Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13040
- Subject:
- NM_001164493.1
- Aligned Length:
- 875
- Identities:
- 491
- Gaps:
- 372
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 MSRHHSRFERDYRIGWDRREWSVNGTHGATSVCSVTSGAGGSTASSLSARPGLLPLPVVPSRLPTPATAPAPCT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGSSEAITSLVVSSASAATTKAPGISKADNQSQGLTTSIRWGQTPVNQSTPWDTDEPPSKQMRESDNPGTGPWV 148
Query 1 ---------------------------------------------------MPGHYSLPQPPSQPLSSVVVNMP 23
.||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TTVAAGNQPSLITHSYGVTQPPTFSPAVNVQAPVIGVTPSLPPHVGPQLPLIPGHYSLPQPPSQPLSSVVVNMP 222
Query 24 AQALYASPQPLAVSTLPGVGQVARPGPTAVGNGHMAGPLLPPPPPAQPSATLPSGAPATNGPPTTDSAHGLQML 97
||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||..||||||||||||||||||
Sbjct 223 AQALYASPQPLAVSTLPGVGQVSRPGPTPVGNGHMAGPLLPPPPPAQPSAALPSSVPATNGPPTTDSAHGLQML 296
Query 98 RTIGVGKYEFTDPGHPREMLKELNQQRRAKAFTDLKIVVEGREFEVHQNVLASCSLYFKDLIQRSVQDSGQGGR 171
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|
Sbjct 297 RTIGVGKYEFTDPGHPKEMLKELNQQRRAKAFTDLKIVVEGREFEVHQNVLASCSLYFKDLIQRSVQDSSQSSR 370
Query 172 EKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAE 245
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 EKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAE 444
Query 246 AMQCSELYHMAKAFALQIFPEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRTQYAAE 319
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 445 AMQCSELYHMAKAFALQIFPEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRAQYAAE 518
Query 320 LLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAGVAEVIVLVGGR 393
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 LLAAVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAGVAEVIVLVGGR 592
Query 394 QMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGGMESGVTLADVWCYMSLLDNWNLV 467
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 QMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGGMESGVTLADVWCYMSLLDNWNLV 666
Query 468 SRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNVDHVER-------------------------------------- 503
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 SRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNVDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNE 740
Query 504 -------------------------------------------------------------------------- 503
Sbjct 741 AGRAAGVLQSYVPQTNTWSFIESPMIDNKYAPAVTLNGFVFILGGAYARATTIYDPEKGNIKAGPNMNHSRQFC 814
Query 504 ------------------------------------------------------------- 503
Sbjct 815 SAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALGNMEAYEPTTNTWTLLPHMPCPVFRHGCVVIKKYIQSG 875