Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13606
• Subject: XM_006529565.3
• Aligned Length: 3426
• Identities: 3010
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGGTTTCGAGATTTGCTGCTAGGGGACCA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGATTCCGGGATTTGCTGCTAGGGGACCA  74

Query   75  AGGATGGCAAAACGACGACAGGGTACAAGTTGAATTCTATATGAATGAAAATACATTTAAAGAAAGACTAAAAT  148
            |||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||.
Sbjct   75  AGGCTGGCAAAATGATGACAGGGTCCAAGTTGAATTCTACATGAACGAAAACACATTTAAAGAGAGATTAAAAC  148

Query  149  TATTTTTCATAAAAAACCAGAGATCAAGTCTAAGGATACGCCTGTTCAATTTTTCTCTCAAATTACTAAGCTGC  222
            |.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||.|||||||.|||||.||.||.||..||||||||
Sbjct  149  TGTTTTTCATAAAAAACCAGCGATCAAGTCTAAGAATCCGCTTGTTCAACTTTTCCCTGAAGTTGTTAAGCTGC  222

Query  223  TTATTATACATAATCCGAGTACTACTAGAAAACCCTTCACAAGGAAATGAATGGTCTCATATCTTTTGGGTGAA  296
            ||||||||.||.|||||.||..|.||.||.||.||.|||||.||||.||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  223  TTATTATATATTATCCGTGTGTTGCTTGAGAAACCGTCACAGGGAAGTGAATGGTCTCACATATTTTGGGTTAA  296

Query  297  CAGAAGTCTACCTTTGTGGGGCTTACAGGTTTCAGTGGCATTGATAAGTCTGTTTGAAACAATATTACTTGGTT  370
            |.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  297  CCGAAGTCTACCTTTATGGGGTTTACAGGTCTCAGTGGCATTGATAAGTCTATTTGAAACAATACTCCTTGGTT  370

Query  371  ATCTTAGTTATAAGGGAAACATCTGGGAACAGATTTTACGAATACCCTTCATCTTGGAAATAATTAATGCAGTT  444
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  ATCTCAGTTATAAGGGAAATATCTGGGAGCAGATTTTACGAATTCCATTCATCTTGGAAATAATCAATGCAGTC  444

Query  445  CCCTTCATTATCTCAATATTCTGGCCTTCCTTAAGGAATCTATTTGTCCCAGTCTTTCTGAACTGTTGGCTTGC  518
            ||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  445  CCCTTCATCATCTCAATATTCTGGCCCACCTTAAGAAATCTATTTGTTCCAGTTTTTCTAAATTGTTGGCTTGC  518

Query  519  CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTACACAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTCCATAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC  592

Query  593  AAGTTTTGATTTTAATATCTACATTACTATGCCTTATCTTCACCTGCATTTGTGGGATCCAACATCTGGAACGA  666
            |||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  593  AAGTTTTGATTTTGATATCTACTTTACTATGCCTTATCTTCACTTGCATTTGTGGGATTCAGCATCTAGAACGA  666

Query  667  ATAGGAAAGAAGCTGAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACGTTTTCTACTGTGGGCTTCGGGGA  740
            ||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  ATTGGCAAGAAGCTCAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACATTTTCTACTGTGGGCTTTGGGGA  740

Query  741  TGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTTTTTGTAGTTGCTATGATTTGTGTTGCTCTTGTGGTTCTACCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct  741  TGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTCTTTGTCGTTGCTATGATCTGCGTTGCCCTTGTAGTACTCCCTA  814

Query  815  TACAGTTTGAACAGCTGGCTTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTATAGTCGACATAGAGCT  888
            ||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  815  TACAGTTTGAACAGTTGGCCTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTACAGTCGACACAGAGCT  888

Query  889  CAAACTGAAAAGCATGTCGTCCTGTGTGTCAGCTCACTGAAGATTGATTTACTTATGGATTTTTTAAATGAATT  962
            ||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct  889  CAGACAGAGAAGCATGTTGTCCTGTGTGTCAGCTCCTTGAAGATTGACTTACTTATGGATTTTCTAAATGAGTT  962

Query  963  CTATGCTCATCCTAGGCTCCAGGATTATTATGTGGTGATTTTGTGTCCTACTGAAATGGATGTACAGGTTCGAA  1036
            ||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.|
Sbjct  963  CTATGCGCATCCAAGACTACAGGATTATTACGTGGTGATTTTGTGTCCCACGGAGATGGATGTGCAAGTTCGGA  1036

Query 1037  GGGTACTGCAGATTCCAATGTGGTCCCAACGAGTTATCTACCTTCAAGGTTCAGCCCTTAAAGATCAAGACCTA  1110
            |.|||||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.
Sbjct 1037  GAGTACTACAGATTCCAATGTGGTCCCAGAGAGTGATCTACCTTCAAGGCTCTGCCCTTAAAGACCAGGATCTC  1110

