Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13039
• Subject: XM_017003261.1
• Aligned Length: 1726
• Identities: 1598
• Gaps: 101

Alignment

Query    1  ATGAGGAGATTTGTCTACTGCAAGGTGGTTCTAGCCACTTCGCTGATGTGGGTTCTTGTTGATGTCTTCTTACT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGAGATTTGTCTACTGCAAGGTGGTTCTAGCCACTTCGCTGATGTGGGTTCTTGTTGATGTCTTCTTACT  74

Query   75  GCTGTACTTCAGTGAATGTAACAAATGTGATGACAAGAAGGAGAGATCTCTGCTGCCTGCATTGAGGGCTGTTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTGTACTTCAGTGAATGTAACAAATGTGATGACAAGAAGGAGAGATCTCTGCTGCCTGCATTGAGGGCTGTTA  148

Query  149  TTTCAAGAAACCAAGAAGGGCCAGGAGAAATGGGAAAAGCTGTGTTGATTCCTAAAGATGACCAGGAGAAAATG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTTCAAGAAACCAAGAAGGGCCAGGAGAAATGGGAAAAGCTGTGTTGATTCCTAAAGATGACCAGGAGAAAATG  222

Query  223  AAAGAGCTGTTTAAAATCAATCAGTTTAACCTTATGGCCAGTGATTTGATTGCCCTTAATAGAAGTCTGCCAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAGAGCTGTTTAAAATCAATCAGTTTAACCTTATGGCCAGTGATTTGATTGCCCTTAATAGAAGTCTGCCAGA  296

Query  297  TGTAAGATTAGAAGGATGTAAGACAAAAGTCTACCCTGATGAACTTCCAAACACAAGTGTAGTCATTGTGTTTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTAAGATTAGAAGGATGTAAGACAAAAGTCTACCCTGATGAACTTCCAAACACAAGTGTAGTCATTGTGTTTC  370

Query  371  ATAATGAAGCTTGGAGCACTCTCCTTAGAACTGTTTACAGTGTGATAAATCGTTCCCCACACTATCTACTCTCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATAATGAAGCTTGGAGCACTCTCCTTAGAACTGTTTACAGTGTGATAAATCGTTCCCCACACTATCTACTCTCA  444

Query  445  GAGGTCATCTTGGTAGATGATGCCAGTGAAAGAGATTTTCTCAAGTTGACATTAGAGAATTACGTGAAAAATTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAGGTCATCTTGGTAGATGATGCCAGTGAAAGAGATTTTCTCAAGTTGACATTAGAGAATTACGTGAAAAATTT  518

Query  519  AGAAGTGCCAGTAAAAATTATTAGGATGGAAGAACGCTCTGGGTTAATACGTGCCCGTCTTCGAGGAGCAGCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGAAGTGCCAGTAAAAATTATTAGGATGGAAGAACGCTCTGGGTTAATACGTGCCCGTCTTCGAGGAGCAGCTG  592

Query  593  CTTCAAAAGGGCAGGTCATAACTTTTCTTGATGCACACTGTGAATGCACGTTAGGATGGCTGGAGCCTTTGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTCAAAAGGGCAGGTCATAACTTTTCTTGATGCACACTGTGAATGCACGTTAGGATGGCTGGAGCCTTTGCTG  666

Query  667  GCAAGAATAAAGGAAGACAGGAAAACGGTTGTCTGCCCTATCATTGATGTGATTAGTGATGATACTTTTGAATA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCAAGAATAAAGGAAGACAGGAAAACGGTTGTCTGCCCTATCATTGATGTGATTAGTGATGATACTTTTGAATA  740

Query  741  TATGGCTGGGTCAGACATGACTTATGGGGGTTTTAACTGGAAACTGAATTTCCGCTGGTATCCTGTTCCCCAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TATGGCTGGGTCAGACATGACTTATGGGGGTTTTAACTGGAAACTGAATTTCCGCTGGTATCCTGTTCCCCAAA  814

Query  815  GAGAAATGGACAGGAGGAAAGGAGACAGAACATTACCTGTCAGGACCCCTACTATGGCTGGTGGCCTATTTTCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GAGAAATGGACAGGAGGAAAGGAGACAGAACATTACCTGTCAGGACCCCTACTATGGCTGGTGGCCTATTTTCT  888

