Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13846
• Subject: NM_001346576.1
• Aligned Length: 1089
• Identities: 908
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  ATGCCGGAAGGCCTCCTCCTCTTTGCCTGTACCATTGTGGATATCTTGGAAAGGTTCACGGAGGCCGAAGTGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGTGATGGGTGACGTGACCTACGGGGCTTGCTGTGTGGATGACTTCACAGCGAGGGCCCTGGGAGCTGACTTCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGGTGCACTACGGCCACAGTTGCCTGATTCCCATGGACACCTCGGCCCAAGACTTCCGGGTGCTGTACGTCTTT  222
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------ATGGACACCTCGGCCCAAGACTTCCGGGTGCTGTACGTCTTT  42

Query  223  GTGGACATCCGGATAGACACTACACACCTCCTGGACTCTCTCCGCCTCACCTTTCCCCCAGCCACTGCCCTTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   43  GTGGACATCCGGATAGACACTACACACCTCCTGGACTCTCTCCGCCTCACCTTTCCCCCAGCCACTGCCCTTGC  116

Query  297  CCTGGTCAGCACCATTCAGTTTGTGTCGACCTTGCAGGCAGCCGCCCAGGAGCTGAAAGCCGAGTATCGTGTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  117  CCTGGTCAGCACCATTCAGTTTGTGTCGACCTTGCAGGCAGCCGCCCAGGAGCTGAAAGCCGAGTATCGTGTGA  190

Query  371  GTGTCCCACAGTGCAAGCCCCTGTCCCCTGGAGAGATCCTGGGCTGCACATCCCCCCGACTGTCCAAAGAGGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  191  GTGTCCCACAGTGCAAGCCCCTGTCCCCTGGAGAGATCCTGGGCTGCACATCCCCCCGACTGTCCAAAGAGGTG  264

Query  445  GAGGCCGTTGTGTATCTTGGAGATGGCCGCTTCCATCTGGAGTCTGTCATGATTGCCAACCCCAATGTCCCCGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  265  GAGGCCGTTGTGTATCTTGGAGATGGCCGCTTCCATCTGGAGTCTGTCATGATTGCCAACCCCAATGTCCCCGC  338

Query  519  TTACCGGTATGACCCATATAGCAAAGTCCTATCCAGAGAACACTATGACCACCAGCGCATGCAGGCTGCTCGCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  339  TTACCGGTATGACCCATATAGCAAAGTCCTATCCAGAGAACACTATGACCACCAGCGCATGCAGGCTGCTCGCC  412

Query  593  AAGAAGCCATAGCCACTGCCCGCTCAGCTAAGTCCTGGGGCCTTATTCTGGGCACTTTGGGCCGCCAGGGCAGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  413  AAGAAGCCATAGCCACTGCCCGCTCAGCTAAGTCCTGGGGCCTTATTCTGGGCACTTTGGGCCGCCAGGGCAGT  486

Query  667  CCTAAGATCCTGGAGCACCTGGAATCTCGACTCCGAGCCTTGGGCCTTTCCTTTGTGAGGCTGCTGCTCTCTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  487  CCTAAGATCCTGGAGCACCTGGAATCTCGACTCCGAGCCTTGGGCCTTTCCTTTGTGAGGCTGCTGCTCTCTGA  560

Query  741  GATCTTCCCCAGCAAGCTTAGCCTACTTCCCGAGGTGGATGTGTGGGTGCAGGTGGCATGTCCACGTCTCTCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  561  GATCTTCCCCAGCAAGCTTAGCCTACTTCCTGAGGTGGATGTGTGGGTGCAGGTGGCATGTCCACGTCTCTCCA  634

Query  815  TTGACTGGGGCACAGCCTTCCCCAAGCCGCTGCTGACACCCTATGAGGCGGCCGTGGCTCTGAGGGACATTTCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  635  TTGACTGGGGCACAGCCTTCCCCAAGCCGCTGCTGACACCCTATGAGGCGGCCGTGGCTCTGAGGGACATTTCC  708

Query  889  TGGCAGCAGCCCTACCCGATGGACTTCTACGCTGGCAGCTCCTTGGGGCCCTGGACGGTGAACCACGGCCAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  709  TGGCAGCAGCCCTACCCGATGGACTTCTACGCTGGCAGCTCCTTGGGGCCCTGGACGGTGAACCACGGCCAGGA  782

Query  963  CCGCCGTCCCCACGCCCCGGGCCGGCCCGCGCGGGGGAAGGTGCAGGAGGGGTCCGCGCGTCCCCCTTCGGCCG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  783  CCGCCGTCCCCACGCCCCGGGCCGGCCCGCGCGGGGGAAGGTGCAGGAGGGGTCCGCGCGTCCCCCTTCGGCCG  856

Query 1037  TGGCTTGCGAGGACTGCAGCTGCAGGGACGAGAAGGTGGCGCCGCTGGCTCCT  1089
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  857  TGGCTTGCGAGGACTGCAGCTGCAGGGACGAGAAGGTGGCGCCGCTGGCTCCT  909