Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13606
• Subject: XM_017320507.1
• Aligned Length: 3501
• Identities: 3010
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGGTTTCGAGATTTGCTGCTAGGGGACCA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTGATTTGGAGAGCGAAGTGCCCCCTCTGCCTCCCAGGTACAGATTCCGGGATTTGCTGCTAGGGGACCA  74

Query   75  AGGATGGCAAAACGACGACAGGGTACAAGTTGAATTCTATATGAATGAAAATACATTTAAAGAAAGACTAAAAT  148
            |||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||.
Sbjct   75  AGGCTGGCAAAATGATGACAGGGTCCAAGTTGAATTCTACATGAACGAAAACACATTTAAAGAGAGATTAAAAC  148

Query  149  TATTTTTCATAAAAAACCAGAGATCAAGTCTAAGGATACGCCTGTTCAATTTTTCTCTCAAATTACTAAGCTGC  222
            |.||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||.|||||||.|||||.||.||.||..||||||||
Sbjct  149  TGTTTTTCATAAAAAACCAGCGATCAAGTCTAAGAATCCGCTTGTTCAACTTTTCCCTGAAGTTGTTAAGCTGC  222

Query  223  TTATTATACATAATCCGAGTACTACTAGAAAACCCTTCACAAGGAAATGAATGGTCTCATATCTTTTGGGTGAA  296
            ||||||||.||.|||||.||..|.||.||.||.||.|||||.||||.||||||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  223  TTATTATATATTATCCGTGTGTTGCTTGAGAAACCGTCACAGGGAAGTGAATGGTCTCACATATTTTGGGTTAA  296

Query  297  CAGAAGTCTACCTTTGTGGGGCTTACAGGTTTCAGTGGCATTGATAAGTCTGTTTGAAACAATATTACTTGGTT  370
            |.|||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||
Sbjct  297  CCGAAGTCTACCTTTATGGGGTTTACAGGTCTCAGTGGCATTGATAAGTCTATTTGAAACAATACTCCTTGGTT  370

Query  371  ATCTTAGTTATAAGGGAAACATCTGGGAACAGATTTTACGAATACCCTTCATCTTGGAAATAATTAATGCAGTT  444
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  ATCTCAGTTATAAGGGAAATATCTGGGAGCAGATTTTACGAATTCCATTCATCTTGGAAATAATCAATGCAGTC  444

Query  445  CCCTTCATTATCTCAATATTCTGGCCTTCCTTAAGGAATCTATTTGTCCCAGTCTTTCTGAACTGTTGGCTTGC  518
            ||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct  445  CCCTTCATCATCTCAATATTCTGGCCCACCTTAAGAAATCTATTTGTTCCAGTTTTTCTAAATTGTTGGCTTGC  518

Query  519  CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTACACAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAACATGCCTTGGAAAATATGATTAATGATCTCCATAGAGCCATTCAGCGTACACAGTCTGCAATGTTTAATC  592

Query  593  AAGTTTTGATTTTAATATCTACATTACTATGCCTTATCTTCACCT-----------------------------  637
            |||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|                             
Sbjct  593  AAGTTTTGATTTTGATATCTACTTTACTATGCCTTATCTTCACTTGTTTTACAGACAAAACAAGAAAGCACATG  666

Query  638  ----------------------------------------------GCATTTGTGGGATCCAACATCTGGAACG  665
                                                          |||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  667  TATCATGTGACTTTGGGATTTACTGAAACTTTGACATTTTCTCAAAGCATTTGTGGGATTCAGCATCTAGAACG  740

Query  666  AATAGGAAAGAAGCTGAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACGTTTTCTACTGTGGGCTTCGGGG  739
            |||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  AATTGGCAAGAAGCTCAATCTCTTTGACTCCCTTTATTTCTGCATTGTGACATTTTCTACTGTGGGCTTTGGGG  814

Query  740  ATGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTTTTTGTAGTTGCTATGATTTGTGTTGCTCTTGTGGTTCTACCC  813
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.
Sbjct  815  ATGTCACTCCTGAAACATGGTCCTCCAAGCTCTTTGTCGTTGCTATGATCTGCGTTGCCCTTGTAGTACTCCCT  888

