGAAAACATGTATCATGAATAATGAAATTCCAGAAGAAATGACAGCAGATGA 74
Query 75 AACAAAGGACTATATGAATCAACTTTCACATGAAGTACTTTGCCATATTTTTAGGTACCTCCCTCTGCAGGATA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AACAAAGGACTATATGAATCAACTTTCACATGAAGTACTTTGCCATATTTTTAGGTACCTCCCTCTGCAGGATA 148
Query 149 TCATGTGTATGGAATGTCTTTCCCGGAAGCTAAAGGAAGCAGTGACCCTATATCTGCGAGTTGTGAGAGTTGTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCATGTGTATGGAATGTCTTTCCCGGAAGCTAAAGGAAGCAGTGACCCTATATCTGCGAGTTGTGAGAGTTGTA 222
Query 223 GATCTCTGTGCAGGGCGGTGGTGGGAATACATGCCAAGTGGCTTTACAGATGCCAGTTTTCTAACACTATTAAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GATCTCTGTGCAGGGCGGTGGTGGGAATACATGCCAAGTGGCTTTACAGATGCCAGTTTTCTAACACTATTAAA 296
Query 297 GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTATATGGCCTTCACCCTCGATACCTTGAGAGGCGAAGAGTAAGGGGCCATG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GAAGATGCCAGATGTTGAACAGCTATATGGCCTTCACCCTCGATACCTTGAGAGGCGAAGAGTAAGGGGCCATG 370
Query 371 AGGCTTTTAGCATTCCAGGAGTCCTAGAAGCTTTGCAGGCATGCCCAAACTTAGTGGGTGTGGAAACTTCTCAT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGCTTTTAGCATTCCAGGAGTCCTAGAAGCTTTGCAGGCATGCCCAAACTTAGTGGGTGTGGAAACTTCTCAT 444
Query 445 TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCCCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAATGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTGGAGTTGGTAGAATCCATTTGGACATATATGCCCCATGTTCATATTTTGGGGAAATTTCGTAATCGTAATGG 518
Query 519 AGCTTTTCCAATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATTCCTATAGGAGCCAAAATTCAAACTTTACATTTAGTTG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCTTTTCCAATTCCTCCTGAAAATAAACTGAAAATTCCTATAGGAGCCAAAATTCAAACTTTACATTTAGTTG 592
Query 593 GGGTGAATGTTCCTGAAATTCCTTGTATCCCAATGCTAAGGCACCTTTATATGAAGTGGGTAAGACTCACTAAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GGGTGAATGTTCCTGAAATTCCTTGTATCCCAATGCTAAGGCACCTTTATATGAAGTGGGTAAGACTCACTAAA 666
Query 667 CCACAGCCATTTAAAGACTTCCTTTGTATCAGCTTAAGAACTTTCGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCCACAAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCACAGCCATTTAAAGACTTCCTTTGTATCAGCTTAAGAACTTTCGTCATGAGGAACTGTGCAGGACCCACAAA 740
Query 741 TTCCTTGAAATATGTCCCTTTAGTAACAGGCTTAGCCTCTGCCCGAAACTTGGAACACTTAGAAATGGTTCGAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTCCTTGAAATATGTCCCTTTAGTAACAGGCTTAGCCTCTGCCCGAAACTTGGAACACTTAGAAATGGTTCGAG 814
Query 815 TTCCTTTCCTTGGAGGTCTTATCCAACATGTTGTTGAAGACAGTTGGAGATCAGGTGGTTTTAGAAATTTGCAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTCCTTTCCTTGGAGGTCTTATCCAACATGTTGTTGAAGACAGTTGGAGATCAGGTGGTTTTAGAAATTTGCAC 888
Query 889 ACTATTGTTCTGGGAGCTTGCAAAAATGCTCTTGAAGTAGATCTTGGTTACCTCATCATTACTGCTGCCCGTAG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACTATTGTTCTGGGAGCTTGCAAAAATGCTCTTGAAGTAGATCTTGGTTACCTCATCATTACTGCTGCCCGTAG 962
Query 963 GTTACATGAAGTTCGGATCCAGCCTTCCCTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAGTTGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTTACATGAAGTTCGGATCCAGCCTTCCCTAACCAAAGATGGTGTCTTTTCTGCCCTAAAGATGGCAGAGTTGG 1036
Query 1037 AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTAGGATATGTAGATGAGTTTTTGCTACAGAGCAGAATGGCTAATGCG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGTTTCCCCAGTTTGAAACCCTTCATCTAGGATATGTAGATGAGTTTTTGCTACAGAGCAGAATGGCTAATGCG 1110
