Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13453
• Subject: XM_017003749.2
• Aligned Length: 1176
• Identities: 743
• Gaps: 423

Alignment

Query    1  ATGGCAGGGATCTTAGCCTGGTTCTGGAACGAGAGGTTTTGGCTCCCGCACAATGTCACCTGGGCGGACCTGAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAACACGGAGGAGGCCACCTTCCCGCAGGCTGAGGACCTCTATCTCGCTTTTCCCCTGGCCTTCTGTATCTTCA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGTGCGGCTCATCTTCGAGAGATTTGTAGCCAAACCGTGCGCCATAGCCCTCAACATTCAGGCCAATGGACCA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAAATTGCTCCGCCCAATGCCATTCTGGAAAAGGTCTTCACTGCAATTACAAAGCATCCTGATGAAAAGAGATT  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GGAAGGCCTCTCCAAGCAACTGGACTGGGATGTTCGAAGCATTCAGCGCTGGTTTCGACAAAGACGCAATCAGG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  AGAAGCCAAGCACGCTGACGAGGTTCTGTGAGAGCATGTGGAGATTTTCATTTTACCTTTATGTATTTACCTAC  444
              |.|||.|     ||     ||||||..|||       |||||     |....||.|.|||||||        
Sbjct    1  --ATGCCTA-----CT-----GGTTCTTGGAG-------GGAGA-----AAAGCACATGTATGTAT--------  42

Query  445  GGAGTCAGATTCCTGAAAAAGACCCCCTGGTTGTGGAATACGAGGCATTGCTGGTACAACTACCCCTATCAGCC  518
                                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   43  ---------------------ACCCCCTGGTTGTGGAATACGAGGCATTGCTGGTACAACTACCCCTATCAGCC  95

Query  519  ACTCACAACTGACCTTCACTACTATTACATCCTGGAGCTGTCGTTTTATTGGTCTTTGATGTTTTCTCAGTTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   96  ACTCACAACTGACCTTCACTACTATTACATCCTGGAGCTGTCGTTTTATTGGTCTTTGATGTTTTCTCAGTTCA  169

Query  593  CTGATATCAAAAGAAAGGACTTTGGCATTATGTTCCTGCACCACCTTGTATCTATTTTCTTGATTACCTTTTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  170  CTGATATCAAAAGAAAGGACTTTGGCATTATGTTCCTGCACCACCTTGTATCTATTTTCTTGATTACCTTTTCA  243

Query  667  TATGTCAACAATATGGCCCGAGTAGGAACGCTGGTCCTTTGTCTTCATGATTCAGCTGATGCTCTTCTGGAGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  244  TATGTCAACAATATGGCCCGAGTAGGAACGCTGGTCCTTTGTCTTCATGATTCAGCTGATGCTCTTCTGGAGGC  317

Query  741  TGCCAAAATGGCAAATTATGCCAAGTTTCAGAAAATGTGTGATCTCCTGTTTGTTATGTTTGCCGTGGTTTTTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  318  TGCCAAAATGGCAAATTATGCCAAGTTTCAGAAAATGTGTGATCTCCTGTTTGTTATGTTTGCCGTGGTTTTTA  391

Query  815  TCACCACACGACTGGGTATATTTCCTCTCTGGGTGTTAAATACCACATTATTTGAAAGCTGGGAGATCGTTGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  392  TCACCACACGACTGGGTATATTTCCTCTCTGGGTGTTAAATACCACATTATTTGAAAGCTGGGAGATCGTTGGA  465

Query  889  CCTTACCCTTCCTGGTGGGTTTTTAACCTACTGCTATTGCTAGTACAAGGGTTGAACTGCTTCTGGTCTTACTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  466  CCTTACCCTTCCTGGTGGGTTTTTAACCTACTGCTATTGCTAGTACAAGGGTTGAACTGCTTCTGGTCTTACTT  539

Query  963  GATTGTGAAAATAGCTTGCAAAGCTGTTTCAAGAGGCAAGGCTGGGAAGTGGAACCCTTTACATGTGTCCAAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540  GATTGTGAAAATAGCTTGCAAAGCTGTTTCAAGAGGCAAGGCTGGGAAGTGGAACCCTTTACATGTGTCCAAGG  613

Query 1037  ATGATCGAAGTGATATTGAGTCTAGCTCAGATGAGGAGGACTCAGAACCTCCGGGAAAGAATCCCCACACTGCG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  614  ATGATCGAAGTGATATTGAGTCTAGCTCAGATGAGGAGGACTCAGAACCTCCGGGAAAGAATCCCCACACTGCG  687

Query 1111  ACAACCACCAATGGGACCAGTGGTACCAACGGGTATCTCCTGACTGGCTCCTGCTCCATGGATGAT  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  688  ACAACCACCAATGGGACCAGTGGTACCAACGGGTATCTCCTGACTGGCTCCTGCTCCATGGATGAT  753