Query 1111  TTGAGAGCAAAGATGGATGACGCTGAGGCCTGTTTTATTCTCAGTAGCCGTTGTGAAGTGGATAGGACATCATC  1184
            .||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||.|.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 1111  CTGAGAGCAAAGATGGACAATGCTGAGGCCTGTTTCATTTTGAGTAGCCGCTGCGAAGTGGATAGAACCTCATC  1184

Query 1185  TGATCACCAAACAATTTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCTCCAAATTGTCCTTTGTATGTCCAGATAT  1258
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.|||||||
Sbjct 1185  TGATCACCAAACAATCTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCCCCAAATTGTCCTCTGTATGTTCAGATAT  1258

Query 1259  TAAAGCCTGAAAATAAATTTCACATCAAATTTGCTGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAATACGCCATG  1332
            ||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1259  TAAAACCAGAAAACAAATTCCACATCAAATTTGCAGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAGTACGCCATG  1332

Query 1333  TTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTTATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCAAGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTCATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCAAGA  1406

Query 1407  AGGCCAGCAATCGCCAGAACAATGGCAGAAGATGTACGGTAGATGCTCCGGGAATGAAGTCTACCACATTGTTT  1480
            |||.|||||.||.||.|||||.||||||||||..|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1407  AGGGCAGCAGTCACCTGAACAGTGGCAGAAGACTTACGGGAGGTGCTCAGGAAACGAAGTCTATCACATCGTTT  1480

Query 1481  TGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGAAAGAGTTTTACATATGCCTCTTTCCATGCACACAAAAAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1481  TGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGGAAGAGTTTTACCTATGCTTCTTTTCATGCCCACAAAAAG  1554

Query 1555  TTTGGCGTCTGCTTGATTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGCTGAATCCAGGTCCTCGATACAT  1628
            |||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTTGGTGTCTGCTTGGTTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGCTGAATCCAGGTCCTCGATACAT  1628

Query 1629  TATGAATTCTACAGACATATGCTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAGAATTCAGCATTTAAAAACCAAGACC  1702
            |||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1629  TATGAATGCTTCAGACATATGTTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAAAATTCAGCATTTAAGAATCAAGACC  1702

Query 1703  AGCAGAGAAAAAGCAATGTGTCCAGGTCGTTTTATCATGGACCTTCCAGATTACCTGTACATAGCATAATTGCC  1776
            |.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1703  AACAGAGAAAAAGTAATGTGTCAAGGTCATTTTATCATGGGCCTTCCAGATTGCCTGTCCACAGCATCATTGCC  1776

Query 1777  AGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGATACAAGCTGTAGATCAGCAAGTGGCCCTACCCTGTCTCTTCC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||.||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 1777  AGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGACACAAGCTGCAGAGCAACAAGTGGCCCCACCCTGGCTCTTCC  1850

Query 1851  TACAGAGGGAAGCAAAGAAATAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAGGTTGCAGATACATCATCGATTC  1924
            |.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 1851  TTCAGAGGGAGGCAAAGAATTAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAGGTGGCAGATACATCATCAATTC  1924

Query 1925  AAACATGTGATCTTCTAAGTGACCAATCAGAAGATGAAACTACACCAGATGAAGAAATGTCTTCAAACTTAGAG  1998
            |||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.||||||
Sbjct 1925  AAACATGCGATCTCCTAAGTGACCAGTCCGAAGATGAAACTACACCAGATGAAGAAACATCTTCAAATTTAGAG  1998

Query 1999  TATGCTAAAGGTTACCCACCTTATTCTCCATATATAGGAAGTTCACCCACTTTTTGTCATCTCCTTCATGAAAA  2072
            |||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 1999  TATGCCAAAGGCTACCCACCTTATTCCCCATACATAGGAAGTTCACCTACTTTTTGTCACCTACTTCAAGAAAA  2072

Query 2073  AGTACCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAACATAACTACTATGAGGATGCAAAAGCCTATGGAT  2146
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2073  AGTGCCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAGCATAACTACTATGAGGACGCAAAAGCCTATGGAT  2146

Query 2147  TCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGATTATATAACTTTATTGTTCCTCTCAGG  2220
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2147  TCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGACTATATAATTTTATTGTACCTCTCAGG  2220

Query 2221  GCATATTATAGACCAAAGAAAGAACTTAATCCCATAGTACTGCTATTGGATAACCC------------------  2276
            ||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||                  
Sbjct 2221  GCATATTATAGACCAAAGAAAGAATTAAATCCCATAGTTCTGCTATTGGATAACCCGCCAGATATGCATTTTCT  2294

Query 2277  ------------------------------------------------------CCTAGATGACTTACTCAGGT  2296
                                                                  |||||||||.||.|||||||
Sbjct 2295  GGATGCAATCTGTTGGTTTCCAATGGTTTACTACATGGTGGGCTCTATTGACAACCTAGATGATTTGCTCAGGT  2368

Query 2297  GTGGAGTGACTTTTGCTGCTAATATGGTGGTTGTGGATAAAGAGAGCACCATGAGTGCCGAGGAAGACTACATG  2370
            ||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2369  GTGGAGTGACCTTTGCTGCCAACATGGTGGTGGTGGACAAAGAAAGCACCATGAGTGCAGAGGAAGACTACATG  2442

