Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13039
- Subject:
- XM_006498090.3
- Aligned Length:
- 1839
- Identities:
- 1493
- Gaps:
- 201
Alignment
Query 1 ATGAGGAGATTTGTCTACTGCAAGGTGGTTCTAGCCACTTCGCTGATGTGGGTTCTTGTTGATGTCTTCTTACT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGGAGATTTGTCTACTGCAAGGTGGTTCTGGCCACTTCTCTGATGTGGGTGCTTGTTGATGTCTTCTTACT 74
Query 75 GCTGTACTTCAGTGAATGTAACAAATGTGATGACAAGAAGGAGAGATCTCTGCTGCCTGCATTGAGGGCTGTTA 148
.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||
Sbjct 75 CCTGTACTTCAGCGAGTGTAACAAGTGTGATGACAAGAAGGAGAGATCCCTGCTGCCTGCGCTGAGGGCTGTTA 148
Query 149 TTTCAAGAAACCAAGAAGGGCCAGGAGAAATGGGAAAAGCTGTGTTGATTCCTAAAGATGACCAGGAGAAAATG 222
|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 149 TTTCAAGAAACCAAGAAGGTCCAGGAGAAATGGGAAAGGCTGTGCTTATTCCAAAAGATGACCAAGAGAAAATG 222
Query 223 AAAGAGCTGTTTAAAATCAATCAGTTTAACCTTATGGCCAGTGATTTGATTGCCCTTAATAGAAGTCTGCCAGA 296
||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||..||||||||||.||
Sbjct 223 AAAGAGTTGTTTAAAATCAATCAGTTTAACCTCATGGCCAGTGACTTGATCGCACTTAACCGAAGTCTGCCGGA 296
Query 297 TGTAAGATTAGAAG------------------------------------------------------------ 310
|||.||||||||||
Sbjct 297 TGTGAGATTAGAAGGACAGTACTGTTGTGGTAGATGTGAAGAACTTCAAACAATGCAGCAAGAAAGATATGCTA 370
Query 311 ------------------------------------------------------------------GATGTAAG 318
||||.|||
Sbjct 371 GAGTTTACATCTCTACCAACTTCTGCTCCAGTATCCTCTTCTGGTTGAAATGTAACACTGAGTTGAGATGCAAG 444
Query 319 ACAAAAGTCTACCCTGATGAACTTCCAAACACAAGTGTAGTCATTGTGTTTCATAATGAAGCTTGGAGCACTCT 392
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACTAAAGTCTACCCTGATGAACTTCCAAACACAAGTGTAGTCATTGTGTTCCATAATGAAGCTTGGAGCACTCT 518
Query 393 CCTTAGAACTGTTTACAGTGTGATAAATCGTTCCCCACACTATCTACTCTCAGAGGTCATCTTGGTAGATGATG 466
.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 519 ACTTAGAACTGTCTATAGTGTCATAAATCGCTCCCCACACTACCTGCTCTCTGAGGTCATCTTGGTTGATGATG 592
Query 467 CCAGTGAAAGAGATTTTCTCAAGTTGACATTAGAGAATTACGTGAAAAATTTAGAAGTGCCAGTAAAAATTATT 540
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 593 CCAGTGAAAGAGATTTTCTCAAGTTGACATTAGAGAACTACGTGAAAACTTTAGAAGTGCCAGTGAAGATTATC 666
Query 541 AGGATGGAAGAACGCTCTGGGTTAATACGTGCCCGTCTTCGAGGAGCAGCTGCTTCAAAAGGGCAGGTCATAAC 614
|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 AGGATGGAAGAGCGCTCTGGGTTAATACGCGCCCGTCTCCGAGGAGCAGCAGCTTCAAAAGGACAGGTCATAAC 740
Query 615 TTTTCTTGATGCACACTGTGAATGCACGTTAGGATGGCTGGAGCCTTTGCTGGCAAGAATAAAGGAAGACAGGA 688
||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTTCTGGATGCACACTGCGAGTGCACCTTAGGATGGCTGGAGCCCTTGCTGGCGAGAATAAAGGAAGACAGGA 814
Query 689 AAACGGTTGTCTGCCCTATCATTGATGTGATTAGTGATGATACTTTTGAATATATGGCTGGGTCAGACATGACT 762
||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AAACAGTTGTGTGCCCGATCATTGATGTTATTAGTGATGATACGTTTGAGTACATGGCTGGGTCAGACATGACT 888
Query 763 TATGGGGGTTTTAACTGGAAACTGAATTTCCGCTGGTATCCTGTTCCCCAAAGAGAAATGGACAGGAGGAAAGG 836
