Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13887
• Subject: XM_011511157.2
• Aligned Length: 2175
• Identities: 2174
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCCACTTACATCCACGTCAGCAAAACTGGTGCCGAGGGAGCTGTTCTTGACGAAGCTAAAAATATCAATAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCACTTACATCCACGTCAGCAAAACTGGTGCCGAGGGAGCTGTTCTTGACGAAGCTAAAAATATCAATAA  74

Query   75  GTCTTTGTCTGCTCTTGGAAATGTGATCTCTGCTTTGGCAGAAGGGACAAAAACACATGTGCCATACCGGGACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTCTTTGTCTGCTCTTGGAAATGTGATCTCTGCTTTGGCAGAAGGGACAAAAACACATGTGCCATACCGGGACA  148

Query  149  GCAAGATGACTCGGATTCTTCAGGACTCTTTGGGTGGGAACTGCAGAACCACCATCGTCATTTGCTGTTCTCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCAAGATGACTCGGATTCTTCAGGACTCTTTGGGTGGGAACTGCAGAACCACCATCGTCATTTGCTGTTCTCCT  222

Query  223  TCTGTCTTCAATGAGGCTGAGACCAAGTCCACACTGATGTTCGGACAGAGAGCTAAGACCATCAAGAATACAGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCTGTCTTCAATGAGGCTGAGACCAAGTCCACACTGATGTTCGGACAGAGAGCTAAGACCATCAAGAATACAGT  296

Query  297  CTCTGTGAACCTAGAACTGACAGCAGAAGAATGGAAGAAGAAATATGAAAAAGAGAAAGAGAAAAACAAGACTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCTGTGAACCTAGAACTGACAGCAGAAGAATGGAAGAAGAAATATGAAAAAGAGAAAGAGAAAAACAAGACTT  370

Query  371  TGAAGAATGTTATCCAGCATCTGGAGATGGAGCTAAACAGGTGGAGGAATGGAGAAGCTGTGCCTGAGGATGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAAGAATGTTATCCAGCATCTGGAGATGGAGCTAAACAGGTGGAGGAATGGAGAAGCTGTGCCTGAGGATGAA  444

Query  445  CAGATCAGTGCCAAGGACCAGAAGAACCTGGAGCCTTGTGATAACACCCCCATCATAGACAATATTGCTCCTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGATCAGTGCCAAGGACCAGAAGAACCTGGAGCCTTGTGATAACACCCCCATCATAGACAATATTGCTCCTGT  518

Query  519  TGTTGCTGGCATCTCTACAGAGGAGAAAGAGAAGTACGATGAGGAGATCTCCAGTCTCTACAGACAACTGGATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTTGCTGGCATCTCTACAGAGGAGAAAGAGAAGTACGATGAGGAGATCTCCAGTCTCTACAGACAACTGGATG  592

Query  593  ACAAGGATGATGAAATTAACCAGCAGAGCCAGCTGGCTGAAAAGCTGAAGCAACAGATGTTGGATCAGGATGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAAGGATGATGAAATTAACCAGCAGAGCCAGCTGGCTGAAAAGCTGAAGCAACAGATGTTGGATCAGGATGAG  666

Query  667  CTTTTAGCTTCCACAAGAAGAGACTATGAGAAGATACAGGAGGAGCTGACACGTCTCCAGATTGAAAATGAGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTTTAGCTTCCACAAGAAGAGACTATGAGAAGATACAGGAGGAGCTGACACGTCTCCAGATTGAAAATGAGGC  740

Query  741  AGCCAAGGATGAGGTGAAAGAAGTTCTCCAGGCCCTGGAGGAGCTGGCTGTCAATTATGACCAGAAATCACAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCCAAGGATGAGGTGAAAGAAGTTCTCCAGGCCCTGGAGGAGCTGGCTGTCAATTATGACCAGAAATCACAGG  814

Query  815  AAGTGGAGGATAAGACCCGGGCCAATGAGCAGCTGACAGACGAGCTGGCCCAGAAAACGACTACATTGACAACC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGTGGAGGATAAGACCCGGGCCAATGAGCAGCTGACAGACGAGCTGGCCCAGAAAACGACTACATTGACAACC  888

Query  889  ACACAGAGAGAGCTGAGCCAGCTACAAGAGCTTAGCAACCACCAGAAGAAAAGGGCAACTGAGATCCTGAATTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACACAGAGAGAGCTGAGCCAGCTACAAGAGCTTAGCAACCACCAGAAGAAAAGGGCAACTGAGATCCTGAATTT  962

Query  963  GCTGTTGAAAGATCTGGGGGAGATAGGTGGAATTATTGGCACCAATGATGTGAAAACTTTGGCAGATGTGAATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGTTGAAAGATCTGGGGGAGATAGGTGGAATTATTGGCACCAATGATGTGAAAACTTTGGCAGATGTGAATG  1036

Query 1037  GAGTCATTGAGGAGGAGTTTACCATGGCCCGCCTGTACATCAGCAAGATGAAGTCAGAGGTCAAGTCCCTGGTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAGTCATTGAGGAGGAGTTTACCATGGCCCGCCTGTACATCAGCAAGATGAAGTCAGAGGTCAAGTCCCTGGTG  1110

