Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_13477
Subject:
NM_001030019.2
Aligned Length:
1071
Identities:
914
Gaps:
156

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGTGGAAAAACAAAGGCAAGAAGGGCTGCCATGTTTTTTAGACGTTGCTCTGAAGACGCCAGCGGTAGCGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CAGTGGCAATGCTTTGTTATCAGAGGACGAAAATCCTGATGCGAATGGGGTAACTCGATCATGGAAGATTATTC  148

Query    1  --------ATGCTTACACTGACTTTTCTTCTTGTAGGACTCCTAAATCATCAGTGGCTTAAAGAAACAGATGTT  66
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAAGTACAATGCTTACACTGACTTTTCTTCTTGTAGGACTCCTAAATCATCAGTGGCTTAAAGAAACAGATGTT  222

Query   67  CCTCAGAAATCCAGACAATTATATGCCATAATTGCAGAATATGGTTCAAGGCTTTATAAATATCAGGCCAGACT  140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCAGAAATCCAGACAATTATATGCCATAATTGCAGAATATGGTTCAAGGCTTTATAAATATCAGGCCAGACT  296

Query  141  TCGTATGCCTAAAGAGCAACTGGAACTTTTAAAGAAGGAAAGCCAGAATCTGGAAAACAATTTTCGTCAAATTC  214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGTATGCCTAAAGAGCAACTGGAACTTTTAAAGAAGGAAAGCCAGAATCTGGAAAACAATTTTCGTCAAATTC  370

Query  215  TATTTTTGGTCGAACAAATAGATGTCCTGAAGGCATTGCTAAGAGATATGAAGGATGGTATGGACAATAATCAC  288
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TATTTTTGATCGAACAAATAGATGTCCTGAAGGCATTGCTAAGAGATATGAAGGATGGTATGGACAATAATCAC  444

Query  289  AACTGGAACACCCATGGAGACCCTGTGGAGGACCCGGACCACACAGAGGAAGTGTCAAACTTGGTCAATTATGT  362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACTGGAACACCCATGGAGACCCTGTGGAGGACCCGGACCACACAGAGGAAGTGTCAAACTTGGTCAATTATGT  518

Query  363  ACTTAAAAAGTTGAGAGAAGACCAAGTCGAGATGGCTGATTATGCCCTGAAGTCGGCCGGAGCCTCCATCATTG  436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTTAAAAAGTTGAGAGAAGACCAAGTCGAGATGGCTGATTATGCCCTGAAGTCGGCCGGAGCCTCCATCATTG  592

Query  437  AAGCTGGGACCTCAGAAAGTTATAAAAATAATAAAGCAAAATTGTACTGGCATGGGATAGGTTTCCTAAATCAT  510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGCTGGGACCTCAGAAAGTTATAAAAATAATAAAGCAAAATTGTACTGGCATGGGATAGGTTTCCTAAATCAT  666

Query  511  GAAATGCCTCCAGATATTATTCTTCAGCCGGATGTCTACCCTGGAAAGTGCTGGGCTTTTCCAGGTTCCCAGGG  584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAATGCCTCCAGATATTATTCTTCAGCCGGATGTCTACCCTGGAAAGTGCTGGGCTTTTCCAGGTTCCCAGGG  740

Query  585  TCATACCCTAATCAAGCTTGCTACAAAGATCATACCAACTGCTGTTACCATGGAGCACATCTCAGAGAAGGTGT  658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCATACCCTAATCAAGCTTGCTACAAAGATCATACCAACTGCTGTTACCATGGAGCACATCTCAGAGAAGGTGT  814

Query  659  CTCCGTCAGGAAACATCTCCAGTGCACCCAAGGAATTTTCTGTCTATGGCATCACAAAAAAATGTGAAGGAGAA  732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCCGTCAGGAAACATCTCCAGTGCACCCAAGGAATTTTCTGTCTATGGCATCACAAAAAAATGTGAAGGAGAA  888

Query  733  GAAATTTTCCTAGGTCAGTTTATATATAACAAAACAGGAACCACCGTTCAAACATTTGAACTCCAGCATGCAGT  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAATTTTCCTAGGTCAGTTTATATATAACAAAACAGGAACCACCGTTCAAACATTTGAACTCCAGCATGCAGT  962

Query  807  TTCTGAATATTTATTATGTGTGAAACTTAATATCTTTAGCAACTGGGGACACCCGAAGTATACTTGTTTATATC  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TTCTGAATATTTATTATGTGTGAAACTTAATATCTTTAGCAACTGGGGACACCCGAAGTATACTTGTTTATATC  1036

Query  881  GATTCAGGGTCCATGGCACACCAGGCAAGCACATC  915
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GATTCAGGGTCCATGGCACACCAGGCAAGCACATC  1071