Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13437
- Subject:
- XM_011519393.3
- Aligned Length:
- 1515
- Identities:
- 1093
- Gaps:
- 420
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAGTTCTCCGAGAGGAAAAGAAGCAGGAAATCCCAGAGCTTCAAACTGGTGAGCCGAGGAGATGAAAGCAT 74
Query 1 -------------------------ATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGTTG 49
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAAATAAAAAAGCAAATTACAGGGATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGTTG 148
Query 50 GCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCTCT 123
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCTCT 222
Query 124 GCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAGTT 197
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAGTT 296
Query 198 CTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAATGGTATGG 271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAATGGTATGG 370
Query 272 TTGTCAACAAACATTCAGAAGGCTCTCATGGGGGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACTGC 345
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTGTCAACAAACATTCAGAAGGCTCTCATGGGGGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACTGC 444
Query 346 TGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAAAT 419
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAAAT 518
Query 420 TCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTCAC 493
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTCAC 592
Query 494 GAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTGGG 567
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTGGG 666
Query 568 TCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCGGA 641
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCGGA 740
Query 642 GGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAACTTGCTGAAG 715
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAACTTGCTGAAG 814
Query 716 GCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGAAGCCTTCTG 789
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGAAGCCTTCTG 888
Query 790 TTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAAGAGGAAAAG 863
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAAGAGGAAAAG 962
Query 864 AGGACTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAGAAAAGTACT 937
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGGACTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAGAAAAGTACT 1036
Query 938 GTACAGCTAACCATGTGGATAAGCTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTGCAGATTCTACAGGATCAAATTAAACTG 1011
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTACAGCTAACCATGTGGATAAGCTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTACAGATTCTACAGGATCAAATTAAACTG 1110
Query 1012 GCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGGCT---CAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCATTGCTCTACC 1082
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGGCTCAGCAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCATTGCTCTACC 1184
Query 1083 ACCAACA-------GTGGTC------------------------------------------------------ 1095
||||||| |||||.
Sbjct 1185 ACCAACAGGTGCTTGTGGTGGGCCCTGCACTGTTCTGCCGGGTGGGAGTGCAGCGGTGACCCTAGTCTTGCAGA 1258
Query 1096 -------------------------------------------------------------------------- 1095
Sbjct 1259 GCTCACCTCAGACAATGTCACAAGAAAAGGGACAGATGGCAGAACCCTGGGAGGAGCAGCATCTCGTGCTCCTG 1332
Query 1096 -------------------------------------------------------------------------- 1095
Sbjct 1333 AACAACCTTACCAGAGACAGAGCTGAAACAGGAGCTTTGTCCCAAACCAGCCAAGACTTCAAGCACCATTCATT 1406
Query 1096 -------------------------------------------------------------------------- 1095
Sbjct 1407 CCTCATAACTCAGGTCTCAGCTACACTTCATCATCAGAGAGGGATTCGCAACTTTCCCACGCCAGGCTCAGCCA 1480
Query 1096 ----------------------------------- 1095
Sbjct 1481 AGTCTCTTACCCTTCACATCTCTTGCCTCTCTCTC 1515