Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13061
- Subject:
- XM_017029254.2
- Aligned Length:
- 1804
- Identities:
- 1355
- Gaps:
- 425
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCTGTCTCCGCATCTCCAGTGATCTCTGCAACTTCCAGCGGCGCCGGCGTCCCGGGGGGCTTATTCCGGGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CGAACCCCTGTACTCGACTCCCAGAGAGCCCCCTCGTCTTACTCCTAATATGATCAATAGTTTCGTGGTTAATA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 ACCACAGCAACAGTGCCGGAGGCGGCGGCAGGGGCAACACCAACACCAACGAGTGCCGCATGGTCGACATGCAC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GGGATGAAGGTGGCTTCGTTCCTGATGGACGGCCAGGAACTGATCTGCCTGCCGCAAGTCTTTGATCTTTTTCT 296
Query 1 ----------ATGCCAGAGTTTCGCTCTGT-TGC-CCAGGCTGCAGTG--------------CAGTGGTGT--- 45
.||..||..||.|.|.|||| |.| |||.||||.||.| |.|||||||
Sbjct 297 CAAGCACCTGGTGGGAGGCTTGCACACTGTGTACACCAAGCTGAAGAGACTGGATATATCCCCCGTGGTGTGTA 370
Query 46 ----------------GATCTT-----GGCT-------------------------CGCTGC-AACTTCCGCCT 72
||||.| |||| |||||| |||| |.|
Sbjct 371 CTGTTGAGCAGGTCCGGATCCTCCGCGGGCTGGGGGCCATCCAGCCCGGGGTAAACCGCTGCAAACT----CAT 440
Query 73 C-CCAGGTTCAAGGGATTC------TTGTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGAATTACAGTTCAAGACCCGGCA 139
| ||||| ||.|..||| |||| ||| |||| |.||...|||..|||||||||||||||||
Sbjct 441 CACCAGG---AAAGACTTCGAAACTTTGT---TCA-----CCGA-TTGCACCAATGCCAGTTCAAGACCCGGCA 502
Query 140 GGCCCCCTAAGCGTTCTTTGGGAGTGTTGCAGGAAAATGCCCGCCTTCTGACCCATGCAGTCCCAGGCCTCTTA 213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 503 GGCCCCCTAAGCGTTCTTTGGGAGTGTTGCAGGAAAATGCCCGCCTTCTGACCCATGCAGTCCCAGGCCTCTTA 576
Query 214 TCGCCAGGACTTATCACTCCGACAGGTATAACAGCTGCAGCGATGGCTGAGGCGATGAAACTTCAGAAGATGAA 287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 TCGCCAGGACTTATCACTCCGACAGGTATAACAGCTGCAGCGATGGCTGAGGCGATGAAACTTCAGAAGATGAA 650
Query 288 GCTTATGGCTATGAACACTCTTCAGGGAAATGGAAGCCAAAATGGGACCGAATCAGAGCCTGATGATCTTAATT 361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 GCTTATGGCTATGAACACTCTTCAGGGAAATGGAAGCCAAAATGGGACCGAATCAGAGCCTGATGATCTTAATT 724
Query 362 CTAACACAGGTGGAAGTGAATCCTCCTGGGATAAAGATAAGATGCAGTCTCCATTTGCTGCACCTGGACCCCAA 435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 CTAACACAGGTGGAAGTGAATCCTCCTGGGATAAAGATAAGATGCAGTCTCCATTTGCTGCACCTGGACCCCAA 798
Query 436 CATGGAATTGCTCATGCAGCCCTAGCTGGCCAGCCAGGCATTGGGGGTGCTCCAACCCTCAATCCACTGCAGCA 509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 799 CATGGAATTGCTCATGCAGCCCTAGCTGGCCAGCCAGGCATTGGGGGTGCTCCAACCCTCAATCCACTGCAGCA 872
Query 510 GAACCACCTGCTAACCAATAGACTGGATCTGCCATTTATGATGATGCCTCATCCCCTACTTCCAGTCAGCTTAC 583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 873 GAACCACCTGCTAACCAATAGACTGGATCTGCCATTTATGATGATGCCTCATCCCCTACTTCCAGTCAGCTTAC 946
