Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13291
- Subject:
- XM_017014298.2
- Aligned Length:
- 3492
- Identities:
- 3107
- Gaps:
- 384
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCCTTGGCTGTCCCGTGTGTGACCTGGATGTCATGGTGCCACCTCCTTCCTGGGAGCAGTAAGGATTCCAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCCATGGAGGACAGATGAGGAAATGGACCCAAGAGGTTTGGGTGTCGCAGCAACACTAGATCAAAGATGGGATG 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CTGGGGCACATCTCTTGCCCTCCCTGGCAGGCCTCAGTTTCTCCCCTGTAAAGCGGGGTGAGGTCAGCATCTGC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CTCTTGGGCTCGTGGAGATTCTGTGAGGTGACTTGTGTGGTGGTTCATGTGACGCATGGCCCAAGGTCCCATCT 296
Query 1 -ATGCCGAGGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACC 73
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Sbjct 297 GATGCCGAGGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCTGGACC 370
Query 74 TCAGCATGGAGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTG 147
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Sbjct 371 TCAGCATGGAGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCGAGGTG 444
Query 148 ACGACGTCATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCG 221
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Sbjct 445 ACGACGTCATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAACCTCCG 518
Query 222 GCGAGCGGTGCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCA 295
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Sbjct 519 GCGAGCGGTGCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGAGGCCA 592
Query 296 AGGACCTGCCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGC 369
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Sbjct 593 AGGACCTGCCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCACGGGC 666
Query 370 AAGCTCAAGACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCAC 443
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Sbjct 667 AAGCTCAAGACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACGGTCAC 740
Query 444 TGTCCACCTGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTAC 517
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Sbjct 741 TGTCCACCTGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAGCCTAC 814
Query 518 CTGCTGCCTCGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGC 591
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Sbjct 815 CTGCTGCCTCGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGGGCGGC 888
Query 592 AAGGGCCCTGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAA 665
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Sbjct 889 AAGGGCCCTGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATGTACAA 962
Query 666 AGAGTTCGCTGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGA 739
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Sbjct 963 AGAGTTCGCTGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGCCAAGA 1036
Query 740 CCAAGGAGGAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGAC 813
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Sbjct 1037 CCAAGGAGGAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGACAGAC 1110
Query 814 CTGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAA 887
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Sbjct 1111 CTGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCCACCAA 1184
Query 888 GGCCATTGAGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGC 961
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Sbjct 1185 GGCCATTGAGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAAAGCGC 1258
Query 962 TGTATGAGTCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGC 1035
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Sbjct 1259 TGTATGAGTCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACCAGGGC 1332
Query 1036 AACCTCAAGATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAA 1109
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Sbjct 1333 AACCTCAAGATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAGTTGAA 1406
Query 1110 AGAGGTGTTTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCG 1183
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Sbjct 1407 AGAGGTGTTTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCATCAGCG 1480
Query 1184 CCTCCCTCTTCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCT 1257
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Sbjct 1481 CCTCCCTCTTCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGTACCCT 1554
Query 1258 GATGACCGCACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGG 1331
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Sbjct 1555 GATGACCGCACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAATTTGG 1628
Query 1332 CAGCAAGGAGGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGC 1405
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Sbjct 1629 CAGCAAGGAGGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTTCCTGC 1702
Query 1406 TGGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTC 1479
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Sbjct 1703 TGGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCGAGCTC 1776
Query 1480 TCCAGCCTGCACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCT 1553
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Sbjct 1777 TCCAGCCTGCACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGACCCCT 1850
Query 1554 GCCTCGGATCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACC 1627
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Sbjct 1851 GCCTCGGATCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAATGACC 1924
Query 1628 TGGCCTCCACACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTT 1701
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Sbjct 1925 TGGCCTCCACACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACGATCTT 1998
Query 1702 TCCGGTCTGATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTC 1775
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Sbjct 1999 TCCGGTCTGATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACAAGGTC 2072
Query 1776 CTCCGGGGTCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCA 1849
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Sbjct 2073 CTCCGGGGTCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGATGGCCA 2146
Query 1850 ACGGTGGCAAGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCG 1923
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Sbjct 2147 ACGGTGGCAAGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCCCGGCG 2220
Query 1924 GGCCCCGACGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAAC 1997
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Sbjct 2221 GGCCCCGACGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGGGCAAC 2294
Query 1998 CCCAGTGAACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAGGCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGG 2071
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Sbjct 2295 CCCAGTGAACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAGGCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTCCGAGG 2368
Query 2072 GCGCGCCAGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTG 2145
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Sbjct 2369 GCGCGCCAGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTGGCCTG 2442
Query 2146 CCGCTGTCACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGA 2219
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Sbjct 2443 CCGCTGTCACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAACAGCGA 2516
Query 2220 GGAGTTGGCGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGC 2293
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Sbjct 2517 GGAGTTGGCGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGGTGAGC 2590
Query 2294 TGGCACGGCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCC 2367
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Sbjct 2591 TGGCACGGCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTGGCCCC 2664
Query 2368 CAGAGGAGGATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAA 2441
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Sbjct 2665 CAGAGGAGGATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCCCCCAA 2738
Query 2442 CCTGCTGAGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCC 2515
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Sbjct 2739 CCTGCTGAGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGTGGGCC 2812
Query 2516 CCAGTACCCGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCAC 2589
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Sbjct 2813 CCAGTACCCGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAGTGCAC 2886
Query 2590 AAGCAGGGCCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCA 2663
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Sbjct 2887 AAGCAGGGCCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAACGCGCA 2960
Query 2664 GTTGTTAGAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCC 2737
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Sbjct 2961 GTTGTTAGAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCTCAGCC 3034
Query 2738 AAGCAGAAAAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACC 2811
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Sbjct 3035 AAGCAGAAAAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATGAGACC 3108
Query 2812 CTGTTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGA 2885
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Sbjct 3109 CTGTTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGCGAGGA 3182
Query 2886 GCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGG 2959
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Sbjct 3183 GCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGTGGAGG 3256
Query 2960 AAGAACTGAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAG 3033
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Sbjct 3257 AAGAACTGAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCCAGGAG 3330
Query 3034 AAGCGCATTGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGA-GTA-TG 3105
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Sbjct 3331 AAGCGCATTGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGAGGTACAG 3404
Query 3106 CAT----------------------------------------------------------------------- 3108
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Sbjct 3405 CATGCAAGCCCGTAACGGCATCTCCCCCACCAACCCCACCAAATTGCAGATTACTGAGAACGGCGAGTTCAGAA 3478
Query 3109 -------------- 3108
Sbjct 3479 ACAGCAGCAATTGT 3492