Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13039
- Subject:
- XM_011510538.2
- Aligned Length:
- 1713
- Identities:
- 1140
- Gaps:
- 573
Alignment
Query 1 ATGAGGAGATTTGTCTACTGCAAGGTGGTTCTAGCCACTTCGCTGATGTGGGTTCTTGTTGATGTCTTCTTACT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCTGTACTTCAGTGAATGTAACAAATGTGATGACAAGAAGGAGAGATCTCTGCTGCCTGCATTGAGGGCTGTTA 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTTCAAGAAACCAAGAAGGGCCAGGAGAAATGGGAAAAGCTGTGTTGATTCCTAAAGATGACCAGGAGAAAATG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 AAAGAGCTGTTTAAAATCAATCAGTTTAACCTTATGGCCAGTGATTTGATTGCCCTTAATAGAAGTCTGCCAGA 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGTAAGATTAGAAGGATGTAAGACAAAAGTCTACCCTGATGAACTTCCAAACACAAGTGTAGTCATTGTGTTTC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 ATAATGAAGCTTGGAGCACTCTCCTTAGAACTGTTTACAGTGTGATAAATCGTTCCCCACACTATCTACTCTCA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GAGGTCATCTTGGTAGATGATGCCAGTGAAAGAGATTTTCTCAAGTTGACATTAGAGAATTACGTGAAAAATTT 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 AGAAGTGCCAGTAAAAATTATTAGGATGGAAGAACGCTCTGGGTTAATACGTGCCCGTCTTCGAGGAGCAGCTG 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------ATGGAAGAACGCTCTGGGTTAATACGTGCCCGTCTTCGAGGAGCAGCTG 49
Query 593 CTTCAAAAGGGCAGGTCATAACTTTTCTTGATGCACACTGTGAATGCACGTTAGGATGGCTGGAGCCTTTGCTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 50 CTTCAAAAGGGCAGGTCATAACTTTTCTTGATGCACACTGTGAATGCACGTTAGGATGGCTGGAGCCTTTGCTG 123
Query 667 GCAAGAATAAAGGAAGACAGGAAAACGGTTGTCTGCCCTATCATTGATGTGATTAGTGATGATACTTTTGAATA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 124 GCAAGAATAAAGGAAGACAGGAAAACGGTTGTCTGCCCTATCATTGATGTGATTAGTGATGATACTTTTGAATA 197
Query 741 TATGGCTGGGTCAGACATGACTTATGGGGGTTTTAACTGGAAACTGAATTTCCGCTGGTATCCTGTTCCCCAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 198 TATGGCTGGGTCAGACATGACTTATGGGGGTTTTAACTGGAAACTGAATTTCCGCTGGTATCCTGTTCCCCAAA 271
Query 815 GAGAAATGGACAGGAGGAAAGGAGACAGAACATTACCTGTCAGGACCCCTACTATGGCTGGTGGCCTATTTTCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 272 GAGAAATGGACAGGAGGAAAGGAGACAGAACATTACCTGTCAGGACCCCTACTATGGCTGGTGGCCTATTTTCT 345
Query 889 ATTGACAGAAACTACTTTGAAGAGATAGGAACTTACGATGCAGGAATGGATATCTGGGGTGGAGAGAATCTTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 346 ATTGACAGAAACTACTTTGAAGAGATAGGAACTTACGATGCAGGAATGGATATCTGGGGTGGAGAGAATCTTGA 419
Query 963 AATGTCTTTTAGGATTTGGCAATGTGGAGGCTCCTTGGAGATTGTTACTTGCTCCCATGTTGGTCATGTTTTTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 420 AATGTCTTTTAGGATTTGGCAATGTGGAGGCTCCTTGGAGATTGTTACTTGCTCCCATGTTGGTCATGTTTTTC 493
Query 1037 GGAAGGCAACTCCATACACTTTTCCTGGTGGCACTGGTCATGTCATCAACAAGAACAACAGGAGACTGGCAGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 494 GGAAGGCAACTCCATACACTTTTCCTGGTGGCACTGGTCATGTCATCAACAAGAACAACAGGAGACTGGCAGAA 567
Query 1111 GTTTGGATGGATGAATTTAAAGATTTCTTCTACATCATATCCCCAGGTGTTGTCAAAGTGGATTATGGAGATGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 568 GTTTGGATGGATGAATTTAAAGATTTCTTCTACATCATATCCCCAGGTGTTGTCAAAGTGGATTATGGAGATGT 641
Query 1185 GTCAGTCAGAAAAACACTAAGAGAAAATCTGAAGTGTAAGCCCTTTTCTTGGTACCTAGAAAACATCTATCCGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 642 GTCAGTCAGAAAAACACTAAGAGAAAATCTGAAGTGTAAGCCCTTTTCTTGGTACCTAGAAAACATCTATCCGG 715
Query 1259 ACTCCCAGATCCCAAGACGTTATTACTCACTTGGTGAGATAAGAAATGTTGAAACCAATCAGTGTTTAGACAAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 716 ACTCCCAGATCCCAAGACGTTATTACTCACTTGGTGAGATAAGAAATGTTGAAACCAATCAGTGTTTAGACAAC 789
Query 1333 ATGGGCCGCAAGGAAAATGAAAAAGTGGGTATATTCAACTGTCATGGTATGGGAGGAAATCAGGTATTTTCTTA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 790 ATGGGCCGCAAGGAAAATGAAAAAGTGGGTATATTCAACTGTCATGGTATGGGAGGAAATCAGGTATTTTCTTA 863
Query 1407 CACTGCTGACAAAGAAATCCGAACCGATGACTTGTGCTTGGATGTTTCTAGACTCAATGGACCTGTAATCATGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 864 CACTGCTGACAAAGAAATCCGAACCGATGACTTGTGCTTGGATGTTTCTAGACTCAATGGACCTGTAATCATGT 937
Query 1481 TAAAATGCCACCATATGAGAGGAAATCAGTTATGGGAATATGATGCTG-------------------------- 1528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 938 TAAAATGCCACCATATGAGAGGAAATCAGTTATGGGAATATGATGCTGAGACCCACACTCTTCTTCATATAATC 1011
Query 1529 ----AGTCTTGTCTCTCAGTGAACAAAGTAGCTGATGGCTCCCAGCATCCTACTGTGGAAACCTGTAATGATAG 1598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012 ACCCAGTCTTGTCTCTCAGTGAACAAAGTAGCTGATGGCTCCCAGCATCCTACTGTGGAAACCTGTAATGATAG 1085
Query 1599 CACTTTGCAAAAATGGCTACTAAGAAACTATACAAGAATGGAAATTTTTAGAAATATTTTTGGGAATTCTACTG 1672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1086 CACTTTGCAAAAATGGCTACTAAGAAACTATACAAGAATGGAAATTTTTAGAAATATTTTTGGGAATTCTACTG 1159
Query 1673 ATTACATTCTC 1683
|||||||||||
Sbjct 1160 ATTACATTCTC 1170