Query 1111 GATCTGGTGAAGTATGGTTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATCACTGATATAGGGATGAAAGCAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GATCTGGTGAAGTATGGTTTGGCTGATGTGGTAGAAAATCCTGGTATCATCACTGATATAGGGATGAAAGCAGT 1184
Query 1185 CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTACAATTGCCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAATGAAGTTTTTTCCTGTATCAAATATCTGGCAATTTACAATTGCCCTCATCTACACAACCCATACAATTGGA 1258
Query 1259 TCTCAGACCACTCAAGATGGACTCGATTGGTTGATATCAACCTAGTACGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGACTCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCTCAGACCACTCAAGATGGACTCGATTGGTTGATATCAACCTAGTACGGTGCCATGCTTTGAAGCTGGACTCT 1332
Query 1333 TTTGGCCAGTTTATTGAATTATTACCCAGCCTAGAGTTTATTTCACTGGATCAGATGTTTCGTGAACCACCCAA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 TTTGGCCAGTTTATTGAATTATTACCCAGCCTAGAGTTTATTTCACTGGATCAGATGTTTCGTGAACCACCCAA 1406
Query 1407 GGGTTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGCACAGGAATTGGTGTTTCATCAGCTCTTGTTAGCAACCAGAACT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGTTGTGCTCGAGTTGGTCTGAGTGCAGGCACAGGAATTGGTGTTTCATCAGCTCTTGTTAGCAACCAGAACT 1480
Query 1481 CCAACAATGACGATAATAATGCCCAGAATAACAATGCCAACATCCACGACAACAATCACCATCATCCAGATGAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCAACAATGACGATAATAATGCCCAGAATAACAATGCCAACATCCACGACAACAATCACCATCATCCAGATGAC 1554
Query 1555 TCAGACGAGGAGAATGACTTTCGGCAAGATCTGCAGCCAGGAGAGCAGCAGTTTGCAGCTGACGCATTAAATGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TCAGACGAGGAGAATGACTTTCGGCAAGATCTGCAGCCAGGAGAGCAGCAGTTTGCAGCTGACGCATTAAATGA 1628
Query 1629 GATGGAAGACATCGTCCAAGAAGATGGAGAGGTGGTGGCCGAGAGTGGAAATAATACTCCAGCTCACAGCCAGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GATGGAAGACATCGTCCAAGAAGATGGAGAGGTGGTGGCCGAGAGTGGAAATAATACTCCAGCTCACAGCCAGG 1702
Query 1703 CAATTATTCCTGTGGATGTTGATGAGGAACAAGCAGGACCCAGTGGTCTTCAGCGTGTAGTAAAACCAACCTCA 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CAATTATTCCTGTGGATGTTGATGAGGAACAAGCAGGACCCAGTGGTCTTCAGCGTGTAGTAAAACCAACCTCA 1776
Query 1777 ATTACTGTTCATGATTCAGAGAGTGATGATGAAGAAGATAGTCTAGAACTCCAAGAAGTCTGGATTCCTAAGAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATTACTGTTCATGATTCAGAGAGTGATGATGAAGAAGATAGTCTAGAACTCCAAGAAGTCTGGATTCCTAAGAA 1850
Query 1851 CGGTACTCGGCGTTACTCTGAACGTGAAGAAAAAACTGGAGAGTCAGTGCAGTCCAGAGAATTGT--------- 1915
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CGGTACTCGGCGTTACTCTGAACGTGAAGAAAAAACTGGAGAGTCAGTGCAGTCCAGAGAATTGTCAGTAAGTG 1924
Query 1916 -------------------------------------------------------------------------- 1915
Sbjct 1925 GAAAAGGCAAGACTCCACTTCGAAAGAGGTACAACTCCCATCAGATGGGCCAGTCGAAGCAGTTTCCCCTCGAG 1998
Query 1916 -------------------------------------------------------------------------- 1915
Sbjct 1999 GAAAGCAGCTGTGAGAAAGGCTGTCAGGTCACCAGTGAGCAGATCAAAGCCGATATGAAAGCAGCTAGGGATAT 2072
Query 1916 -------------------------------------------------------------------------- 1915
Sbjct 2073 TCCTGAAAAGAAAAAAAACAAGGATGTTTATCCCAGCTGCAGCAGCACCACCGCCAGCACAGTGGGAAACTCCA 2146
Query 1916 -------------------------------------------------------------------------- 1915
Sbjct 2147 GCTCACACAACACTGCTTCTCAAAGCCCCGACTTTGTAAGGACGGTGAACAGCGGCGGCTCTTCCGAGCCTAGC 2220
Query 1916 -------------------------------------------------------------------------- 1915
Sbjct 2221 CCTACAGAAGTGGATGTGTCCAGGCAGTGTGCCTGCTCCCCCGGTGGGTCAGAGGACTCTGAGGCCATGGAGGA 2294
Query 1916 -------------------------------------------------------------------------- 1915
