Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_12859
• Subject: NM_130892.5
• Aligned Length: 1188
• Identities: 946
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGCGTTTTGAAGACCTGTGTACTTAGAAGAAGTGCTTGTGCCGCCGCCTGCTTCTGGAGAAGGACAGTTAT  74

Query    1  ----------------------------------------------------ATGCCTGCTTGGGTGATAGATA  22
                                                                |||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  CCCAAAGCCACCATTTAGAGGCATTAGTACTACGTCTGCGAGGAGCACTGTCATGCCCGCTTGGGTGATAGATA  148

Query   23  AATATGGGAAGAATGAAGTGCTTCGATTCACTCAGAACATGATGATGCCTATCATACACTATCCAAATGAAGTC  96
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AATATGGAAAGAATGAAGTCCTTCGATTCACCCAGAACATGATGTTACCTATCATACACTATCCAAATGAAGTC  222

Query   97  ATTGTCAAAGTTCACGCTGCCAGTGTAAATCCTATAGACGTTAATATGAGAAGTGGTTATGGAGCTACAGCTTT  170
            |||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..|
Sbjct  223  ATTATCAAAGTCCACGCTGCCAGTGTAAATCCTATAGATGTTAATATGAGAAGTGGTTATGGAGCCACAGCCCT  296

Query  171  AAATATGAAGCGTGATCCTTTACACGTGAAAATCAAAGGAGAAGAATTTCCTCTGACTCTGGGTCGGGATGTCT  244
            ||||||||||||||||||..|.||..||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAATATGAAGCGTGATCCCCTGCATATGAAAACCAAAGGAGAAGAGTTTCCTCTGACTCTGGGTCGGGATGTCT  370

Query  245  CTGGCGTGGTGATGGAATGTGGGCTTGATGTGAAATACTTCAAGCCTGGAGATGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCT  318
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGGTGTGGTGATGGAGTGTGGGCTTGATGTGAAGTATTTCCAGCCTGGAGATGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCT  444

Query  319  CCTTGGAAACAAGGCACTCTTTCAGAGTTTGTTGTAGTCAGTGGGAATGAGGTCTCTCACAAACCCAAATCACT  392
            ||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct  445  CCTTGGAAGCAAGGCACTCTCTCAGAATTTGTTGTGGTCAGTGGGAATGAGGTTTCACACAAGCCCAAATCGCT  518

Query  393  CACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACAGCCTGGTCTGCTATAAACAAAGTTGGTGGCC  466
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  TACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACGGCCTGGTCTGCCATAAACAAGGTTGGCGGCC  592

Query  467  TGAATGACAAGAATTGCACAGGAAAACGTGTTCTAATCTTAGGCGCTTCAGGCGGAGTTGGTACTTTTGCTATA  540
            |||.|||||.|||.||||..||.||.||||...|||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  TGAGTGACAGGAACTGCAAGGGGAAGCGTGCCTTAATCTTGGGTGCGTCAGGTGGAGTTGGTACTTTTGCGATA  666

Query  541  CAGGTAATGAAAGCATGGGATGCTCATGTGACAGCAGTTTGCTCCCAAGATGCCAGTGAACTTGTAAGGAAGCT  614
            |||||||||||||||||||..||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct  667  CAGGTAATGAAAGCATGGGGGGCTCATGTGACAGCCGTTTGCTCGAAAGATGCCAGTGAACTTGTGCGGAAGCT  740

Query  615  TGGTGCAGACGATGTAATTGATTACAAATCTGGAAGTGTGGAAGAGCAGTTGAAATCCTTAAAACCATTTGATT  688
            |||.|||||.||.||.||||||||||..|..|||||||||||||||||.||||||||..||||||..|||||.|
Sbjct  741  TGGAGCAGATGAGGTCATTGATTACACGTTGGGAAGTGTGGAAGAGCAATTGAAATCTCTAAAACTGTTTGACT  814

Query  689  TTATCCTTGATAATGTTGGCGGATCCACTGAAACATGGGCTCCAGATTTTCTCAAGAAATGGTCAGGAGCCACC  762
            |||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  815  TTATCCTTGATAACGTTGGTGGATCTACTGAAACATGGGCTCTAAATTTTCTCAAGAAGTGGTCAGGAGCTACC  888

Query  763  TATGTGACTTTGGTGACTCCTTTCCTCCTGAACATGGACCGATTGGGCATAGCAGATGGCATGTTGCAGACAGG  836
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..|.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TATGTGACTCTGGTGACTCCTTTCCTCCTGAACATGGACCGACTGGGTGTTGCTGATGGCATGTTGCAGACAGG  962

Query  837  AGTCACTGTAGGTTCAAAGGCATTAAAGCATTTCTGGAAAGGAGTCCATTATCGCTGGGCATTTTTCATGGCCA  910
            ||||||.||.|||.||||||||||.||||||.|||||.|||||||||||||..|.|||||.||.||||||||||
Sbjct  963  AGTCACCGTGGGTACAAAGGCATTGAAGCATCTCTGGCAAGGAGTCCATTACAGATGGGCCTTCTTCATGGCCA  1036

Query  911  GTGGCCCATGTTTAGATGACATTGCAGAACTGGTGGATGCGGGAAAGATCCGGCCAGTTATTGAACAAACCTTT  984
            ||||.||||.|.|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|..||.||.
Sbjct 1037  GTGGTCCATATCTAGATGAAATTGCAGAACTGGTGGATGCAGGAAAGATCCGGCCAGTTATTGAGCGGACATTC  1110

Query  985  CCTTTTTCTAAAGTTCCAGAAGCCTTCCTGAAGGTGGAAAGAGGACACGCACGAGGAAAGACTGTAATTAATGT  1058
            |||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||..|||||||
Sbjct 1111  CCTTTCTCTGAAGTCCCAGAAGCCTTCCTGAAGGTGGAGAGAGGCCACGCCCGAGGAAAGACTGTGGTTAATGT  1184

Query 1059  TGTT  1062
            .|||
Sbjct 1185  AGTT  1188