Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_13040
Subject:
NM_001164493.1
Aligned Length:
875
Identities:
491
Gaps:
372

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  MSRHHSRFERDYRIGWDRREWSVNGTHGATSVCSVTSGAGGSTASSLSARPGLLPLPVVPSRLPTPATAPAPCT  74

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct  75  TGSSEAITSLVVSSASAATTKAPGISKADNQSQGLTTSIRWGQTPVNQSTPWDTDEPPSKQMRESDNPGTGPWV  148

Query   1  ---------------------------------------------------MPGHYSLPQPPSQPLSSVVVNMP  23
                                                              .||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  TTVAAGNQPSLITHSYGVTQPPTFSPAVNVQAPVIGVTPSLPPHVGPQLPLIPGHYSLPQPPSQPLSSVVVNMP  222

Query  24  AQALYASPQPLAVSTLPGVGQVARPGPTAVGNGHMAGPLLPPPPPAQPSATLPSGAPATNGPPTTDSAHGLQML  97
           ||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||..||||||||||||||||||
Sbjct 223  AQALYASPQPLAVSTLPGVGQVSRPGPTPVGNGHMAGPLLPPPPPAQPSAALPSSVPATNGPPTTDSAHGLQML  296

Query  98  RTIGVGKYEFTDPGHPREMLKELNQQRRAKAFTDLKIVVEGREFEVHQNVLASCSLYFKDLIQRSVQDSGQGGR  171
           ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|
Sbjct 297  RTIGVGKYEFTDPGHPKEMLKELNQQRRAKAFTDLKIVVEGREFEVHQNVLASCSLYFKDLIQRSVQDSSQSSR  370

Query 172  EKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAE  245
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  EKLELVLSNLQADVLELLLEFVYTGSLVIDSANAKTLLEAASKFQFHTFCKVCVSFLEKQLTASNCLGVLAMAE  444

Query 246  AMQCSELYHMAKAFALQIFPEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRTQYAAE  319
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 445  AMQCSELYHMAKAFALQIFPEVAAQEEILSISKDDFIAYVSNDSLNTKAEELVYETVIKWIKKDPATRAQYAAE  518

Query 320  LLAVVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAGVAEVIVLVGGR  393
           |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  LLAAVRLPFIHPSYLLNVVDNEELIKSSEACRDLVNEAKRYHMLPHARQEMQTPRTRPRLSAGVAEVIVLVGGR  592

Query 394  QMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGGMESGVTLADVWCYMSLLDNWNLV  467
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  QMVGMTQRSLVAVTCWNPQNNKWYPLASLPFYDREFFSVVSAGDNIYLSGGMESGVTLADVWCYMSLLDNWNLV  666

Query 468  SRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNVDHVER--------------------------------------  503
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                      
Sbjct 667  SRMTVPRCRHNSLVYDGKIYTLGGLGVAGNVDHVERYDTITNQWEAVAPLPKAVHSAAATVCGGKIYVFGGVNE  740

Query 504  --------------------------------------------------------------------------  503
                                                                                     
Sbjct 741  AGRAAGVLQSYVPQTNTWSFIESPMIDNKYAPAVTLNGFVFILGGAYARATTIYDPEKGNIKAGPNMNHSRQFC  814

Query 504  -------------------------------------------------------------  503
                                                                        
Sbjct 815  SAVVLDGKIYATGGIVSSEGPALGNMEAYEPTTNTWTLLPHMPCPVFRHGCVVIKKYIQSG  875