Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13854
• Subject: NM_001323399.2
• Aligned Length: 1149
• Identities: 1027
• Gaps: 121

Alignment

Query    1  AT-GAACGGCTGCAGAAGCAACCACTTACCTCCCCCGGGAGCGTGAGCCCCTCCCGAGATTCCAGTGTGCCTGG  73
            || ||||||||||||||                                                         
Sbjct    1  ATGGAACGGCTGCAGAA---------------------------------------------------------  17

Query   74  CTCTCCCTCCAGCATCGTGGCCAAGATGGACAATCAGGTGCTGGGCTACAAGGACCTGGCTGCCATCCCCAAGG  147
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   18  ------------------GGCCAAGATGGACAATCAGGTGCTGGGCTACAAGGACCTGGCTGCCATCCCCAAGG  73

Query  148  ACAAGGCCATCCTGGACATCGAGCGGCCCGACCTCATGATCTACGAGCCTCACTTTACTTATTCCCTCCTGGAA  221
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct   74  ACAAGGCCATCCTGGACATCGAGCGGCCCGACCTCATGATCTACGAGCCTCACTTCACTTATTCCCTCCTGGAA  147

Query  222  CACGTGGAGCTGCCTCGCAGCCGCGAGCGCTCGCTGTCACCCAAATCCACATCCCCCCCACCATCCCCAGAGGT  295
            ||||||||||||||||||||||||                                             |||||
Sbjct  148  CACGTGGAGCTGCCTCGCAGCCGC---------------------------------------------GAGGT  176

Query  296  GTGGGCGGACAGCCGGTCGCCTGGAATCATCTCTCAGGCCTCGGCCCCCAGAACCACTGGAACCCCCCGGACCA  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  177  GTGGGCGGACAGCCGGTCGCCTGGAATCATCTCTCAGGCCTCGGCCCCCAGAACCACTGGAACCCCCCGGACCA  250

Query  370  GCCTGCCCCATTTCCACCACCCTGAGACCTCCCGCCCAGATTCCAACATCTACAAGAAGCCTCCCATCTATAAG  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  251  GCCTGCCCCATTTCCACCACCCTGAGACCTCCCGCCCAGATTCCAACATCTACAAGAAGCCTCCCATCTATAAG  324

Query  444  CAGAGAGAGTCCGTGGGAGGCAGCCCTCAGACCAAGCACCTCATCGAGGATCTCATCATCGAGTCATCCAAGTT  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  325  CAGAGAGAGTCCGTGGGAGGCAGCCCTCAGACCAAGCACCTCATCGAGGATCTCATCATCGAGTCATCCAAGTT  398

Query  518  TCCTGCAGCCCAGCCCCCAGACCCCAACCAGCCAGCCAAAATCGAAACCGACTACTGGCCATGCCCCCCGTCTC  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  399  TCCTGCAGCCCAGCCCCCAGACCCCAACCAGCCAGCCAAAATCGAAACCGACTACTGGCCATGCCCCCCGTCTC  472

Query  592  TGGCTGTTGTGGAGACAGAATGGAGGAAGCGGAAGGCGTCTCGGAGGGGAGCAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAA  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  473  TGGCTGTTGTGGAGACAGAATGGAGGAAGCGGAAGGCGTCTCGGAGGGGAGCAGAGGAAGAGGAGGAGGAGGAA  546

Query  666  GATGACGACTCTGGAGAGGAGATGAAGGCTCTCAGGGAGCGTCAGAGAGAGGAACTCAGTAAGGTTACTTCCAA  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  547  GATGACGACTCTGGAGAGGAGATGAAGGCTCTCAGGGAGCGTCAGAGAGAGGAACTCAGTAAGGTTACTTCCAA  620

Query  740  CTTGGGAAAGATGATCTTGAAAGAAGAGATGGAAAAGTCATTGCCGATCCGAAGGAAAACCCGCTCTCTGCCTG  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  621  CTTGGGAAAGATGATCTTGAAAGAAGAGATGGAAAAGTCATTGCCGATCCGAAGGAAAACCCGCTCTCTGCCTG  694

Query  814  ACCGGACACCCTTCCATACCTCCTTGCACCAGGGAACGTCTAAATCTTCCTCTCTCCCCGCCTATGGCAGGACC  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  695  ACCGGACACCCTTCCATACCTCCTTGCACCAGGGAACGTCTAAATCTTCCTCTCTCCCCGCCTATGGCAGGACC  768

Query  888  ACCCTGAGCCGGCTACAGTCCACAGAGTTCAGCCCATCAGGGAGTGAGACTGGAAGCCCAGGCCTGCAGATCTA  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  769  ACCCTGAGCCGGCTACAGTCCACAGAGTTCAGCCCATCAGGGAGTGAGACTGGAAGCCCAGGCCTGCAGATCTA  842

Query  962  TCCCTATGAAATGCTAGTGGTGACCAACAAGGGGCGAACCAAGCTGCCACCGGGGGTGGATCGGATGCGGCTTG  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  843  TCCCTATGAAATGCTAGTGGTGACCAACAAGGGGCGAACCAAGCTGCCACCGGGGGTGGATCGGATGCGGCTTG  916

Query 1036  AGAGGCATCTGTCTGCCGAGGACTTCTCAAGGGTATTTGCCATGTCCCCTGAAGAGTTTGGCAAGCTGGCTCTG  1109
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  917  AGAGGCATCTGTCTGCCGAGGACTTCTCAAGGGTATTTGCCATGTCCCCTGAAGAGTTTGGCAAGCTGGCTCTG  990

Query 1110  TGGAAGCGGAATGAGCTCAAGAAGAAGGCCTCTCTCTTC  1148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  991  TGGAAGCGGAATGAGCTCAAGAAGAAGGCCTCTCTCTTC  1029