Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13317
- Subject:
- XM_011520576.2
- Aligned Length:
- 1227
- Identities:
- 872
- Gaps:
- 354
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAAAGATACACAAGACATTCAGGAAGCTTCGAAGGCAATGCAGAATAAAGTCCATGAGCAGGAAGATAAGAA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TGAGAAACAAAAACAAAGAGAAGACAAACTTGGAGTATATTCTTTAGTACATTTTTCCCCAAAGATGTTGGGTT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CAGTTGCCACAACACTGCCATTGTCATCTTCAAATTCCAGTGGAATGCCTCTTGGTTACTATCTGTCTAGTCCT 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 CAGATTAGTAGAGTAACTATATCAACAACTGGACAATTGACTTCTAAAGCTACTGTAGGTAGCTGTTCCAGAGT 296
Query 1 ----------------------------------------------------------ATGATTGGGGATGGAG 16
||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAAAACAGCTTGGATGCCAGCCCCTTCTCAGTTCCGAAGAAACAGGATGAATCACCCATGATTGGGGATGGAG 370
Query 17 AAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATTCAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTCAGAAAACTTTA 90
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATTCAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTCAGAAAACTTTA 444
Query 91 AAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTTGGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTTGAAATAGCTGA 164
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTTGGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTTGAAATAGCTGA 518
Query 165 AGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCTCATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAATTGGAGATCATA 238
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCTCATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAATTGGAGATCATA 592
Query 239 TTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCATTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAATGCAGGCAAAT 312
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCATTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAATGCAGGCAAAT 666
Query 313 TCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCTGAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTTTGGAAGGAACA 386
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCTGAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTTTGGAAGGAACA 740
Query 387 AGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTATAACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCATTGCGTGGTACA 460
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTATAACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCATTGCGTGGTACA 814
Query 461 CCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAAAATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTTCAGTAGTATCT 534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAAAATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTTCAGTAGTATCT 888
Query 535 CCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGGACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAACAAGATCAACC 608
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGGACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAACAAGATCAACC 962
Query 609 TAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGAACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGAAATCCCACCAA 682
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGAACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGAAATCCCACCAA 1036
Query 683 CCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCCAGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTCCTCTGATTGAA 756
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCCAGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTCCTCTGATTGAA 1110
Query 757 CCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGATTGGATAGACAGCCCAGGTCTCGGTCAACCAGACCTAATCGAGC 830
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGATTGGATAGACAGCCCAGGACTCGGTCAACCAGACCTAATCGAGC 1184
Query 831 CTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGAGTCACAAAAGCAA 873
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGAGTCACAAAAGCAA 1227