Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13317
- Subject:
- NM_152590.3
- Aligned Length:
- 1164
- Identities:
- 872
- Gaps:
- 291
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCTTGAAGGTAGTTGGATTAACAGAAGAGAAGACAAACTTGGAGTATATTCTTTAGTACATTTTTCCCCAAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GATGTTGGGTTCAGTTGCCACAACACTGCCATTGTCATCTTCAAATTCCAGTGGAATGCCTCTTGGTTACTATC 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TGTCTAGTCCTCAGATTAGTAGAGTAACTATATCAACAACTGGACAATTGACTTCTAAAGCTACTGTAGGTAGC 222
Query 1 ---------------------------------------------------------------------ATGAT 5
|||||
Sbjct 223 TGTTCCAGAGTGGAAAACAGCTTGGATGCCAGCCCCTTCTCAGTTCCGAAGAAACAGGATGAATCACCCATGAT 296
Query 6 TGGGGATGGAGAAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATTCAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTC 79
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGGGGATGGAGAAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATTCAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTC 370
Query 80 AGAAAACTTTAAAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTTGGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTT 153
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGAAAACTTTAAAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTTGGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTT 444
Query 154 GAAATAGCTGAAGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCTCATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAAT 227
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAAATAGCTGAAGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCTCATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAAT 518
Query 228 TGGAGATCATATTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCATTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAA 301
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGGAGATCATATTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCATTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAA 592
Query 302 TGCAGGCAAATTCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCTGAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTT 375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGCAGGCAAATTCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCTGAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTT 666
Query 376 TGGAAGGAACAAGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTATAACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCAT 449
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGGAAGGAACAAGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTATAACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCAT 740
Query 450 TGCGTGGTACACCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAAAATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTT 523
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCGTGGTACACCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAAAATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTT 814
Query 524 CAGTAGTATCTCCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGGACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAA 597
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CAGTAGTATCTCCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGGACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAA 888
Query 598 CAAGATCAACCTAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGAACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGA 671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAAGATCAACCTAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGAACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGA 962
Query 672 AATCCCACCAACCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCCAGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTC 745
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AATCCCACCAACCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCCAGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTC 1036
Query 746 CTCTGATTGAACCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGATTGGATAGACAGCCCAGGTCTCGGTCAACCAGA 819
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1037 CTCTGATTGAACCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGATTGGATAGACAGCCCAGGACTCGGTCAACCAGA 1110
Query 820 CCTAATCGAGCCTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGAGTCACAAAAGCAA 873
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCTAATCGAGCCTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGAGTCACAAAAGCAA 1164