Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13437
• Subject: XM_011519412.1
• Aligned Length: 1122
• Identities: 885
• Gaps: 237

Alignment

Query    1  ---------------------------ATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGT  47
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAATAAAAAAGCAAATTACAGGGATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGT  74

Query   48  TGGCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCT  121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGGCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAAGAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCT  148

Query  122  CTGCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAG  195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCACCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAG  222

Query  196  TTCTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAATGGTAT  269
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCTCAGGGCAGTATGGCACCCGTTCTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAATGGTAT  296

Query  270  GGTTGTCAACAAACATTCAGAAGGCTCTCATGGGGGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACT  343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTTGTCAACAAACATTCAGAAGGCTCTCATGGGGGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACT  370

Query  344  GCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAA  417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAACGTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAA  444

Query  418  ATTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTC  491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACAGACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTC  518

Query  492  ACGAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTG  565
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACGAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAAGTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTG  592

Query  566  GGTCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCG  639
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGTCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGTGGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCG  666

Query  640  GAGGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAACTTGCTGA  713
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||
Sbjct  667  GAGGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCGGCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGAT----AAGTACAACTTGCTGA  736

Query  714  AGGCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGAAGCCTTC  787
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  AGGCTTTGACGTGTTTATGCCTAAATCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGAAGCCTTC  810

Query  788  TGTTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAAGAGGAAA  861
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  TGTTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTTTTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAAGAGGAAA  884

Query  862  AGAGGACTCAATGACAACCGGAAAGGACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAGAAAAGTA  935
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct  885  AGAGGACTCAATGACAACCGGAAAGGAC----------------------------------------------  912

Query  936  CTGTACAGCTAACCATGTGGATAAGCTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTGCAGATTCTACAGGATCAAATTAAAC  1009
                                                                                      
Sbjct  913  --------------------------------------------------------------------------  912

Query 1010  TGGCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGGCTCAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCATTGCTCTACCA  1083
                                                                                      
Sbjct  913  --------------------------------------------------------------------------  912

Query 1084  CCAACAGTGGTC  1095
                        
Sbjct  913  ------------  912