Sbjct 2295 GGGAGATGCAGAGAGTTCTGTCTGCCCCAGATGCTGCTGTCACAGGCCCCAGGAATCCCAAAGGAGAACTAGCA 2368
Query 1916 -------------------------------------------------------------------------- 1915
Sbjct 2369 GGTGTTCTGATGAGGAACGTCCTTCAACCAGCCGAGCCTGTGTTGTGAATGGCCCGGATGGTACGAGATCCGCC 2442
Query 1916 -------------------------------------------------------------------------- 1915
Sbjct 2443 TTTTCCTTTAGGACTCTGCCACAAGGGGGGTCTTCAGGCCCAGCACATGATGAGAGGACTAATGGGAGTGGCTC 2516
Query 1916 --------CAGAAGTAGCCAAAACAAAGCCACGTCACGCCATGAAACGGAAGCGGACAGCAGATAAATCCACTA 1981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TGGGGCTACAGAAGTAGCCAAAACAAAGCCACGTCACGCCATGAAACGGAAGCGGACAGCAGATAAATCCACTA 2590
Query 1982 GTACAAGTGATCCTGTGATCGAGGATGACCATGTGCAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAGAATCTTGTTGGAGTC 2055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 GTACAAGTGATCCTGTGATCGAGGATGACCATGTGCAGGTTCTTGTATTAAAATCCAAGAATCTTGTTGGAGTC 2664
Query 2056 ACTATGACCAATTGTGGAATCACAGATCTAGTGCTAAAAGACTGTCCAAAGATGATGTTCATCCATGCTACCAG 2129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 ACTATGACCAATTGTGGAATCACAGATCTAGTGCTAAAAGACTGTCCAAAGATGATGTTCATCCATGCTACCAG 2738
Query 2130 GTGCAGGGTACTAAAACATTTAAAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAGA 2203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GTGCAGGGTACTAAAACATTTAAAGGTAGAAAATGCACCAATTGTAAACCGATTTGACTATGCACAGTGCAAGA 2812
Query 2204 AACTGAACATGGATCAGGTACTAGACCAGATACTAAGAATGCCACCCGAGAGAAACCGCATCATATACCTACGC 2277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 AACTGAACATGGATCAGGTACTAGACCAGATACTAAGAATGCCACCCGAGAGAAACCGCATCATATACCTACGC 2886
Query 2278 CCAATGCAGCAGGTGGACACTCTAACTTTGGAGCAGAAGCTATTTAGTGGTCCCTACCCCTATCACATCTGTAT 2351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 CCAATGCAGCAGGTGGACACTCTAACTTTGGAGCAGAAGCTATTTAGTGGTCCCTACCCCTATCACATCTGTAT 2960
Query 2352 TATCCATGAATTCAGTAACCCTCCCAATGTCCGGAATAAGGTGCGCATTCGCAGCTGGATGGACACTATAGCAA 2425
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 TATCCATGAATTCAGTAACCCTCCCAATGTCCGGAATAAGGTGCGCATTCGCAGCTGGATGGACACTATAGCAA 3034
Query 2426 ACATCAATCAAGAGCTCATTAAATATGAATTCTTCCCTGAAGCCACTCGAAGTGAAGAAGACTTAAAGAAATAC 2499
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 ACATCAATCAAGAGCTCATTAAATATGAATTCTTCCCTGAAGCCACTCGAAGTGAAGAAGACTTAAAGAAATAC 3108
Query 2500 CCCAAGTACCCCTGGGGGAGAGAAATCTATACTTTAGAAGGTGTTGTGGATGGAGCTCCATATTCCATGATTTC 2573
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 CCCAAGTACCCCTGGGGGAGAGAAATCTATACTTTAGAAGGTGTTGTGGATGGAGCTCCATATTCCATGATTTC 3182
Query 2574 TGACTTCCCTTGGCTGAGGTCATTACGAGCTGCAGAGCCCAACAGCTTCGCTCGATACGACTTTGAAGACGATG 2647
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 TGACTTCCCTTGGCTGAGGTCATTACGAGCTGCAGAGCCCAACAGCTTCGCTCGATACGACTTTGAAGACGATG 3256
Query 2648 AAGAAAGCACTATCTATGCTCCTAGAAGGAAAGGACAGCTGTCTGCAGACATCTGTATGGAAACAATAGGAGAG 2721
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 AAGAAAGCACTATCTATGCTCCTAGAAGGAAAGGACAGCTGTCTGCAGACATCTGTATGGAAACAATAGGAGAG 3330
Query 2722 GAAATTTCAGAGATGCGTCAGATGAAGAAGGGTGTATTTCAGCGAGTAGTGGCAATTTTTATCCACTATTGTGA 2795
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GAAATTTCAGAGATGCGTCAGATGAAGAAGGGTGTATTTCAGCGAGTAGTGGCAATTTTTATCCACTATTGTGA 3404
Query 2796 TGTCAATGGAGAGCCAGTTGAAGATGACTACATT 2829
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 TGTCAATGGAGAGCCAGTTGAAGATGACTACATT 3438