Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13317
• Subject: NM_001145727.3
• Aligned Length: 975
• Identities: 872
• Gaps: 102

Alignment

Query   1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                     
Sbjct   1  ATGCAACAGCCAGTGAGAGCAGGAGACATCGGTGTTTCCAGAGTCCAGACCCACCACAATGCCAGCCCCTTCTC  74

Query   1  ----------------------------ATGATTGGGGATGGAGAAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATT  46
                                       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  AGTTCCGAAGAAACAGGATGAATCACCCATGATTGGGGATGGAGAAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATT  148

Query  47  CAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTCAGAAAACTTTAAAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTT  120
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTCAGAAAACTTTAAAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTT  222

Query 121  GGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTTGAAATAGCTGAAGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCT  194
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  GGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTTGAAATAGCTGAAGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCT  296

Query 195  CATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAATTGGAGATCATATTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCA  268
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAATTGGAGATCATATTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCA  370

Query 269  TTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAATGCAGGCAAATTCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCT  342
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAATGCAGGCAAATTCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCT  444

Query 343  GAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTTTGGAAGGAACAAGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTAT  416
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTTTGGAAGGAACAAGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTAT  518

Query 417  AACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCATTGCGTGGTACACCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAA  490
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  AACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCATTGCGTGGTACACCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAA  592

Query 491  AATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTTCAGTAGTATCTCCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGG  564
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  AATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTTCAGTAGTATCTCCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGG  666

Query 565  ACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAACAAGATCAACCTAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGA  638
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  ACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAACAAGATCAACCTAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGA  740

Query 639  ACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGAAATCCCACCAACCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCC  712
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  ACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGAAATCCCACCAACCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCC  814

Query 713  AGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTCCTCTGATTGAACCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGA  786
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815  AGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTCCTCTGATTGAACCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGA  888

Query 787  TTGGATAGACAGCCCAGGTCTCGGTCAACCAGACCTAATCGAGCCTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGA  860
           ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889  TTGGATAGACAGCCCAGGACTCGGTCAACCAGACCTAATCGAGCCTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGA  962

Query 861  GTCACAAAAGCAA  873
           |||||||||||||
Sbjct 963  GTCACAAAAGCAA  975