Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13769
• Subject: NM_002904.6
• Aligned Length: 1140
• Identities: 999
• Gaps: 141

Alignment

Query    1  ATGTTGGTGATACCCCCCGGACTGAGCGAGGAAGAGGAGGCTCTGCAGAAGAAATTCAACAAGCTCAAGAAAAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGGTGATACCCCCCGGACTGAGCGAGGAAGAGGAGGCTCTGCAGAAGAAATTCAACAAGCTCAAGAAAAA  74

Query   75  GAAAAAGGCATTGCTGGCTCTGAAGAAGCAAAGTAGCAGCAGCACAACCAGCCAAGGTGGTGTCAAACGCTCAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAAAAGGCATTGCTGGCTCTGAAGAAGCAAAGTAGCAGCAGCACAACCAGCCAAGGTGGTGTCAAACGCTCAC  148

Query  149  TATCAGAGCAGCCTGTCATGGACACAGCCACAGCAACAGAGCAGGCAAAGCAGCTGGTGAAGTCAGGAGCCATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TATCAGAGCAGCCTGTCATGGACACAGCCACAGCAACAGAGCAGGCAAAGCAGCTGGTGAAGTCAGGAGCCATC  222

Query  223  AGTGCCATCAAGGCTGAGACCAAGAACTCAGGCTTCAAGCGTTCTCGAACCCTTGAGGGGAAGTTAAAGGACCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTGCCATCAAGGCTGAGACCAAGAACTCAGGCTTCAAGCGTTCTCGAACCCTTGAGGGGAAGTTAAAGGACCC  296

Query  297  CGAGAAGGGACCAGTCCCCACTTTCCAGCCGTTCCAGAGGAGCATATCTGCTGATGATGACCTGCAAGAGTCAT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGAGAAGGGACCAGTCCCCACTTTCCAGCCGTTCCAGAGGAGCATATCTGCTGATGATGACCTGCAAGAGTCAT  370

Query  371  CCAGACGTCCCCAGAGGAAATCTCTGTATGAG---------------AGTGATCGACTTCGAGAACTAGGACCA  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAGACGTCCCCAGAGGAAATCTCTGTATGAGAGCTTTGTGTCTTCTAGTGATCGACTTCGAGAACTAGGACCA  444

Query  430  GATGGAGAAGAGGCAGAGGGCCCAGGGGCTGGTGATGGTCCCCCTCGAAGCTTTGACTGGGGCTATGAAGAACG  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGGAGAAGAGGCAGAGGGCCCAGGGGCTGGTGATGGTCCCCCTCGAAGCTTTGACTGGGGCTATGAAGAACG  518

Query  504  CAGTGGTGCCCACTCCTCAGCCTCCCCTCCCCGAAGCCGCAGCCGGGACCGCAGCCATGAGAGGAACCGGGACA  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGTGGTGCCCACTCCTCAGCCTCCCCTCCCCGAAGCCGCAGCCGGGACCGCAGCCATGAGAGGAACCGGGACA  592

Query  578  --------------------------------------------------------------------------  577
                                                                                      
Sbjct  593  GAGACCGAGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGGGATCGAGACAGAGACAGAGAGCGGGACAGGGATCGGGATCGG  666

Query  578  ----------------------------------------------------GAGACCGAGAGGGTCCTTTCCG  599
                                                                ||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATCGAGATCGAGACCGGGAACGGGACAGGGATCGGGAGCGGGATCGAGACCGAGACCGAGAGGGTCCTTTCCG  740

Query  600  CAGGTCGGATTCATTCCCTGAACGGCGAGCCCCTAGGAAAGGGAATACTCTCTATGTATATGGAGAAGACATGA  673
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAGGTCGGATTCATTCCCTGAACGGCGAGCCCCTAGGAAAGGGAATACTCTCTATGTATATGGAGAAGACATGA  814

Query  674  CACCCACCCTTCTCCGTGGGGCCTTCTCTCCTTTTGGAAACATCATTGACCTCTCCATGGACCCACCCAGAAAC  747
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CACCCACCCTTCTCCGTGGGGCCTTCTCTCCTTTTGGAAACATCATTGACCTCTCCATGGACCCACCCAGAAAC  888

Query  748  TGTGCCTTCGTCACCTATGAAAAGATGGAGTCAGCAGATCAGGCCGTTGCTGAGCTCAACGGGACCCAGGTGGA  821
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGCCTTCGTCACCTATGAAAAGATGGAGTCAGCAGATCAGGCCGTTGCTGAGCTCAACGGGACCCAGGTGGA  962

Query  822  GTCTGTACAGCTCAAAGTCAACATAGCCCGAAAACAGCCCATGCTGGATGCCGCTACTGGCAAGTCTGTCTGGG  895
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTCTGTACAGCTCAAAGTCAACATAGCCCGAAAACAGCCCATGCTGGATGCCGCTACTGGCAAGTCTGTCTGGG  1036

Query  896  GCTCCCTCGCTGTCCAGAACAGCCCTAAGGGTTGCCACCGGGACAAGAGGACCCAGATTGTCTACAGTGATGAC  969
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCTCCCTCGCTGTCCAGAACAGCCCTAAGGGTTGCCACCGGGACAAGAGGACCCAGATTGTCTACAGTGATGAC  1110

Query  970  GTCTACAAGGAAAACCTTGTGGATGGCTTC  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTCTACAAGGAAAACCTTGTGGATGGCTTC  1140