Query 584 CTCCTGCATCAGTTGCCATGGCAATGAATCAGATGAACCATCTCAATACTATTGCCAACATGGCTGCTGCAGCA 657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 947 CTCCTGCATCAGTTGCCATGGCAATGAATCAGATGAACCATCTCAATACTATTGCCAACATGGCTGCTGCAGCA 1020
Query 658 CAGATTCACAGTCCACTCTCCAGAGCTGGTACCTCTGTTATAAAGGAGCGGATCCCAGAGAGTCCTTCTCCTGC 731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021 CAGATTCACAGTCCACTCTCCAGAGCTGGTACCTCTGTTATAAAGGAGCGGATCCCAGAGAGTCCTTCTCCTGC 1094
Query 732 TCCTTCTCTAGAAGAGAATCATCGTCCTGGGAGCCAGACCTCTTCCCACACCAGCAGCAGTGTGTCCAGCTCTC 805
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095 TCCTTCTCTAGAAGAGAATCATCGTCCTGGGAGCCAGACCTCTTCCCACACCAGCAGCAGTGTGTCCAGCTCTC 1168
Query 806 CCTCTCAGATGGATCATCATTTGGAAAGAATGGAAGAGGTACCAGTTCAAATTCCAATAATGAAGTCACCCTTG 879
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169 CCTCTCAGATGGATCATCATTTGGAAAGAATGGAAGAGGTACCAGTTCAAATTCCAATAATGAAGTCACCCTTG 1242
Query 880 GACAAGATACAGCTGACTCCTGGGCAGGCATTGCCCGCTGGATTCCCTGGACCATTCATTTTTGCTGATAGTCT 953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1243 GACAAGATACAGCTGACTCCTGGGCAGGCATTGCCCGCTGGATTCCCTGGACCATTCATTTTTGCTGATAGTCT 1316
Query 954 GTCCTCCGTGGAGACTCTGTTGACCAACATTCAG------------------------------GGTCTGCTGA 997
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1317 GTCCTCCGTGGAGACTCTGTTGACCAACATTCAGGTCAACAATATTTCTATAAACAAAATAAATGGTCTGCTGA 1390
Query 998 AAGTTGCTTTGGATAATGCTCGCATCCAGGAGAAGCAGATTCAACAAGAAAAGAAGGAGCTGCGACTGGAGCTC 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1391 AAGTTGCTTTGGATAATGCTCGCATCCAGGAGAAGCAGATTCAACAAGAAAAGAAGGAGCTGCGACTGGAGCTC 1464
Query 1072 TATAGAGAGAGAGAAATTAGAGAAAACCTTGAAAGACAACTTGCAGTTGAGCTTCAAAGCAGAACTACTATGCA 1145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1465 TATAGAGAGAGAGAAATTAGAGAAAACCTTGAAAGACAACTTGCAGTTGAGCTTCAAAGCAGAACTACTATGCA 1538
Query 1146 AAAGCGCCTGAAGAAGGAGAAAAAAACCAAGAGAAAATTGCAGGAAGCCTTGGAATTTGAATCAAAGCGCCGGG 1219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1539 AAAGCGCCTGAAGAAGGAGAAAAAAACCAAGAGAAAATTGCAGGAAGCCTTGGAATTTGAATCAAAGCGCCGGG 1612
Query 1220 AGCAAGTGGAGCAGGCACTTAAGCAAGCCACCACTAGTGACAGTGGCCTGAGGATGTTAAAAGATACTGGAATT 1293
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1613 AGCAAGTGGAGCAGGCACTTAAGCAAGCCACCACTAGTGACAGTGGCCTGAGGATGTTAAAAGATACTGGAATT 1686
Query 1294 CCAGATATTGAAATAGAAAACAATGGGACTCCTCATGATAGTGCTGCTATGCAAGGAGGTAACTATTACTGTTT 1367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1687 CCAGATATTGAAATAGAAAACAATGGGACTCCTCATGATAGTGCTGCTATGCAAGGAGGTAACTATTACTGTTT 1760
Query 1368 AGAAATGGCACAACAGTTGTATTCAGCC 1395
||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1761 AGAAATGGCACAACAGTTGTATTCAGCC 1788
