Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13612
• Subject: NM_001017930.2
• Aligned Length: 1889
• Identities: 1609
• Gaps: 94

Alignment

Query    1  ATGTCCCACCAAGAAGGCAGCACAGACGGCTTACCAGACTTAGGGACTGAAAGCCTGTTCAGCAGCCCAGAGGA  74
            ||||||||||||||.||||||||||..||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCCACCAAGAGGGCAGCACAGGTGGCTTACCAGACTTAGTGACTGAAAGCCTGTTCAGCAGCCCAGAGGA  74

Query   75  GCAGTCTGGAGCCGTGGCGGCGACAGAGGCCTCCTCAGACATTGACATAGCGACCTCAGAGCTGAGTGTGACAG  148
            |||||||||||..|..||||.|||.|.||||||||||||||||||.||.||..||.||||||         ||.
Sbjct   75  GCAGTCTGGAGTAGCAGCGGTGACGGCGGCCTCCTCAGACATTGAAATGGCAGCCACAGAGC---------CAT  139

Query  149  TGACCGGAGATGGCAGTGATAGCAGGGATGGTGGATTCCCCAACGATGCCAGCACAGAAAATCGAAGCTCAGAC  222
            .||||||||||||..||||||.||||||||||||.||||..||||||||||||||||||||||.||.|.|||||
Sbjct  140  CGACCGGAGATGGTGGTGATACCAGGGATGGTGGTTTCCTGAACGATGCCAGCACAGAAAATCAAAACACAGAC  213

Query  223  CAAGAAAGCGCAAGTGAAGACATCGAACTTGAGAGCTTGGAGGACTTTGAGCATTTCCTCATGAGTGGTGAAAG  296
            ..||||||..|||||||||||.||||||||||.|||.||                           ||||||.|
Sbjct  214  TCAGAAAGTTCAAGTGAAGACGTCGAACTTGAAAGCATG---------------------------GGTGAAGG  260

Query  297  TTTATTCCATTACCCTTTAGTGGGAGAGGAGGAGACAGAAAGGGAGGAGGAAGACGAAGAGATACAAGAGGAGG  370
            ||||||...||||||.|||||||||   ||||||||||||||||||||||||||.||||||||           
Sbjct  261  TTTATTTGGTTACCCGTTAGTGGGA---GAGGAGACAGAAAGGGAGGAGGAAGAAGAAGAGAT-----------  320

Query  371  GAGGGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAACAGCCTCGGGCG  444
                   |||||||||||.|||||||                              |||||||||||||||..|
Sbjct  321  -------GGAGGAGGAAGGGGAGGAG------------------------------GAAGAACAGCCTCGGATG  357

Query  445  GGTCCACAAGGCAGTGGCGGCAACCATGAGCAGTATTCGTTAGAGGAGGATCAGGCGCTGGAGGAGTGGGTTTC  518
            .||||||.|.||.|||||..|||||||||.||||.||.||||||.||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  358  TGTCCACGATGCGGTGGCACCAACCATGATCAGTGTTTGTTAGACGAGGATCAGGCGTTGGAGGAGTGGATTTC  431

Query  519  CTCAGAGACATCTGCCCTGCCCCGACCTCGCTGGCAGGTCGTTACTGCTCTTCACCAGCGGCAGCTGGGTTCAC  592
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.
Sbjct  432  CTCAGAGACATCTGCCCTGCCCCGATCTCGCTGGCAAGTCCTTACTGCTCTTCGCCAGCGGCAGCTGGGTTCAA  505

Query  593  GTCCCCGCTTTGTATATGAGGCCTGTGGGGCAAGAGCCTTTGTGCAGCGTTTCCGCCTGCAATATCGTCTTGCA  666
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.|
Sbjct  506  GTGCCCGCTTTGTATATGAGGCCTGTGGGGCAAGAACCTTTGTGCAGCGTTTCCGCCTGCAGTATCTTCTTGGA  579

Query  667  GACCATGTCGGCTGTGTCAATACTGTACACTTTAACCAGCGTGGCACCCGGCTGGCCAGTAGCGGTGATGACCT  740
            ..|||||.|||.|.|||||.|||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct  580  AGCCATGCCGGTTCTGTCAGTACCATACACTTTAACCAGCGTGGCACCCGACTGGCCAGTAGCGGTGATGACTT  653

Query  741  AAAGGTGATAGTGTGGGACTGGGTGCGGCAGAGGCCAGTACTGAACTTTGAAAGTGGTCACACAAATAATGTCT  814
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||...|.|||||||.
Sbjct  654  AAGGGTGATAGTGTGGGACTGGGTGCGGCAGAAGCCAGTACTGAACTTTGAGAGTGGTCACGATATTAATGTCA  727

Query  815  TCCAGGCCAAGTTCCTTCCTAACTGTGGTGATTCCACTCTGGCCATGTGTGCCCGTGATGGGCAGGTACGGGTA  888
            |||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.||||||||||||
Sbjct  728  TCCAGGCTAAGTTCTTTCCTAACTGTGGTGATTCCACTCTGGCCATGTGTGGCCATGATGGACAGGTACGGGTA  801

Query  889  GCAGAGTTAATTAATGCATCATATTTCAACAATACTAAGTGTGTGGCCCAGCACAGGGGACCTGCCCACAAGTT  962
            |||||..||||||||||||||||||.|.|.|||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  802  GCAGAACTAATTAATGCATCATATTGCGAGAATACTAAGCGTGTGGCCAAGCACAGGGGACCTGCCCACGAGTT  875

