Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12840
• Subject: XM_017020039.1
• Aligned Length: 1050
• Identities: 878
• Gaps: 171

Alignment

Query    1  ATGATAGACCACTTATCTAGGGCTGTCATCAGTGATCCAGAGCAAAATTTAGCCATTGAGCAAAAAGAAAGTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATAGACCACTTATCTAGGGCTGTCATCAGTGATCCAGAGCAAAATTTAGCCATTGAGCAAAAAGAAAGTGA  74

Query   75  TCATATCCTTCCAGATTCAAAGATGACACCTCTTCGATTTAGAAAAAGAACACTACATGAAACAAAGATAAGAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCATATCCTTCCAGATTCAAAGATGACACCTCTTCGATTTAGAAAAAGAACACTACATGAAACAAAGATAAGAA  148

Query  149  CTCATTCTACATTAACTGAAAATGTGCTTTCTCATAAATTACAGTTTGATGGTAGGATCGTATCACGAACAAAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCATTCTACATTAACTGAAAATGTGCTTTCTCATAAATTACAGTTTGATGGTAGGATCGTATCACGAACAAAT  222

Query  223  GTGCTTCCTTTTATTCAAAAAAGCATTTATAGTCATCAGTGTGGACGAAGAAAAGGAAAACAATACCGACTTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGCTTCCTTTTATTCAAAAAAGCATTTATAGTCATCAGTGTGGACGAAGAAAAGGAAAACAATACCGACTTGG  296

Query  297  TGATTTTTATGTTGGTGCAACCTTGACATTTTTGAGTTCTGATCATCTCAGCCTTCCAGAAAGCATCAAAGAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGATTTTTATGTTGGTGCAACCTTGACATTTTTGAGTTCTGATCATCTCAGCCTTCCAGAAAGCATCAAAGAAA  370

Query  371  ACACATTACTTAAACTCCGAATCACAAATATTGATCAAATAGCTTTGGATTCTCTCAAAACTGCTTCTATGGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACACATTACTTAAACTCCGAATCACAAATATTGATCAAATAGCTTTGGATTCTCTCAAAACTGCTTCTATGGAA  444

Query  445  CAGGAGGATGATATAATCATTCAAGAAACCAATGATAGGCTGGTCTTCAAAGCAATTCAAGATGTGCTAAAAGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGGAGGATGATATAATCATTCAAGAAACCAATGATAGGCTGGTCTTCAAAGCAATTCAAGATGTGCTAAAAGA  518

Query  519  AAAACTACATAAAAGAGGTGTTCGTATTTTGACTGGATTGGGAAAATATTTTCAACAGTTGGACAAGGAAGGAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAAACTACATAAAAGAGGTGTTCGTATTTTGACTGGATTGGGAAAATATTTTCAACAGTTGGACAAGGAAGGAA  592

Query  593  ATGGACTTTTAGATAAGGCAGATTTTAAGCAAGCTCTAAAAGTGTTTCACTTAGAAGTGTCTGAAAAGGATTTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGGACTTTTAGATAAGGCAGATTTTAAGCAAGCTCTAAAAGTGTTTCACTTAGAAGTGTCTGAAAAGGATTTT  666

Query  667  GAGTCTGCATGGCTAATTCTGAATGACAATGGCAATGGCAAGGTTGATTATGGAGAATTCAAACGTGGTATTAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGTCTGCATGGCTAATTCTGAATGACAATGGCAATGGCAAGGTTGATTATGGAGAATTCAAACGTGGTATTAT  740

Query  741  TGGTGAAATGAATGAATACAGGAAATCATATGTTCGAAAGGCCTTTATGAAACTGGATTTCAACAAAAGTGGCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGTGAAATGAATGAATACAGGAAATCATATGTTCGAAAGGCCTTTATGAAACTGGATTTCAACAAAAGTGGCA  814

Query  815  GTGTGCCTATTATAAACATAAGAAAATGTTACTGTGCAAAGAAGCATTCTCAAGTAATTTCAGGT---------  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.         
Sbjct  815  GTGTGCCTATTATAAACATAAGAAAATGTTACTGTGCAAAGAAGCATTCTCAAGTAATTTCAGGCCATTCAACA  888

Query  880  --------------------------------------------------------------------------  879
                                                                                      
Sbjct  889  GAGGAAGAAATCAAATCATCCTTTCTAGAAACATTAAAAGTTGCCTGCAGCAAGTCTGATGAAGTGTCATATGG  962

Query  880  --------------------------------------------------------------------------  879
                                                                                      
Sbjct  963  TGAATTTGAAGATTACTATGAAGGTTTAAGTATAGGAATAGTAGATGATGAAGACTTTGTTAACATCTTACGTA  1036

Query  880  --------------  879
                          
Sbjct 1037  CTCCATGGGGGATT  1050