Query  814  ATACAGTTTGAACAGCTGGCTTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTATAGTCGACATAGAGC  887
            |||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct  889  ATACAGTTTGAACAGTTGGCCTATTTGTGGATGGAGAGACAAAAGTCAGGAGGAAACTACAGTCGACACAGAGC  962

Query  888  TCAAACTGAAAAGCATGTCGTCCTGTGTGTCAGCTCACTGAAGATTGATTTACTTATGGATTTTTTAAATGAAT  961
            |||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|
Sbjct  963  TCAGACAGAGAAGCATGTTGTCCTGTGTGTCAGCTCCTTGAAGATTGACTTACTTATGGATTTTCTAAATGAGT  1036

Query  962  TCTATGCTCATCCTAGGCTCCAGGATTATTATGTGGTGATTTTGTGTCCTACTGAAATGGATGTACAGGTTCGA  1035
            |||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 1037  TCTATGCGCATCCAAGACTACAGGATTATTACGTGGTGATTTTGTGTCCCACGGAGATGGATGTGCAAGTTCGG  1110

Query 1036  AGGGTACTGCAGATTCCAATGTGGTCCCAACGAGTTATCTACCTTCAAGGTTCAGCCCTTAAAGATCAAGACCT  1109
            ||.|||||.||||||||||||||||||||..||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 1111  AGAGTACTACAGATTCCAATGTGGTCCCAGAGAGTGATCTACCTTCAAGGCTCTGCCCTTAAAGACCAGGATCT  1184

Query 1110  ATTGAGAGCAAAGATGGATGACGCTGAGGCCTGTTTTATTCTCAGTAGCCGTTGTGAAGTGGATAGGACATCAT  1183
            ..||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||.|.||||||||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1185  CCTGAGAGCAAAGATGGACAATGCTGAGGCCTGTTTCATTTTGAGTAGCCGCTGCGAAGTGGATAGAACCTCAT  1258

Query 1184  CTGATCACCAAACAATTTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCTCCAAATTGTCCTTTGTATGTCCAGATA  1257
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||.||||||
Sbjct 1259  CTGATCACCAAACAATCTTGAGAGCATGGGCTGTGAAAGATTTTGCCCCAAATTGTCCTCTGTATGTTCAGATA  1332

Query 1258  TTAAAGCCTGAAAATAAATTTCACATCAAATTTGCTGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAATACGCCAT  1331
            |||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  TTAAAACCAGAAAACAAATTCCACATCAAATTTGCAGATCATGTTGTTTGTGAAGAAGAGTTTAAGTACGCCAT  1406

Query 1332  GTTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTTATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCA--  1403
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct 1407  GTTAGCTTTAAACTGTATATGCCCAGCAACATCTACACTCATTACACTACTGGTTCATACCTCTAGAGGGCAGT  1480

Query 1404  -------------------AGAAGGCCAGCAATCGCCAGAACAATGGCAGAAGATGTACGGTAGATGCTCCGGG  1458
                               ||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||||..|||||.||.|||||.||.
Sbjct 1481  GTGTGTGCTTGTGTTGCAGAGAAGGGCAGCAGTCACCTGAACAGTGGCAGAAGACTTACGGGAGGTGCTCAGGA  1554

Query 1459  AATGAAGTCTACCACATTGTTTTGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGAAAGAGTTTTACATATGC  1532
            ||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1555  AACGAAGTCTATCACATCGTTTTGGAAGAAAGTACATTTTTTGCTGAATATGAAGGGAAGAGTTTTACCTATGC  1628

Query 1533  CTCTTTCCATGCACACAAAAAGTTTGGCGTCTGCTTGATTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGC  1606
            .|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTCTTTTCATGCCCACAAAAAGTTTGGTGTCTGCTTGGTTGGTGTTAGGAGGGAGGATAATAAAAACATTTTGC  1702

Query 1607  TGAATCCAGGTCCTCGATACATTATGAATTCTACAGACATATGCTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAGAAT  1680
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703  TGAATCCAGGTCCTCGATACATTATGAATGCTTCAGACATATGTTTTTATATTAATATTACCAAAGAAGAAAAT  1776