Query 1111  AACCGCAGCAAACAGCTCGAGAGCGCCCAGATGGACTCCAACAGGAAGATGAATGCCAGCGAGCGGGAGCTGGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACCGCAGCAAACAGCTCGAGAGCGCCCAGATGGACTCCAACAGGAAGATGAATGCCAGCGAGCGGGAGCTGGC  1184

Query 1185  AGCCTGCCAGCTGCTCATCTCCCAGCACGAAGCCAAGATCAAGTCTCTGACAGACTACATGCAGAACATGGAAC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGCCTGCCAGCTGCTCATCTCCCAGCACGAAGCCAAGATCAAGTCTCTGACAGACTACATGCAGAACATGGAAC  1258

Query 1259  AGAAGAGGAGGCAGCTAGAAGAGTCCCAGGACTCGCTCAGCGAAGAGCTGGCAAAGCTCCGATCCCAGGAAAAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1259  AGAAGAGGAGGCAGCTAGAAGAGTCCCAGGACTCGCTCAGCGAAGAGCTGGCAAAGCTCCGAGCCCAGGAAAAA  1332

Query 1333  ATGCACGAAGTCAGCTTCCAGGATAAGGAGAAGGAACATCTGACGCGGTTGCAGGATGCTGAAGAAATGAAGAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATGCACGAAGTCAGCTTCCAGGATAAGGAGAAGGAACATCTGACGCGGTTGCAGGATGCTGAAGAAATGAAGAA  1406

Query 1407  GGCGCTGGAGCAGCAGATGGAGAGCCACCGGGAAGCTCACCAGAAGCAGCTGTCCAGACTCCGAGACGAAATTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGCGCTGGAGCAGCAGATGGAGAGCCACCGGGAAGCTCACCAGAAGCAGCTGTCCAGACTCCGAGACGAAATTG  1480

Query 1481  AGGAGAAGCAGAAAATCATTGATGAGATTCGGGATTTGAATCAGAAACTGCAACTGGAACAGGAGAAGCTTAGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGGAGAAGCAGAAAATCATTGATGAGATTCGGGATTTGAATCAGAAACTGCAACTGGAACAGGAGAAGCTTAGT  1554

Query 1555  TCTGATTATAACAAGCTGAAAATAGAGGACCAAGAGAGAGAAATGAAGCTGGAAAAGCTCTTATTGCTCAACGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCTGATTATAACAAGCTGAAAATAGAGGACCAAGAGAGAGAAATGAAGCTGGAAAAGCTCTTATTGCTCAACGA  1628

Query 1629  TAAAAGGGAACAAGCCAGAGAAGACCTCAAAGGGCTGGAGGAGACAGTGTCTAGAGAATTGCAGACACTGCACA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TAAAAGGGAACAAGCCAGAGAAGACCTCAAAGGGCTGGAGGAGACAGTGTCTAGAGAATTGCAGACACTGCACA  1702

Query 1703  ACCTTCGGAAACTCTTTGTCCAGGATCTGACCACCCGAGTTAAAAAAAGTGTGGAGTTGGACAACGATGATGGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ACCTTCGGAAACTCTTTGTCCAGGATCTGACCACCCGAGTTAAAAAAAGTGTGGAGTTGGACAACGATGATGGA  1776

Query 1777  GGGGGCAGTGCTGCCCAGAAGCAGAAAATTTCCTTCTTGGAGAATAACCTGGAGCAGCTCACCAAAGTTCACAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GGGGGCAGTGCTGCCCAGAAGCAGAAAATTTCCTTCTTGGAGAATAACCTGGAGCAGCTCACCAAAGTTCACAA  1850

Query 1851  GCAGCTGGTCCGGGACAACGCAGACCTGCGCTGTGAACTGCCCAAGCTGGAGAAGCGGCTGCGTGCCACGGCGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCAGCTGGTCCGGGACAACGCAGACCTGCGCTGTGAACTGCCCAAGCTGGAGAAGCGGCTGCGTGCCACGGCGG  1924

Query 1925  AGCGCGTCAAGGCTCTGGAGAGCGCGCTGAAGGAGGCCAAGGAGAACGCCATGCGGGACCGTAAGCGCTACCAG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGCGCGTCAAGGCTCTGGAGAGCGCGCTGAAGGAGGCCAAGGAGAACGCCATGCGGGACCGTAAGCGCTACCAG  1998

Query 1999  CAGGAGGTGGATCGTATCAAGGAGGCCGTGCGGGCCAAGAACATGGCCAGAAGGGCCCATTCAGCCCAGATCGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAGGAGGTGGATCGTATCAAGGAGGCCGTGCGGGCCAAGAACATGGCCAGAAGGGCCCATTCAGCCCAGATCGC  2072

Query 2073  CAAGCCCATCCGCCCCGGACACTACCCGGCCTCATCTCCAACGGCCGTCCATGCCATTCGAGGGGGAGGAGGCA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CAAGCCCATCCGCCCCGGACACTACCCGGCCTCATCTCCAACGGCCGTCCATGCCATTCGAGGGGGAGGAGGCA  2146

Query 2147  GCTCTTCAAATTCCACTCACTACCAGAAA  2175
            |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GCTCTTCAAATTCCACTCACTACCAGAAA  2175