Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13477
- Subject:
- NM_001030019.2
- Aligned Length:
- 1071
- Identities:
- 914
- Gaps:
- 156
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAGTGGAAAAACAAAGGCAAGAAGGGCTGCCATGTTTTTTAGACGTTGCTCTGAAGACGCCAGCGGTAGCGC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CAGTGGCAATGCTTTGTTATCAGAGGACGAAAATCCTGATGCGAATGGGGTAACTCGATCATGGAAGATTATTC 148
Query 1 --------ATGCTTACACTGACTTTTCTTCTTGTAGGACTCCTAAATCATCAGTGGCTTAAAGAAACAGATGTT 66
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TAAGTACAATGCTTACACTGACTTTTCTTCTTGTAGGACTCCTAAATCATCAGTGGCTTAAAGAAACAGATGTT 222
Query 67 CCTCAGAAATCCAGACAATTATATGCCATAATTGCAGAATATGGTTCAAGGCTTTATAAATATCAGGCCAGACT 140
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTCAGAAATCCAGACAATTATATGCCATAATTGCAGAATATGGTTCAAGGCTTTATAAATATCAGGCCAGACT 296
Query 141 TCGTATGCCTAAAGAGCAACTGGAACTTTTAAAGAAGGAAAGCCAGAATCTGGAAAACAATTTTCGTCAAATTC 214
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCGTATGCCTAAAGAGCAACTGGAACTTTTAAAGAAGGAAAGCCAGAATCTGGAAAACAATTTTCGTCAAATTC 370
Query 215 TATTTTTGGTCGAACAAATAGATGTCCTGAAGGCATTGCTAAGAGATATGAAGGATGGTATGGACAATAATCAC 288
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TATTTTTGATCGAACAAATAGATGTCCTGAAGGCATTGCTAAGAGATATGAAGGATGGTATGGACAATAATCAC 444
Query 289 AACTGGAACACCCATGGAGACCCTGTGGAGGACCCGGACCACACAGAGGAAGTGTCAAACTTGGTCAATTATGT 362
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 AACTGGAACACCCATGGAGACCCTGTGGAGGACCCGGACCACACAGAGGAAGTGTCAAACTTGGTCAATTATGT 518
Query 363 ACTTAAAAAGTTGAGAGAAGACCAAGTCGAGATGGCTGATTATGCCCTGAAGTCGGCCGGAGCCTCCATCATTG 436
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ACTTAAAAAGTTGAGAGAAGACCAAGTCGAGATGGCTGATTATGCCCTGAAGTCGGCCGGAGCCTCCATCATTG 592
Query 437 AAGCTGGGACCTCAGAAAGTTATAAAAATAATAAAGCAAAATTGTACTGGCATGGGATAGGTTTCCTAAATCAT 510
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAGCTGGGACCTCAGAAAGTTATAAAAATAATAAAGCAAAATTGTACTGGCATGGGATAGGTTTCCTAAATCAT 666
Query 511 GAAATGCCTCCAGATATTATTCTTCAGCCGGATGTCTACCCTGGAAAGTGCTGGGCTTTTCCAGGTTCCCAGGG 584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAAATGCCTCCAGATATTATTCTTCAGCCGGATGTCTACCCTGGAAAGTGCTGGGCTTTTCCAGGTTCCCAGGG 740
Query 585 TCATACCCTAATCAAGCTTGCTACAAAGATCATACCAACTGCTGTTACCATGGAGCACATCTCAGAGAAGGTGT 658
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCATACCCTAATCAAGCTTGCTACAAAGATCATACCAACTGCTGTTACCATGGAGCACATCTCAGAGAAGGTGT 814
Query 659 CTCCGTCAGGAAACATCTCCAGTGCACCCAAGGAATTTTCTGTCTATGGCATCACAAAAAAATGTGAAGGAGAA 732
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTCCGTCAGGAAACATCTCCAGTGCACCCAAGGAATTTTCTGTCTATGGCATCACAAAAAAATGTGAAGGAGAA 888
Query 733 GAAATTTTCCTAGGTCAGTTTATATATAACAAAACAGGAACCACCGTTCAAACATTTGAACTCCAGCATGCAGT 806
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GAAATTTTCCTAGGTCAGTTTATATATAACAAAACAGGAACCACCGTTCAAACATTTGAACTCCAGCATGCAGT 962
Query 807 TTCTGAATATTTATTATGTGTGAAACTTAATATCTTTAGCAACTGGGGACACCCGAAGTATACTTGTTTATATC 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TTCTGAATATTTATTATGTGTGAAACTTAATATCTTTAGCAACTGGGGACACCCGAAGTATACTTGTTTATATC 1036
Query 881 GATTCAGGGTCCATGGCACACCAGGCAAGCACATC 915
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GATTCAGGGTCCATGGCACACCAGGCAAGCACATC 1071