Query 1681  TCAGCATTTAAAAACCAAGACCAGCAGAGAAAAAGCAATGTGTCCAGGTCGTTTTATCATGGACCTTCCAGATT  1754
            |||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777  TCAGCATTTAAGAATCAAGACCAACAGAGAAAAAGTAATGTGTCAAGGTCATTTTATCATGGGCCTTCCAGATT  1850

Query 1755  ACCTGTACATAGCATAATTGCCAGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGATACAAGCTGTAGATCAGCAA  1828
            .|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||.|||
Sbjct 1851  GCCTGTCCACAGCATCATTGCCAGCATGGGTACTGTGGCTATAGACTTGCAAGACACAAGCTGCAGAGCAACAA  1924

Query 1829  GTGGCCCTACCCTGTCTCTTCCTACAGAGGGAAGCAAAGAAATAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAG  1902
            |||||||.||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GTGGCCCCACCCTGGCTCTTCCTTCAGAGGGAGGCAAAGAATTAAGAAGACCTAGCATTGCTCCTGTTTTAGAG  1998

Query 1903  GTTGCAGATACATCATCGATTCAAACATGTGATCTTCTAAGTGACCAATCAGAAGATGAAACTACACCAGATGA  1976
            ||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTGGCAGATACATCATCAATTCAAACATGCGATCTCCTAAGTGACCAGTCCGAAGATGAAACTACACCAGATGA  2072

Query 1977  AGAAATGTCTTCAAACTTAGAGTATGCTAAAGGTTACCCACCTTATTCTCCATATATAGGAAGTTCACCCACTT  2050
            |||||..||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 2073  AGAAACATCTTCAAATTTAGAGTATGCCAAAGGCTACCCACCTTATTCCCCATACATAGGAAGTTCACCTACTT  2146

Query 2051  TTTGTCATCTCCTTCATGAAAAAGTACCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAACATAACTACTAT  2124
            |||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2147  TTTGTCACCTACTTCAAGAAAAAGTGCCATTTTGCTGCTTAAGATTAGACAAGAGTTGCCAGCATAACTACTAT  2220

Query 2125  GAGGATGCAAAAGCCTATGGATTCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGATTATA  2198
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2221  GAGGACGCAAAAGCCTATGGATTCAAAAATAAACTAATTATAGTTGCAGCTGAAACAGCTGGAAATGGACTATA  2294

Query 2199  TAACTTTATTGTTCCTCTCAGGGCATATTATAGACCAAAGAAAGAACTTAATCCCATAGTACTGCTATTGGATA  2272
            |||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2295  TAATTTTATTGTACCTCTCAGGGCATATTATAGACCAAAGAAAGAATTAAATCCCATAGTTCTGCTATTGGATA  2368

Query 2273  ACCC----------------------------------------------------------------------  2276
            ||||                                                                      
Sbjct 2369  ACCCGCCAGATATGCATTTTCTGGATGCAATCTGTTGGTTTCCAATGGTTTACTACATGGTGGGCTCTATTGAC  2442

Query 2277  --CCTAGATGACTTACTCAGGTGTGGAGTGACTTTTGCTGCTAATATGGTGGTTGTGGATAAAGAGAGCACCAT  2348
              |||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 2443  AACCTAGATGATTTGCTCAGGTGTGGAGTGACCTTTGCTGCCAACATGGTGGTGGTGGACAAAGAAAGCACCAT  2516

Query 2349  GAGTGCCGAGGAAGACTACATGGCAGATGCCAAAACCATTGTGAACGTGCAGACACTCTTCAGGTTGTTTTCCA  2422
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 2517  GAGTGCAGAGGAAGACTACATGGCAGATGCCAAGACGATTGTGAATGTGCAGACTCTGTTCAGGTTGTTTTCAA  2590

Query 2423  GTCTCAGTATTATCACAGAGCTAACTCACCCCGCCAACATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAAGACTGTTAC  2496
            ||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 2591  GTCTCAGTATCATCACTGAGCTTACGCATCCAGCAAATATGAGATTCATGCAATTCAGAGCCAAGGATTGTTAC  2664

