Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13004
• Subject: XM_011536254.2
• Aligned Length: 1830
• Identities: 1828
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCCCAAGAAATAGATCTGAGTGCTCTCAAGGAGTTAGAACGCGAGGCCATTCTCCAGGTCCTGTACCGAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCCAAGAAATAGATCTGAGTGCTCTCAAGGAGTTAGAACGCGAGGCCATTCTCCAGGTCCTGTACCGAGA  74

Query   75  CCAGGCGGTTCAAAACACAGAGGAGGAGAGGACACGGAAACTGAAAACACACCTGCAGCATCTCCGGTGGAAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGGCGGTTCAAAACACAGAGGAGGAGAGGACACGGAAACTGAAAACACACCTGCAGCATCTCCGGTGGAAAG  148

Query  149  GAGCGAAGAACACGGACTGGGAGCACAAAGAGAAGTGCTGTGCGCGCTGCCAGCAGGTGCTGGGGTTCCTGCTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGCGAAGAACACGGACTGGGAGCACAAAGAGAAGTGCTGTGCGCGCTGCCAGCAGGTGCTGGGGTTCCTGCTG  222

Query  223  CACCGGGGCGCCGTGTGCCGGGGCTGCAGCCACCGCGTGTGTGCCCAGTGCCGAGTGTTCCTGAGGGGGACCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CACCGGGGCGCCGTGTGCCGGGGCTGCAGCCACCGCGTGTGTGCCCAGTGCCGAGTGTTCCTGAGGGGGACCCA  296

Query  297  TGCCTGGAAGTGCACGGTGTGCTTCGAGGACAGGAATGTCAAAATAAAAACTGGAGAATGGTTCTATGAGGAAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCCTGGAAGTGCACGGTGTGCTTCGAGGACAGGAATGTCAAAATAAAAACTGGAGAATGGTTCTATGAGGAAC  370

Query  371  GAGCCAAGAAATTTCCAACTGGAGGCAAACATGAGACAGTTGGAGGGCAGCTCTTGCAATCTTATCAGAAGCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGCCAAGAAATTTCCAACTGGAGGCAAACATGAGACAGTTGGAGGGCAGCTCTTGCAATCTTATCAGAAGCTG  444

Query  445  AGCAAAATTTCTGTGGTTCCTCCTACTCCACCTCCTGTCAGCGAGAGCCAGTGCAGCCGCAGTCCTGGCAGGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCAAAATTTCTGTGGTTCCTCCTACTCCACCTCCTGTCAGCGAGAGCCAGTGCAGCCGCAGTCCTGGCAGGTT  518

Query  519  ACAGGAATTTGGTCAGTTTAGAGGATTTAATAAGTCCGTGGAAAATTTGTTTCTGTCTCTTGCTACCCACGTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACAGGAATTTGGTCAGTTTAGAGGATTTAATAAGTCCGTGGAAAATTTGTTTCTGTCTCTTGCTACCCACGTGA  592

Query  593  AAAAGCTCTCCAAATCCCAGAATGATATGACTTCTGAGAAGCATCTTCTCGCCACGGGCCCCAGGCAGTGTGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAAGCTCTCCAAATCCCAGAATGATATGACTTCTGAGAAGCATCTTCTCGCCACGGGCCCCAGGCAGTGTGTG  666

Query  667  GGACAGACAGAGAGACGGAGCCAGTCTGACACTGCGGTCAACGTCACCACCAGGAAGGTCAGTGCACCAGATAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGACAGACAGAGAGACGGAGCCAGTCTGACACTGCGGTCAACGTCACCACCAGGAAGGTCAGTGCACCAGATAT  740

Query  741  TCTGAAACCTCTCAATCAAGAGGATCCCAAATGCTCTACTAACCCTATTTTGAAGCAACAGAATCTCCCATCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTGAAACCTCTCAATCAAGAGGATCCCAAATGCTCTACTAACCCTATTTTGAAGCAACAGAATCTCCCATCCA  814

Query  815  GTCCGGCACCCAGTACCATATTCTCTGGAGGTTTTAGACACGGAAGTTTAATTAGCATTGACAGCACCTGTACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTCCGGCACCCAGTACCATATTCTCTGGAGGTTTTAGACACGGAAGTTTAATTAGCATTGACAGCACCTGTACA  888

Query  889  GAGATGGGCAATTTTGACAATGCTAATGTCACTGGAGAAATAGAATTTGCCATTCATTATTGCTTCAAAACCCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAGATGGGCAATTTTGACAATGCTAATGTCACTGGAGAAATAGAATTTGCCATTCATTATTGCTTCAAAACCCA  962

Query  963  TTCTTTAGAAATATGCATCAAGGCCTGTAAGAACCTTGCCTATGGAGAAGAAAAGAAGAAAAAGTGCAATCCGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTCTTTAGAAATATGCATCAAGGCCTGTAAGAACCTTGCCTATGGAGAAGAAAAGAAGAAAAAGTGCAATCCGT  1036

Query 1037  ATGTGAAGACCTACCTGTTGCCCGACAGATCCTCCCAGGGAAAGCGCAAGACTGGAGTCCAAAGGAACACCGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGTGAAGACCTACCTGTTGCCCGACAGATCCTCCCAGGGAAAGCGCAAGACTGGAGTCCAAAGGAACACCGTG  1110

Query 1111  GACCCGACCTTTCAGGAGACCTTGAAGTATCAGGTGGCCCCTGCCCAGCTGGTGACCCGGCAGCTGCAGGTCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACCCGACCTTTCAGGAGACCTTGAAGTATCAGGTGGCCCCTGCCCAGCTGGTGACCCGGCAGCTGCAGGTCTC  1184

Query 1185  GGTGTGGCATCTGGGCACGCTGGCCCGGAGAGTGTTTCTTGGAGAAGTGATCATTCCTCTGGCCACGTGGGACT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGTGTGGCATCTGGGCACGCTGGCCCGGAGAGTGTTTCTTGGAGAAGTGATCATTCCTCTGGCCACGTGGGACT  1258

Query 1259  TTGAAGACAGCACAACACAGTCCTTCCGCTGGCATCCGCTCCGGGCCAAGGCGGAGAAATACGAAGACAGCGTT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTGAAGACAGCACAACACAGTCCTTCCGCTGGCATCCGCTCCGGGCCAAGGCGGAGAAATACGAAGACAGCGTT  1332

Query 1333  CCTCAGAGTAATGGAGAGCTCACAGTCCGGGCTAAGCTGGTTCTCCCTTCACGGCCCAGAAAACTCCAAGAGGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCTCAGAGTAATGGAGAGCTCACAGTCCGGGCTAAGCTGGTTCTCCCTTCACGGCCCAGAAAACTCCAAGAGGC  1406

Query 1407  TCAAGAAGGGACAGATCAGCCATCACTTCATGGTCAACTTTGTTTGGTAGTGCTAGGAGCCAAGAATTTACCTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCAAGAAGGGACAGATCAGCCATCACTTCATGGTCAACTTTGTTTGGTAGTGCTAGGAGCCAAGAATTTACCTG  1480

Query 1481  TGCGGCCAGATGGCACCTTGAACTCATTTGTTAAGGGCTGTCTCACTCTGCCAGACCAACAAAAACTGAGACTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGCGGCCAGATGGCACCTTGAACTCATTTGTTAAGGGCTGTCTCACTCTGCCAGACCAACAAAAACTGAGACTG  1554

Query 1555  AAGTCGCCAGTCCTGAGGAAGCAGGCTTGCCCCCAGTGGAAACACTCATTTGTCTTCAGTGGCGTAACCCCAGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AAGTCGCCAGTCCTGAGGAAGCAGGCTTGCCCCCAGTGGAAACACTCATTTGTCTTCAGTGGCGTAACCCCAGC  1628

Query 1629  TCAGCTGAGGCAGTCGAGCTTGGAGTTAACTGTCTGGGATCAGGCCCTCTTTGGAATGAACGACCGCTTGCTTG  1702
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TCAGCTGAGGCAGTCAAGCTTGGAGTTAACTGTCTGGGATCAGGCCCTCTTTGGAATGAACGACCGCTTGCTTG  1702

Query 1703  GAGGAACCAGACTTGGTTCAAAGGGAGACACAGCTGTTGGCGGGGATGCATGCTCACAATCGAAGCTCCAGTGG  1776
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1703  GAGGAACCAGACTTGGTTCAAAGGGAGACACAGCTGTTGGCGGGGATGCATGCTCACTATCGAAGCTCCAGTGG  1776

Query 1777  CAGAAAGTCCTTTCCAGCCCCAATCTATGGACAGACATGACTCTTGTCCTGCAC  1830
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CAGAAAGTCCTTTCCAGCCCCAATCTATGGACAGACATGACTCTTGTCCTGCAC  1830