Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13889
• Subject: NM_014513.2
• Aligned Length: 1200
• Identities: 782
• Gaps: 340

Alignment

Query    1  ATGTCGCTCATGGTCGTCAGCATGGCGTGTGTTGGGTTGTTCTTGGTCCAGAGGGCCGGTCCACACATGGGTGG  74
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||||||.|.|||.||                    
Sbjct    1  ATGTCGCTCATGGTCATCAGCATGGCGTGTGTTGCGTTCTTCTTGCTGCAGGGG--------------------  54

Query   75  TCAGGACAAGCCCTTCCTGTCTGCCTGGCCCAGCGCTGTGGTGCCTCGCGGAGGACACGTGACTCTTCGGTGTC  148
                                  ||||||||                                            
Sbjct   55  ----------------------GCCTGGCC--------------------------------------------  62

Query  149  ACTATCGTCATAGGTTTAACAATTTCATGCTATACAAAGAAGACAGAATCCACGTTCCCATCTTCCATGGCAGA  222
                                                                                      
Sbjct   63  --------------------------------------------------------------------------  62

Query  223  ATATTCCAGGAGGGCTTCAACATGAGCCCTGTGACCACAGCACATGCAGGGAACTACACATGTCGGGGTTCACA  296
                               |||||||                                                
Sbjct   63  -------------------ACATGAG------------------------------------------------  69

Query  297  CCCACACTCCCCCACTGGGTGGTCGGCACCCAGCAACCCCATGGTGATCATGGTCACAGGAAACCACAGAAAAC  370
                                                                      |||..||.||||||||
Sbjct   70  ----------------------------------------------------------GGATTCCGCAGAAAAC  85

Query  371  CTTCCCTCCTGGCCCACCCAGGTCCCCTGGTGAAATCAGGAGAGAGAGTCATCCTGCAATGTTGGTCAGATATC  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct   86  CTTCCCTCCTGGCCCACCCAGGTCCCCTGGTGAAATCAGAAGAGACAGTCATCCTGCAATGTTGGTCAGATGTC  159

Query  445  ATGTTTGAGCACTTCTTTCTGCACAAAGAGTGGATCTCTAAGGACCCCTCACGCCTCGTTGGACAGATCCATGA  518
            |||||||||||||||.|||||||||.||||.|||..|.|||..||.|.|..||||||.|||||.||..|..|||
Sbjct  160  ATGTTTGAGCACTTCCTTCTGCACAGAGAGGGGACGTTTAACCACACTTTGCGCCTCATTGGAGAGCACATTGA  233

Query  519  TGGGGTCTCCAAGGCCAATTTCTCCATCGGTTCCATGATGCGTGCCCTTGCAGGGACCTACAGATGCTACGGTT  592
            ||||||||||||||.|||.||||||||||||..|||||..|..|.|||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  234  TGGGGTCTCCAAGGGCAACTTCTCCATCGGTCGCATGACACAAGACCTGGCAGGGACCTACAGATGCTACGGTT  307

Query  593  CTGTTACTCACACCCCCTATCAGTTGTCAGCTCCCAGTGATCCCCTGGACATCGTGGTCACAGGTCTATATGAG  666
            |||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  308  CTGTTACTCACTCCCCCTATCAGTTGTCAGCGCCCAGTGACCCTCTGGACATCGTGATCACAGGTCTATATGAG  381

Query  667  AAACCTTCTCTCTCAGCCCAGCCGGGCCCCAAGGTTCAGGCAGGAGAGAGCGTGACCTTGTCCTGTAGCTCCCG  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  382  AAACCTTCTCTCTCAGCCCAGCCGGGCCCCACGGTTCTGGCAGGAGAGAGCGTGACCTTGTCCTGCAGCTCCCG  455

Query  741  GAGCTCCTATGACATGTACCATCTATCCAGGGAGGGGGGAGCCCATGAACGTAGGCTCCCTGCAGTGCGCAAGG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  456  GAGCTCCTATGACATGTACCATCTATCCAGGGAAGGGGAGGCCCATGAACGTAGGCTCCCTGCAGGGCCCAAGG  529

Query  815  TCAACAGAACATTCCAGGCAGATCTTCCCTCTGGGCCCTGCCACCCACGGAGGGACCTACAGATGCTTCAGCTC  888
            |||||||||||||||||||.|| |||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  530  TCAACAGAACATTCCAGGCCGA-CTTTCCTCTGGACCCTGCCACCCACGGAGGGACCTACAGATGCTTCGGCTC  602

Query  889  TTTCCGTCACTCTCCCTACGAGTGGTCAGACCCGAGTGACCCACTGCTTGTTTCTGTCACAGGAAACCCTTCAA  962
            |||||||.|||||||.||||||||||||.|..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  603  TTTCCGTGACTCTCCATACGAGTGGTCAAAGTCAAGTGACCCACTGCTTGTTTCTGTCACAGGAAACTCTTCAA  676

Query  963  GTAGTTGGCCTTCACCCACAGAACCAAGCTCCAAATCTGGTAACCTCAGACACCTGCACATGTCTGATTGGGAC  1036
            .||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|.|||||||.|||||||||.|||.| ||||||||||||
Sbjct  677  ATAGTTGGCCTTCACCCACTGAACCAAGCTCCGAAACCGGTAACCCCAGACACCTACACGT-TCTGATTGGGAC  749

Query 1037  CTCAGTGGTCAAAATCCCTTTCACCATCCTCCTCTTCTTTCTCCTTCATCGCTGGTGCTCCAACAAAAAAAAAT  1110
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
Sbjct  750  CTCAGTGGTCAAACTCCCTTTCACCATCCTCCTCTTCTTTCTCCTTCATCGCTGGTGCTCCAAC-AAAAAAAAT  822

Query 1111  GCTGCTGTAATGGACCAAGAGCCTGCAGGGAACAGAAG------------------------------------  1148
            ||..|||||||||||||||.||||||.||||||||||.                                    
Sbjct  823  GCATCTGTAATGGACCAAGGGCCTGCGGGGAACAGAACAGTGAACAGGGAGGATTCTGATGAACAGGACCATCA  896

Query 1149  ----------------  1148
                            
Sbjct  897  GGAGGTGTCATACGCA  912