Query 2497  TCTCTTGCTCTTTCAAAACTGGAAAAGAAAGAACGGGAGAGAGGCTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCC  2570
            |||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.||..||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  TCTCTCGCGCTTTCAAAACTGGAAAAGAAAGAAAGAGAACGAGGTTCTAACTTGGCCTTTATGTTTCGACTGCC  2738

Query 2571  TTTTGCTGCTGGGAGGGTGTTTAGCATCAGTATGTTGGACACTCTGCTGTATCAGTCATTTGTGAAGGATTATA  2644
            |||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2739  TTTTGCTGCGGGAAGAGTGTTCAGCATCAGTATGTTAGACACCCTTCTTTATCAGTCATTTGTGAAAGATTATA  2812

Query 2645  TGATTTCTATCACGAGACTTCTGTTGGGACTGGACACTACACCAGGATCTGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATC  2718
            |||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  TGATTTCTATCACCAGACTTCTTTTGGGACTGGACACCATACCAGGATCGGGGTTTCTTTGTTCTATGAAAATC  2886

Query 2719  ACTGCAGATGACTTATGGATCAGAACTTATGCCAGACTTTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCC  2792
            ||||.|||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  ACTGAAGATGACTTGTGGATCAGAACGTATGCCAGACTCTATCAGAAGTTGTGTTCTTCTACTGGAGATGTTCC  2960

Query 2793  CATTGGAATCTACAGGACTGAGTCTCAGAAACTTACTACATCTGAGTCTCAAATATCTATCAGTGTAGAAGAGT  2866
            |||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 2961  CATCGGGATCTACAGAACAGAATCTCAGAAACTAACGACATCTGAGTCTCAAATATCCATTAGTGTGGAAGAGT  3034

Query 2867  GGGAAGACACCAAAGACTCCAAAGAACAAGGGCACCACCGCAGCAACCACCGCAACTCAACATCCAGTGACCAG  2940
            ||||||||||||||||...||||||.|.||||||||||||||||...||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 3035  GGGAAGACACCAAAGATGTCAAAGACCCAGGGCACCACCGCAGCCTTCACCGCAACTCAACGTCTAGTGACCAG  3108

Query 2941  TCGGACCATCCCTTGCTGCGGAGAAAAAGCATGCAGTGGGCCCGAAGACTGAGCAGAAAAGGCCCAAAACACTC  3014
            |||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct 3109  TCGGACCATCCCTTGCTGCGGAGGAAGAGCATGCAGTGGGCCCGAAGGCTGAGCAGAAAAGGGCCGAAGCACTC  3182

Query 3015  TGGTAAAACAGCTGAAAAAATAACCCAGCAGCGACTGAACCTCTACAGGAGGTCAGAAAGACAAGAGCTTGCTG  3088
            |||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 3183  TGGTAAAACTGCAGAAAAAATAACTCAACAGCGACTGAACCTCTACCGGAGATCCGAAAGACAGGAGCTTGCTG  3256

Query 3089  AACTTGTGAAAAATAGAATGAAACACTTGGGTCTTTCTACAGTGGGATATGATGAAATGAATGATCATCAAAGT  3162
            |||||||||||||.||||||||||||.||||.||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 3257  AACTTGTGAAAAACAGAATGAAACACCTGGGCCTCTCGACGGTGGGCTACGATGAAATGAATGATCATCAGAGC  3330

Query 3163  ACCCTCTCCTACATCCTGATTAACCCATCTCCAGATACCAGAATAGAGCTGAATGATGTTGTATACTTAATTCG  3236
            |||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||..|.||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 3331  ACCCTGTCCTACATCCTGATTAATCCGTCTCCAGACACCAGGCTTGAGCTGAATGATGTTGTATATTTGATCCG  3404

Query 3237  ACCAGATCCACTGGCCTACCTTCCAAACAGTGAGCCCAGTCGAAGAAACAGCATCTGCAATGTCACTGGTCAAG  3310
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.|.|.|||||||||||||||||.|.|||.|||||
Sbjct 3405  ACCAGATCCACTGTCCTACCTTCCAAACAGTGAACCCAGTAGGAAAAACAGCATCTGCAATGCCGCTGTTCAAG  3478

Query 3311  ATTCTCGGGAGGAAACTCAACTC  3333
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479  ATTCTCGGGAGGAAACTCAACTC  3501