Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13317
• Subject: XM_011520582.1
• Aligned Length: 1089
• Identities: 872
• Gaps: 216

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTGGGTTCAGTTGCCACAACACTGCCATTGTCATCTTCAAATTCCAGTGGAATGCCTCTTGGTTACTATCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GTCTAGTCCTCAGATTAGTAGAGTAACTATATCAACAACTGGACAATTGACTTCTAAAGCTACTGTAGGTAGCT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------ATGATT  6
                                                                                ||||||
Sbjct  149  GTTCCAGAGTGGAAAACAGCTTGGATGCCAGCCCCTTCTCAGTTCCGAAGAAACAGGATGAATCACCCATGATT  222

Query    7  GGGGATGGAGAAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATTCAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTCA  80
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGGATGGAGAAGATTATTTCCTTTCTTTGTTTGGTGATTCAAAGAAACTTACAGCACACTCAAACTACACTCA  296

Query   81  GAAAACTTTAAAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTTGGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTTG  154
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAAACTTTAAAATACTTTTCTATGATTCTTGAAGAAGTTGGCCAATTTACCTCCAGTTCTCTTGGAGATGTTG  370

Query  155  AAATAGCTGAAGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCTCATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAATT  228
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAATAGCTGAAGTGAATGTCAAGGGTTTGTTCGTGAAGCTCATTAACTCTTCCCTTGACAAAGAAATGGCAATT  444

Query  229  GGAGATCATATTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCATTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAAT  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAGATCATATTCTCCAGCAAAATGTGAATGGACAAACCATTTCTTTGTACCGATTCCTTCCAAACATCGTAAT  518

Query  303  GCAGGCAAATTCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCTGAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTTT  376
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGGCAAATTCCACAGTAACAGTGTGGGCAGCAGCATCTGAAGCAAAGCATCAACCTCCATCAGATTTTCTTT  592

Query  377  GGAAGGAACAAGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTATAACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCATT  450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGAAGGAACAAGACAAGTTTAGAGCAAGTCCTGATTGTATAACAATCCTGTGCAAACCGAACGGTCAAGCCATT  666

Query  451  GCGTGGTACACCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAAAATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTTC  524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCGTGGTACACCCCTATCCACTGGAAGCAAGCGTGGGAAAAATTAGATGCTGACGTTGAATTTAACAGATGTTC  740

Query  525  AGTAGTATCTCCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGGACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAAC  598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTAGTATCTCCAACATTCCGAAAGCGTGTGTTTCAGTGGACAGCATCTACAGCTACAATAACTAAAGAAAAAC  814

Query  599  AAGATCAACCTAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGAACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGAA  672
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGATCAACCTAAGAAAGATATCTCAAATTATCAGGTGGAACAAGCTCAAGTTCTTCTTAAGAGAGAGAAGGAA  888

Query  673  ATCCCACCAACCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCCAGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTCC  746
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATCCCACCAACCGTTTTCCCTAATCGCAGCCCTTGGTGCCAGAATCCCTATGTCTCTGCACATCCTTACTGTCC  962

Query  747  TCTGATTGAACCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGATTGGATAGACAGCCCAGGTCTCGGTCAACCAGAC  820
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  963  TCTGATTGAACCACACAATACATCCACCGCTGGAGGCAGATTGGATAGACAGCCCAGGACTCGGTCAACCAGAC  1036

Query  821  CTAATCGAGCCTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGAGTCACAAAAGCAA  873
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTAATCGAGCCTCAGGGTCTAAGAAAAAGAAGACATCTGAGTCACAAAAGCAA  1089