Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13020
• Subject: NM_001352325.2
• Aligned Length: 1123
• Identities: 1120
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGTTGCTTTTCGTGGAGCAGGTAGCATCTAAAGGAACTGGTTTAAATCCTAATGCCAAAGTATGGCAAGAAAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGCTTTTCGTGGAGCAGGTAGCATCTAAAGGAACTGGTTTAAATCCTAATGCCAAAGTATGGCAAGAAAT  74

Query   75  TGCTCCTGGAAATACTGATGCCACCCCAGTAACTCATGGAACTGAAAGCTCTTGGCATGAAATAGCAGCTACAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCTCCTGGAAATACTGATGCCACCCCAGTAACTCATGGAACTGAAAGCTCTTGGCATGAAATAGCAGCTACAT  148

Query  149  CAGGTGCTCATCCTGAGGGTAATGCAGAGCTCTCAGAAGATATATGTAAAGAATATGAAGTAATGTATTCTTCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGGTGCTCATCCTGAGGGTAATGCAGAGCTCTCAGAAGATATATGTAAAGAATATGAAGTAATGTATTCTTCA  222

Query  223  TCTTGTGAAACCACAAGAAATACTACAGGCATTGAAGAATCAACTGATGGGATGATTTTAGGACCAGAAGATCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTTGTGAAACCACAAGAAATACTACAGGCATTGAAGAATCAACTGATGGGATGATTTTAGGACCAGAAGATCT  296

Query  297  GAGTTACCAAATATATGATGTTTCCGGAGAAAGCAATTCAGCAGTTTCTACAGAAGACCTAAAAGAATGTCTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAGTTACCAAATATATGATGTTTCCGGAGAAAGCAATTCAGCAGTTTCTACAGAAGACCTAAAAGAATGTCTGA  370

Query  371  AGAAACAATTAGAATTCTGTTTTTCACGAGAAAATTTGTCAAAGGATCTTTACTTGATATCTCAAATGGATAGT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGAAACAATTAGAATTCTGTTTTTCACGAGAAAATTTGTCAAAGGATCTTTACTTGATATCTCAAATGGATAGT  444

Query  445  GATCAGTTCATCCCAATTTGGACAGTTGCCAACATGGAAGAAATAAAAAAGTTGACTACAGACCCTGATCTAAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATCAGTTCATCCCAATTTGGACAGTTGCCAACATGGAAGAAATAAAAAAGTTGACTACAGACCCTGATCTAAT  518

Query  519  TCTTGAAGTGTTAAGATCTTCTCCCATGGTACAAGTTGATGAGAAGGGTGAGAAAGTGAGACCAAGTCATAAGC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCTTGAAGTGTTAAGATCTTCTCCCATGGTACAAGTTGATGAGAAGGGTGAGAAAGTGAGACCAAGTCATAAGC  592

Query  593  GTTGTATTGTAATTCTTAGAGAGATTCCTGAAACAACACCAATAGAGGAAGTGAAAGGTTTGTTCAAAAGTGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTTGTATTGTAATTCTTAGAGAGATTCCTGAAACAACACCAATAGAGGAAGTGAAAGGTTTGTTCAAAAGTGAA  666

Query  667  AACTGCCCCAAAGTGATAAGCTGTGAGTTTGCACACAATAGCAACTGGTATATCACTTTCCAGTCAGACACAGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AACTGCCCCAAAGTGATAAGCTGTGAGTTTGCACACAATAGCAACTGGTATATCACTTTCCAGTCAGACACAGA  740

Query  741  TGCACAACAGGCTTTTAAATACTTAAGAGAAGAAGTTAAAACATTTCAGGGCAAGCCAATTATGGCAAGGATAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCACAACAGGCTTTTAAATACTTAAGAGAAGAAGTTAAAACATTTCAGGGCAAGCCAATTATGGCAAGGATAA  814

Query  815  AAGCCATCAATACATTTTTTGCTAAGAATGGTTATCGATTAATGGATTCTAGTATCTATAGTCACCCCATTCAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGCCATCAATACATTTTTTGCTAAGAATGGTTATCGATTAATGGATTCTAGTATCTATAGTCACCCCATTCAA  888

Query  889  ACTCAAGCACAGTATGCCTCCCCAGTCTTTATGCAGCCTGTATATAATCCTCACCAACAGTACTCGGTCTATAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACTCAAGCACAGTATGCCTCCCCAGTCTTTATGCAGCCTGTATATAATCCTCACCAACAGTACTCGGTCTATAG  962

Query  963  TATTGTGCCTCAGTCTTGGTCTCCAAATCCTACACCTTACTTTGAAACACCACTGGCTCCCTTTCCCAATGGTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TATTGTGCCTCAGTCTTGGTCTCCAAATCCTACACCTTACTTTGAAACACCACTGGCTCCCTTTCCCAATGGTA  1036

Query 1037  GTTTTGTGAATGGCTTTAATTCGCCAGGATCTTATAAAACAAATGCTGCTGCTATGAATATGGGTCGACCATTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTTTTGTGAATGGCTTTAATTCGCCAGGATCTTATAAAACAAATGCTGCTGCTATGAATATGGGTCGACCATTC  1110

Query 1111  C-AAAAAATCGTG  1122
            | |||||||||. 
Sbjct 1111  CAAAAAAATCGG-  1122