|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 889 TATGGTGGTTTCAACTGGAAGCTAAATTTCCGATGGTATCCTGTCCCTCAAAGAGAAATGGATAGGAGAAAAGG 962
Query 837 AGACAGAACATTACCTGTCAGGACCCCTACTATGGCTGGTGGCCTATTTTCTATTGACAGAAACTACTTTGAAG 910
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGACAGGACATTACCTGTCAGGACCCCTACTATGGCTGGTGGCCTATTTTCTATTGACAGAAACTACTTTGAAG 1036
Query 911 AGATAGGAACTTACGATGCAGGAATGGATATCTGGGGTGGAGAGAATCTTGAAATGTCTTTTAGGATTTGGCAA 984
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037 AGATAGGAACTTACGATGCAGGAATGGATATCTGGGGTGGAGAGAATCTTGAAATGTCTTTTAGGATCTGGCAA 1110
Query 985 TGTGGAGGCTCCTTGGAGATTGTTACTTGCTCCCATGTTGGTCATGTTTTTCGGAAGGCAACTCCATACACTTT 1058
||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1111 TGTGGAGGTTCTTTGGAGATTGTGACTTGCTCTCATGTCGGTCATGTTTTTCGAAAGGCAACTCCATACACATT 1184
Query 1059 TCCTGGTGGCACTGGTCATGTCATCAACAAGAACAACAGGAGACTGGCAGAAGTTTGGATGGATGAATTTAAAG 1132
.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1185 CCCTGGTGGCACTGGCCATGTCATTAACAAGAACAACAGAAGACTGGCAGAAGTGTGGATGGATGAATTCAAAG 1258
Query 1133 ATTTCTTCTACATCATATCCCCAGGTGTTGTCAAAGTGGATTATGGAGATGTGTCAGTCAGAAAAACACTAAGA 1206
||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1259 ATTTCTTCTATATCATATCCCCAGGTGTTGTCAAAGTGGATTATGGAGATGTGTCAGTCAGAAAAACACTGAGG 1332
Query 1207 GAAAATCTGAAGTGTAAGCCCTTTTCTTGGTACCTAGAAAACATCTATCCGGACTCCCAGATCCCAAGACGTTA 1280
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAAAATCTGAAGTGTAAGCCTTTTTCTTGGTACCTGGAAAACATCTATCCGGACTCCCAGATCCCAAGACGTTA 1406
Query 1281 TTACTCACTTGGTGAGATAAGAAATGTTGAAACCAATCAGTGTTTAGACAACATGGGCCGCAAGGAAAATGAAA 1354
|||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1407 TTACTCACTTGGTGAGATACGAAATGTTGAGACCAATCAATGCTTAGATAACATGGGCCGCAAAGAAAATGAAA 1480
Query 1355 AAGTGGGTATATTCAACTGTCATGGTATGGGAGGAAATCAGGTATTTTCTTACACTGCTGACAAAGAAATCCGA 1428
||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AAGTGGGTATCTTCAACTGTCACGGCATGGGAGGTAACCAGGTGTTTTCTTATACTGCTGACAAAGAAATCCGA 1554
Query 1429 ACCGATGACTTGTGCTTGGATGTTTCTAGACTCAATGGACCTGTAATCATGTTAAAATGCCACCATATGAGAGG 1502
||.||.|||||||||.|||||||.||.|||||||.|||.||||||||||||.|||||||||||||.||||||||
Sbjct 1555 ACTGACGACTTGTGCCTGGATGTATCCAGACTCAGTGGCCCTGTAATCATGCTAAAATGCCACCACATGAGAGG 1628
Query 1503 AAATCAGTTATGGGAATATGATGCTGAG----TC---TTG------TCTCTCAGTGAACAAAGTAGC-TGATG- 1561
|||||||.|.|||||||||||.|||||| || ||| .||..||||.|.|||.|| | |||||
Sbjct 1629 AAATCAGCTGTGGGAATATGACGCTGAGAGACTCACTTTGAGACATGCTAACAGTAACCAATGT--CTTGATGA 1700
Query 1562 -GCTCC---------CAGCAT----CCTACTGTGGAAACCTGTAATGATAGCACTTTGCAAAAATGGCTACTAA 1621
.||.| ||..|| |||||..||.|...|||.|.||..||||..|..|||.|||||||.||.|
Sbjct 1701 ACCTTCTGAAGAAGACAAAATGGTGCCTACCATGCAGGACTGCAGTGGCAGCAGATCCCAACAATGGCTGCTGA 1774
Query 1622 GAAACTATACAAGAATGGAAATTTTTAGAAATATTTTTGGGA-ATTCTACTGATTACATTCTC 1683
|.||| ||| |..||.|||| |
Sbjct 1775 GGAAC---------ATG---------------ACCTTGGGGACA------------------- 1794