Query 2371  GCAGATGCCAAAACCATTGTGAACGTGCAGACACTCTTCAGGTTGTTTTCCAGTCTCAGTATTATCACAGAGCT  2444
            |||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2443  GCAGATGCCAAGACGATTGTGAATGTGCAGACTCTGTTCAGGTTGTTTTCAAGTCTCAGTATCATCACTGAGCT  2516

Query 2445  AACTCACCCCGCCAACATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAAGACTGTTACTCTCTTGCTCTTTCAAAACTGG  2518
            .||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 2517  TACGCATCCAGCAAATATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAGGATTGTTACTCTCTCGCGCTTTCAAAACTGG  2590

Query 2519  AAAAGAAAGAACGGGAGAGAGGCTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCCTTTTGCTGCTGGGAGGGTGTTT  2592
            |||||||||||.|.||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 2591  AAAAGAAAGAAAGAGAACGAGGTTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCCTTTTGCTGCGGGAAGAGTGTTC  2664

Query 2593  AGCATCAGTATGTTGGACACTCTGCTGTATCAGTCATTTGTGAAGGATTATATGATTTCTATCACGAGACTTCT  2666
            ||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2665  AGCATCAGTATGTTAGACACCCTTCTTTATCAGTCATTTGTGAAAGATTATATGATTTCTATCACCAGACTTCT  2738

Query 2667  GTTGGGACTGGACACTACACCAGGATCTGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATCACTGCAGATGACTTATGGATCA  2740
            .||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||
Sbjct 2739  TTTGGGACTGGACACCATACCAGGATCGGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATCACTGAAGATGACTTGTGGATCA  2812

Query 2741  GAACTTATGCCAGACTTTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCCCATTGGAATCTACAGGACTGAG  2814
            ||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.
Sbjct 2813  GAACGTATGCCAGACTCTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCCCATCGGGATCTACAGAACAGAA  2886

Query 2815  TCTCAGAAACTTACTACATCTGAG---------------------TCTCAAATATCTATCAGTGTAGAAGAGTG  2867
            |||||||||||.||.|||||||||                     |||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 2887  TCTCAGAAACTAACGACATCTGAGTCTCGAGAAATAGGATCTCAATCTCAAATATCCATTAGTGTGGAAGAGTG  2960

Query 2868  GGAAGACACCAAAGACTCCAAAGAACAAGGGCACCACCGCAGCAACCACCGCAACTCAACATCCAGTGACCAGT  2941
            |||||||||||||||...||||||.|.||||||||||||||||...||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 2961  GGAAGACACCAAAGATGTCAAAGACCCAGGGCACCACCGCAGCCTTCACCGCAACTCAACGTCTAGTGACCAGT  3034

Query 2942  CGGACCATCCCTTGCTGCGGAGAAAAAGCATGCAGTGGGCCCGAAGACTGAGCAGAAAAGGCCCAAAACACTCT  3015
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 3035  CGGACCATCCCTTGCTGCGGAGGAAGAGCATGCAGTGGGCCCGAAGGCTGAGCAGAAAAGGGCCGAAGCACTCT  3108

Query 3016  GGTAAAACAGCTGAAAAAATAACCCAGCAGCGACTGAACCTCTACAGGAGGTCAGAAAGACAAGAGCTTGCTGA  3089
            ||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 3109  GGTAAAACTGCAGAAAAAATAACTCAACAGCGACTGAACCTCTACCGGAGATCCGAAAGACAGGAGCTTGCTGA  3182

Query 3090  ACTTGTGAAAAATAGAATGAAACACTTGGGTCTTTCTACAGTGGGATATGATGAAATGAATGATCATCAAAGTA  3163
            ||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 3183  ACTTGTGAAAAACAGAATGAAACACCTGGGCCTCTCGACGGTGGGCTACGATGAAATGAATGATCATCAGAGCA  3256

Query 3164  CCCTCTCCTACATCCTGATTAACCCATCTCCAGATACCAGAATAGAGCTGAATGATGTTGTATACTTAATTCGA  3237
            ||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||..|.||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 3257  CCCTGTCCTACATCCTGATTAATCCGTCTCCAGACACCAGGCTTGAGCTGAATGATGTTGTATATTTGATCCGA  3330

Query 3238  CCAGATCCACTGGCCTACCTTCCAAACAGTGAGCCCAGTCGAAGAAACAGCATCTGCAATGTCACTGGTCAAGA  3311
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.|.|.|||||||||||||||||.|.|||.||||||
Sbjct 3331  CCAGATCCACTGTCCTACCTTCCAAACAGTGAACCCAGTAGGAAAAACAGCATCTGCAATGCCGCTGTTCAAGA  3404

Query 3312  TTCTCGGGAGGAAACTCAACTC  3333
            ||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405  TTCTCGGGAGGAAACTCAACTC  3426