Query  963  GGCTCTGGAGCCTGACTCTCCTTATAAGTTCCTCACTTCAGGTGAAGATGCTGTTGTCTTCACCATTGACCTCA  1036
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  876  GGCTCTGGAGCCAGACTCTCCTTATAAGTTCCTCACTTCAGGTGAAGATGCCGTTGTGTTCACCATTGACCTCA  949

Query 1037  GACAAGACCGGCCAGCTTCAAAAGTTGTGGTAACAAGAGAAAATGATAAGAAAGTGGGACTGTATACAATTACT  1110
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||..||
Sbjct  950  GGCAAGACCGGCCAGCTTCAAAAGTTGTGGTAACAAGAGAAAATGATAAGAAAGTCGGACTGTATACAATCTCT  1023

Query 1111  GTGAATCCCGCCAATACCTACCAATTTGCAGTGGGTGGACAAGATCAGTTTGTAAGGATTTATGACCAGAGGAA  1184
            .|||||||.|||||||..|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1024  ATGAATCCTGCCAATATTTACCAATTTGCAGTGGGTGGACATGATCAGTTTGTAAGGATTTATGACCAGAGGAG  1097

Query 1185  AATTGATAAGAAAGAAAACAATGGCGTGCTCAAGAAATTCACTCCTCATCATCTGGTTAATTGTGATTTCCCAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1098  AATTGATAAGAAAGAAAACAATGGAGTACTCAAGAAATTCACTCCTCATCATCTGGTTTATTGTGATTTCCCAA  1171

Query 1259  CAAACATCACCTGCGTTGTGTACAGCCACGATGGCACAGAGCTGCTAGCCAGCTACAATGATGACGATATTTAC  1332
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1172  CAAACATCACCTGCGTTGTGTACAGCCACGATGGCACAGAGCTCCTGGCCAGCTACAATGATGAAGATATTTAC  1245

Query 1333  CTCTTCAACTCCTCTCACAGTGATGGTGCTCAATACAGTAAGAGATTTAAGGGACACAGAAATAATACCACAGT  1406
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||...||||||||.||||||.||||||||||||..||||.|
Sbjct 1246  CTCTTCAACTCCTCTCTCAGTGATGGTGCTCAATATGTTAAGAGATATAAGGGGCACAGAAATAATGACACAAT  1319

Query 1407  CAAAGGTGTTAATTTCTATGGCCCCAGGAGTGAGTTTGTAGTGAGCGGTAGTGATTGCGGGCACATCTTCTTCT  1480
            ||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||||
Sbjct 1320  CAAATGTGTTAATTTCTATGGCCCCCGGAGTGAGTTTGTCGTGAGCGGTAGTGATTGTGGGCACGTCTTCTTCT  1393

Query 1481  GGGAGAAATCATCCTGCCAAATCATCCAGTTCCTAAAGGGGAGCAGAGAAGGTACAATAAACTGTCTTGAACCC  1554
            |||||||||||||||.|||.||||||||||||.|..|||||..|||||.||.||.|.|||||||||||||||||
Sbjct 1394  GGGAGAAATCATCCTCCCAGATCATCCAGTTCATGGAGGGGGACAGAGGAGATATAGTAAACTGTCTTGAACCC  1467

Query 1555  CACCCTTACCTACCTGTGTTGGCGTGCAGTGGCCTAGATCATGATGTCAAGATCTGGACACCCACAGCTAAAGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||..||||||.||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1468  CACCCTTACCTACCTGTGTTGGCGACCAGTGGCCTAGATCAGCATGTCAGGATCTGGACACCCACAGCTAAAAC  1541

Query 1629  TGCCACTGAGCTTACTGGGTTAAAGAAGGTGATTAAGAAGAACAAGTGGGAACGAGATGAAGACAGCTTGCACC  1702
            ||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||..|||.|||||||||||||.||||.||.
Sbjct 1542  TGCCACTGAGCTTACTGGGTTAAAAGATGTGATTAAGAAGAACAAGCAGGAGCGAGATGAAGACAACTTGAACT  1615

Query 1703  ATGGCAGCCT-GTTTGACCAGTACATGCTTTGGTTCCTCCTGCGTCACGTGACGCAGAGAGGTCGTC-ACCAGG  1774
            || .|.|.|| |||||||.|...|||||||.|||||.||.||||||||.||...|||||||.||.|| |||.||
Sbjct 1616  AT-ACGGACTCGTTTGACAACCGCATGCTTCGGTTCTTCGTGCGTCACCTGTTACAGAGAGCTCATCAACCCGG  1688

Query 1775  ACTGGAGAAGTGGTGAAGCTGAATTTCCAGATGAAGAA---TCGGATGAGTCTTCCAGCACTTCAGAGACATCT  1845
             |||||||..|..||.||||||.||.||||||||||||   |.||||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1689  -CTGGAGAGATCATGGAGCTGAGTTCCCAGATGAAGAAGAGTTGGATGAGTCTTCCAGCACCTCAGATACATCC  1761

Query 1846  GAGGAGGAGGTCCAAGACCGAGTGCAGTGCATGCCATCC  1884
            ||||||||||.||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1762  GAGGAGGAGGGCCAAGATCGAGTGCAGTGCATACCATCC  1800