Query  889  ATTGACAGAAACTACTTTGAAGAGATAGGAACTTACGATGCAGGAATGGATATCTGGGGTGGAGAGAATCTTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTGACAGAAACTACTTTGAAGAGATAGGAACTTACGATGCAGGAATGGATATCTGGGGTGGAGAGAATCTTGA  962

Query  963  AATGTCTTTTAGGATTTGGCAATGTGGAGGCTCCTTGGAGATTGTTACTTGCTCCCATGTTGGTCATGTTTTTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATGTCTTTTAGGATTTGGCAATGTGGAGGCTCCTTGGAGATTGTTACTTGCTCCCATGTTGGTCATGTTTTTC  1036

Query 1037  GGAAGGCAACTCCATACACTTTTCCTGGTGGCACTGGTCATGTCATCAACAAGAACAACAGGAGACTGGCAGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGAAGGCAACTCCATACACTTTTCCTGGTGGCACTGGTCATGTCATCAACAAGAACAACAGGAGACTGGCAGAA  1110

Query 1111  GTTTGGATGGATGAATTTAAAGATTTCTTCTACATCATATCCCCAGGTGTTGTCAAAGTGGATTATGGAGATGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTTTGGATGGATGAATTTAAAGATTTCTTCTACATCATATCCCCAGGTGTTGTCAAAGTGGATTATGGAGATGT  1184

Query 1185  GTCAGTCAGAAAAACACTAAGAGAAAATCTGAAGTGTAAGCCCTTTTCTTGGTACCTAGAAAACATCTATCCGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTCAGTCAGAAAAACACTAAGAGAAAATCTGAAGTGTAAGCCCTTTTCTTGGTACCTAGAAAACATCTATCCGG  1258

Query 1259  ACTCCCAGATCCCAAGACGTTATTACTCACTTGGTGAGATAAGAAATGTTGAAACCAATCAGTGTTTAGACAAC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTCCCAGATCCCAAGACGTTATTACTCACTTGGTGAGATAAGAAATGTTGAAACCAATCAGTGTTTAGACAAC  1332

Query 1333  ATGGGCCGCAAGGAAAATGAAAAAGTGGGTATATTCAACTGTCATGGTATGGGAGGAAATCAGGTATTTTCTTA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGGGCCGCAAGGAAAATGAAAAAGTGGGTATATTCAACTGTCATGGTATGGGAGGAAATCAGGTATTTTCTTA  1406

Query 1407  CACTGCTGACAAAGAAATCCGAACCGATGACTTGTGCTTGGATGTTTCTAGACTCAATGGACCTGTAATCATGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACTGCTGACAAAGAAATCCGAACCGATGACTTGTGCTTGGATGTTTCTAGACTCAATGGACCTGTAATCATGT  1480

Query 1481  TAAAATGCCACCATATGAGAGGAAATCAGTTATGGGAATATGATGCTGAGTCTTGTCTCTC---------AGTG  1545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   .|.|||.|         .||.
Sbjct 1481  TAAAATGCCACCATATGAGAGGAAATCAGTTATGGGAATATGATGCTGAG---AGACTCACGTTGCGACATGTT  1551

Query 1546  AACAAAGTAGCTGATGGCTCCCAGCATCCTACTGTGGAA-AC-----------------------CTGTAATGA  1595
            |||  ||||.|..|||.|| |.|..|.|||.|||..||| ||                       |||||.||.
Sbjct 1552  AAC--AGTAACCAATGTCT-CGATGAACCTTCTGAAGAAGACAAAATGGTGCCTACAATGCAGGACTGTAGTGG  1622

Query 1596  TAGCACTTTGCAAAAATGGCTACTAAGAAACTAT----------ACAAGAATGGAAATTTTTAGAAATATTTTT  1659
            .||||..|..|||.|.|||||.|||||.||| ||          |||                           
Sbjct 1623  AAGCAGATCCCAACAGTGGCTGCTAAGGAAC-ATGACCTTGGGCACA---------------------------  1668

Query 1660  GGGAATTCTACTGATTACATTCTC  1683
                                    
Sbjct 1669  ------------------------  1668