Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13437
• Subject: XR_930480.2
• Aligned Length: 1206
• Identities: 865
• Gaps: 339

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TAATGGGGAGGCCAAAGAGACACAGCCCATTTTTTTAGGAGATGAAAGCATGGAAATAAAAAAGCAAATTACAG  74

Query    1  --ATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGTTGGCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAA  72
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGATGAGAAGATTGCTGAACGACAGCACTGGGCGGATCTATCAGCGAGTTGGCAAAGAAGGAGAGAAACTAAAA  148

Query   73  GAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCTCTGCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCA  146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAAGAGCCCCAGGACCTGGATTTAGTCTGGCCTCCACGTTTGAACTCCTCTGCTGAGGCCCCGCAAAGCCTCCA  222

Query  147  CCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAGTTCTCAGGGCAGTATGGCACCCGTT  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCGTCTTCACGTGGTGTGTGGAATGAGCTACCGCCCCAGAGTGGACAGTTCTCAGGGCAGTATGGCACCCGTT  296

Query  221  CTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAATGGTATGGTTGTCAACAAACATTCAGAAGGC  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTAGAACCTTCCAAAGCCAGCCCCACCCTACCACGAGCTCCAATGGTATGGTTGTCAACAAACATTCAGAAGGC  370

Query  295  TCTCATGGGGGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACTGCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAAC  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCTCATGGGGGAGAACTTCCAGTGGTGAATTCATCAGCTGGATCAAACTGCTGTACTTGTAACTGCCAGTCAAC  444

Query  369  GTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAAATTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACA  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTGCAGGCCATTCTACAAGAACTCAAGACCATGAGGAAATTAATGCAAATTCAAGCAGTTGGAACTCAAAACA  518

Query  443  GACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTCACGAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAA  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GACAACAACCTCCAATTTCCCTTATATGCTCCCAGCGAACTGCTGTCTCACGAAAGAGAAATAAAAAGAAAAAA  592

Query  517  GTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTGGGTCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGT  590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGCCCCCAAAGACTGTGGAACCTCTTACTGTGAAACAGAAGCCCAGTGGGTCAGAGATGGAGAAAAAGTCGGT  666

Query  591  GGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCGGAGGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCG  664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGTGGCCTCTGAGCTATCTGCTCTCCAGGCAGCCGAGCACACCTCCCCGGAGGAGAGCCGCGTTCTAGGATTCG  740

Query  665  GCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGATCCAGAAGTACAACTTGCTGAAGGCTTTGACGTGTTTATGCCTAAA  738
            |||||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct  741  GCATTGTTCTGGAATCACCTTCCTCAGAT---------------------------------------------  769

Query  739  TCTCAGCTGGACTCTATATTGTCAAACTACACTCGCTCAGGAAGCCTTCTGTTTAGAAAACTGGTGTGTGCGTT  812
                                                                                      
Sbjct  770  --------------------------------------------------------------------------  769

Query  813  TTTTGATGACAAGACTTTGGCTAACTCCTTACCCAATGGGAAGAGGAAAAGAGGACTCAATGACAACCGGAAAG  886
                                                                                      
Sbjct  770  --------------------------------------------------------------------------  769

Query  887  GACTAGACCAAAATATTGTGGGTGCAATAAAAGTCTTCACAGAAAAGTACTGTACAGCTAACCATGTGGATAAG  960
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  770  ---------------------------------TCTTCACAGAAAAGTACTGTACAGCTAACCATGTGGATAAG  810

Query  961  CTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTGCAGATTCTACAGGATCAAATTAAACTGGCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGG  1034
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  CTTCCTGGCCCAAGAGATTGGGTACAGATTCTACAGGATCAAATTAAACTGGCCAGAAGAAGGTTAAAAAGAGG  884

Query 1035  CTCAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCATTGCTCTACCACCAACAGTGGTC-------------  1095
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||.             
Sbjct  885  CTCAGAGATCGCGGACAGTGATGAAAGACTGGACGGCATTGCTCTACCACCAACA--GGTAAATTATCTTTTAG  956

Query 1096  ----------------------  1095
                                  
Sbjct  957  GCCATTTTCCATGACTGGACAA  978