Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13846
• Subject: NM_001346575.1
• Aligned Length: 1329
• Identities: 992
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCGCAGGCAGGTGATGGCGGCGCTGGTCGTATCCGGGGCAGCGGAGCAGGGCGGCCGAGACGGCCCTGGCAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  AGGTCGGGCCCCTCGGGGCCGCGTGGCCAATCAGATCCCCCCTGAGATCCTGAAGAACCCTCAGCTGCAGGCAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CAATCCGGGTCCTGCCTTCCAACTACAACTTTGAGATCCCCAAGACCATCTGGAGGATCCAACAAGCCCAGGCC  222

Query    1  ------------------ATGCCGGAAGGCCTCCTCCTCTTTGCCTGTACCATTGTGGATATCTTGGAAAGGTT  56
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGAAGGTGGCCTTGCAAATGCCGGAAGGCCTCCTCCTCTTTGCCTGTACCATTGTGGATATCTTGGAAAGGTT  296

Query   57  CACGGAGGCCGAAGTGATGGTGATGGGTGACGTGACCTACGGGGCTTGCTGTGTGGATGACTTCACAGCGAGGG  130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACGGAGGCCGAAGTGATGGTGATGGGTGACGTGACCTACGGGGCTTGCTGTGTGGATGACTTCACAGCGAGGG  370

Query  131  CCCTGGGAGCTGACTTCTTGGTGCACTACGGCCACAGTTGCCTGATTCCCATGGACACCTCGGCCCAAGACTTC  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCTGGGAGCTGACTTCTTGGTGCACTACGGCCACAGTTGCCTGATTCCCATGGACACCTCGGCCCAAGACTTC  444

Query  205  CGGGTGCTGTACGTCTTTGTGGACATCCGGATAGACACTACACACCTCCTGGACTCTCTCCGCCTCACCTTTCC  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGGGTGCTGTACGTCTTTGTGGACATCCGGATAGACACTACACACCTCCTGGACTCTCTCCGCCTCACCTTTCC  518

Query  279  CCCAGCCACTGCCCTTGCCCTGGTCAGCACCATTCAGTTTGTGTCGACCTTGCAGGCAGCCGCCCAGGAGCTGA  352
            |||||||||||||||||||||                                 ||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCCAGCCACTGCCCTTGCCCT---------------------------------GGCAGCCGCCCAGGAGCTGA  559

Query  353  AAGCCGAGTATCGTGTGAGTGTCCCACAGTGCAAGCCCCTGTCCCCTGGAGAGATCCTGGGCTGCACATCCCCC  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  AAGCCGAGTATCGTGTGAGTGTCCCACAGTGCAAGCCCCTGTCCCCTGGAGAGATCCTGGGCTGCACATCCCCC  633

Query  427  CGACTGTCCAAAGAGGTGGAGGCCGTTGTGTATCTTGGAGATGGCCGCTTCCATCTGGAGTCTGTCATGATTGC  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  CGACTGTCCAAAGAGGTGGAGGCCGTTGTGTATCTTGGAGATGGCCGCTTCCATCTGGAGTCTGTCATGATTGC  707

Query  501  CAACCCCAATGTCCCCGCTTACCGGTATGACCCATATAGCAAAGTCCTATCCAGAGAACACTATGACCACCAGC  574
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  CAACCCCAATGTCCCCGCTTACCGGTATGACCCATATAGCAAAGTCCTATCCAGAGAACACTATGACCACCAGC  781

Query  575  GCATGCAGGCTGCTCGCCAAGAAGCCATAGCCACTGCCCGCTCAGCTAAGTCCTGGGGCCTTATTCTGGGCACT  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct  782  GCATGCAGGCTGCTCGCCAAGAAGCCATAGCCACTGCCCGCTCA------------------------------  825

Query  649  TTGGGCCGCCAGGGCAGTCCTAAGATCCTGGAGCACCTGGAATCTCGACTCCGAGCCTTGGGCCTTTCCTTTGT  722
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  826  ---------------------------------CACCTGGAATCTCGACTCCGAGCCTTGGGCCTTTCCTTTGT  866

Query  723  GAGGCTGCTGCTCTCTGAGATCTTCCCCAGCAAGCTTAGCCTACTTCCCGAGGTGGATGTGTGGGTGCAGGTGG  796
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  GAGGCTGCTGCTCTCTGAGATCTTCCCCAGCAAGCTTAGCCTACTTCCTGAGGTGGATGTGTGGGTGCAGGTGG  940

Query  797  CATGTCCACGTCTCTCCATTGACTGGGGCACAGCCTTCCCCAAGCCGCTGCTGACACCCTATGAGGCGGCCGTG  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  CATGTCCACGTCTCTCCATTGACTGGGGCACAGCCTTCCCCAAGCCGCTGCTGACACCCTATGAGGCGGCCGTG  1014

Query  871  GCTCTGAGGGACATTTCCTGGCAGCAGCCCTACCCGATGGACTTCTACGCTGGCAGCTCCTTGGGGCCCTGGAC  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  GCTCTGAGGGACATTTCCTGGCAGCAGCCCTACCCGATGGACTTCTACGCTGGCAGCTCCTTGGGGCCCTGGAC  1088

Query  945  GGTGAACCACGGCCAGGACCGCCGTCCCCACGCCCCGGGCCGGCCCGCGCGGGGGAAGGTGCAGGAGGGGTCCG  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  GGTGAACCACGGCCAGGACCGCCGTCCCCACGCCCCGGGCCGGCCCGCGCGGGGGAAGGTGCAGGAGGGGTCCG  1162

Query 1019  CGCGTCCCCCTTCGGCCGTGGCTTGCGAGGACTGCAGCTGCAGGGACGAGAAGGTGGCGCCGCTGGCTCCT  1089
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  CGCGTCCCCCTTCGGCCGTGGCTTGCGAGGACTGCAGCTGCAGGGACGAGAAGGTGGCGCCGCTGGCTCCT  1233