Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13291
- Subject:
- XM_017014299.1
- Aligned Length:
- 3423
- Identities:
- 3107
- Gaps:
- 315
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCAGCCAGGCCAGAGCTCAGCGCTGGGTGCAGTCACTGCGTCTTTGAAAATCTCGCTTCCCATCTTTGTTAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGTCTGGGCGGCAGGCCACCCGGTTTGCTGCCTTCCTCCCTCCACCGGGCCCCTGCCTTCGGCTGTCTTCCCCA 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGAACATGCCCTTCTCCGCGCTTTCCTTGGCGGGGGTCAGGACCCTCTGCACCCGCATGCGGGGGCTTGTGTCC 222
Query 1 ------ATGCCGAGGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCT 68
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Sbjct 223 CATCTGATGCCGAGGCTGAAGGAGTCTCGCTCCCACGAGTCCCTGCTCAGCCCCAGCAGTGCGGTGGAGGCGCT 296
Query 69 GGACCTCAGCATGGAGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCG 142
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Sbjct 297 GGACCTCAGCATGGAGGAAGAGGTGGTCATCAAGCCCGTGCACAGCAGCATCCTTGGCCAGGACTACTGCTTCG 370
Query 143 AGGTGACGACGTCATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAAC 216
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Sbjct 371 AGGTGACGACGTCATCAGGAAGCAAGTGCTTTTCCTGCCGGTCTGCAGCTGAGCGGGATAAGTGGATGGAGAAC 444
Query 217 CTCCGGCGAGCGGTGCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGA 290
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Sbjct 445 CTCCGGCGAGCGGTGCATCCCAACAAGGACAACAGCCGGCGTGTGGAGCACATCCTGAAGCTGTGGGTGATCGA 518
Query 291 GGCCAAGGACCTGCCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCA 364
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Sbjct 519 GGCCAAGGACCTGCCAGCCAAGAAGAAGTACCTGTGCGAGCTGTGCCTGGACGATGTGCTCTATGCCCGCACCA 592
Query 365 CGGGCAAGCTCAAGACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACG 438
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Sbjct 593 CGGGCAAGCTCAAGACGGACAATGTTTTCTGGGGCGAGCACTTCGAGTTCCACAACTTGCCGCCTCTGCGCACG 666
Query 439 GTCACTGTCCACCTGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAG 512
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Sbjct 667 GTCACTGTCCACCTGTACCGGGAGACCGACAAGAAGAAGAAGAAGGAGCGCAACAGTTACCTGGGCCTGGTGAG 740
Query 513 CCTACCTGCTGCCTCGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGG 586
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Sbjct 741 CCTACCTGCTGCCTCGGTGGCCGGGCGGCAGTTCGTGGAGAAGTGGTACCCGGTGGTGACGCCCAACCCCAAGG 814
Query 587 GCGGCAAGGGCCCTGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATG 660
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Sbjct 815 GCGGCAAGGGCCCTGGACCCATGATCCGCATCAAGGCGCGCTACCAAACCATCACCATCCTGCCCATGGAGATG 888
Query 661 TACAAAGAGTTCGCTGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGC 734
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Sbjct 889 TACAAAGAGTTCGCTGAGCACATCACCAACCACTACCTGGGGCTGTGTGCAGCCCTCGAGCCCATCCTCAGTGC 962
Query 735 CAAGACCAAGGAGGAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGA 808
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Sbjct 963 CAAGACCAAGGAGGAGATGGCATCTGCCCTGGTGCACATCCTGCAGAGCACGGGCAAGGTGAAGGACTTCCTGA 1036
Query 809 CAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCC 882
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Sbjct 1037 CAGACCTGATGATGTCAGAGGTGGACCGCTGCGGGGACAACGAGCACCTCATCTTCCGGGAGAACACACTGGCC 1110
Query 883 ACCAAGGCCATTGAGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAA 956
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Sbjct 1111 ACCAAGGCCATTGAGGAGTACCTCAAGCTAGTGGGCCAGAAGTACCTGCAGGACGCCCTAGGTGAGTTCATCAA 1184
Query 957 AGCGCTGTATGAGTCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACC 1030
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Sbjct 1185 AGCGCTGTATGAGTCAGATGAGAACTGCGAAGTGGATCCCAGCAAGTGCTCGGCCGCTGACCTCCCAGAGCACC 1258
Query 1031 AGGGCAACCTCAAGATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAG 1104
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Sbjct 1259 AGGGCAACCTCAAGATGTGCTGCGAGCTGGCCTTCTGCAAGATCATCAACTCCTACTGTGTCTTCCCACGGGAG 1332
Query 1105 TTGAAAGAGGTGTTTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCAT 1178
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Sbjct 1333 TTGAAAGAGGTGTTTGCCTCGTGGAGGCAGGAGTGCAGCAGTCGCGGCCGCCCGGACATCAGTGAGCGGCTCAT 1406
Query 1179 CAGCGCCTCCCTCTTCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGT 1252
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Sbjct 1407 CAGCGCCTCCCTCTTCCTGCGCTTCCTCTGCCCAGCCATCATGTCGCCCTCACTCTTCAACCTGCTGCAGGAGT 1480
Query 1253 ACCCTGATGACCGCACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAA 1326
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Sbjct 1481 ACCCTGATGACCGCACTGCCCGCACCCTCACCCTCATCGCCAAGGTCACCCAGAACCTGGCCAACTTTGCCAAA 1554
Query 1327 TTTGGCAGCAAGGAGGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTT 1400
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Sbjct 1555 TTTGGCAGCAAGGAGGAATACATGTCCTTCATGAACCAGTTCCTAGAGCATGAGTGGACCAACATGCAGCGCTT 1628
Query 1401 CCTGCTGGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCG 1474
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Sbjct 1629 CCTGCTGGAGATCTCCAACCCCGAGACCCTCTCCAATACAGCCGGCTTCGAGGGCTACATCGACCTGGGCCGCG 1702
Query 1475 AGCTCTCCAGCCTGCACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGA 1548
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Sbjct 1703 AGCTCTCCAGCCTGCACTCACTGCTCTGGGAGGCCGTCAGCCAGCTGGAGCAGAGCATAGTATCCAAACTGGGA 1776
Query 1549 CCCCTGCCTCGGATCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAA 1622
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Sbjct 1777 CCCCTGCCTCGGATCCTGAGGGACGTCCACACAGCACTGAGCACCCCAGGTAGCGGGCAGCTCCCAGGGACCAA 1850
Query 1623 TGACCTGGCCTCCACACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACG 1696
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Sbjct 1851 TGACCTGGCCTCCACACCGGGCTCTGGCAGCAGCAGCATCTCAGCTGGGCTGCAGAAGATGGTGATTGAGAACG 1924
Query 1697 ATCTTTCCGGTCTGATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACA 1770
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Sbjct 1925 ATCTTTCCGGTCTGATAGATTTCACCCGGTTACCGTCTCCAACCCCCGAAAACAAGGACTTGTTTTTTGTCACA 1998
Query 1771 AGGTCCTCCGGGGTCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGAT 1844
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Sbjct 1999 AGGTCCTCCGGGGTCCAGCCCTCACCTGCCCGCAGCTCGAGTTACTCGGAAGCCAACGAGCCTGATCTTCAGAT 2072
Query 1845 GGCCAACGGTGGCAAGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCC 1918
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Sbjct 2073 GGCCAACGGTGGCAAGAGCCTCTCCATGGTGGACCTCCAGGACGCCCGCACGCTGGATGGGGAGGCAGGCTCCC 2146
Query 1919 CGGCGGGCCCCGACGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGG 1992
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Sbjct 2147 CGGCGGGCCCCGACGTCCTCCCCACAGATGGGCAGGCCGCTGCAGCTCAGCTGGTGGCCGGGTGGCCGGCCCGG 2220
Query 1993 GCAACCCCAGTGAACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAGGCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTC 2066
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Sbjct 2221 GCAACCCCAGTGAACCTGGCAGGGCTGGCCACGGTGCGGCGGGCAGGCCAGACACCAACCACACCAGGCACCTC 2294
Query 2067 CGAGGGCGCGCCAGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTG 2140
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Sbjct 2295 CGAGGGCGCGCCAGGCCGGCCCCAGCTGTTGGCACCGCTCTCCTTCCAGAACCCTGTGTACCAGATGGCGGCTG 2368
Query 2141 GCCTGCCGCTGTCACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAAC 2214
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Sbjct 2369 GCCTGCCGCTGTCACCCCGTGGCCTTGGCGACTCAGGCTCTGAGGGCCACAGCTCCCTGAGCTCACACAGCAAC 2442
Query 2215 AGCGAGGAGTTGGCGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGG 2288
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Sbjct 2443 AGCGAGGAGTTGGCGGCTGCTGCCAAGCTGGGAAGTTTCAGCACTGCCGCGGAGGAGCTGGCTCGGCGGCCCGG 2516
Query 2289 TGAGCTGGCACGGCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTG 2362
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Sbjct 2517 TGAGCTGGCACGGCGACAGATGTCACTGACTGAAAAAGGCGGGCAGCCCACGGTGCCACGGCAGAACAGTGCTG 2590
Query 2363 GCCCCCAGAGGAGGATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCC 2436
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Sbjct 2591 GCCCCCAGAGGAGGATCGACCAGCCTCCGCCCCCACCCCCGCCGCCACCTCCTGCCCCCCGCGGCCGGACGCCC 2664
Query 2437 CCCAACCTGCTGAGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGT 2510
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Sbjct 2665 CCCAACCTGCTGAGCACCCTGCAGTACCCAAGACCCTCAAGCGGAACCCTGGCGTCGGCCTCACCTGATTGGGT 2738
Query 2511 GGGCCCCAGTACCCGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAG 2584
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Sbjct 2739 GGGCCCCAGTACCCGCCTGAGGCAGCAGTCCTCTTCCTCCAAGGGGGACAGCCCAGAACTGAAGCCACGGGCAG 2812
Query 2585 TGCACAAGCAGGGCCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAAC 2658
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Sbjct 2813 TGCACAAGCAGGGCCCTTCACCTGTGAGCCCCAATGCCCTGGACCGCACAGCCGCTTGGCTCTTGACCATGAAC 2886
Query 2659 GCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCT 2732
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Sbjct 2887 GCGCAGTTGTTAGAAGACGAGGGCCTGGGCCCAGACCCCCCCCACAGGGATAGGCTAAGGAGTAAGGACGAGCT 2960
Query 2733 CAGCCAAGCAGAAAAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATG 2806
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Sbjct 2961 CAGCCAAGCAGAAAAGGACCTGGCGGTGCTGCAGGACAAGCTGCGAATCTCCACCAAGAAGCTGGAGGAGTATG 3034
Query 2807 AGACCCTGTTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGC 2880
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Sbjct 3035 AGACCCTGTTCAAGTGCCAGGAGGAGACGACGCAGAAGCTGGTGCTGGAGTACCAGGCACGGCTGGAGGAGGGC 3108
Query 2881 GAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGT 2954
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Sbjct 3109 GAGGAGCGGCTGCGGCGGCAGCAGGAGGACAAGGACATCCAGATGAAGGGCATCATCAGCAGGTTGATGTCCGT 3182
Query 2955 GGAGGAAGAACTGAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCC 3028
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Sbjct 3183 GGAGGAAGAACTGAAGAAGGACCACGCAGAGATGCAAGCGGCTGTGGACTCCAAACAGAAGATCATTGATGCCC 3256
Query 3029 AGGAGAAGCGCATTGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGA-G 3101
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Sbjct 3257 AGGAGAAGCGCATTGCCTCGTTGGATGCCGCCAATGCCCGCCTCATGAGTGCCCTGACCCAGCTGAAAGAGAGG 3330
Query 3102 TA-TGCAT------------------------------------------------------------------ 3108
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Sbjct 3331 TACAGCATGCAAGCCCGTAACGGCATCTCCCCCACCAACCCCACCAAATTGCAGATTACTGAGAACGGCGAGTT 3404
Query 3109 ------------------- 3108
Sbjct 3405 CAGAAACAGCAGCAATTGT 3423