Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13896
- Subject:
- NM_001167914.1
- Aligned Length:
- 1110
- Identities:
- 784
- Gaps:
- 237
Alignment
Query 1 ATGGAGTCCATCTTCCACGAGAAACAAGAAGGCTCACTTTGTGCTCAACATTGCCTGAATAACTTATTGCAAGG 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGTCCATCTTCCACGAGAAACAAGAAGGCTCACTTTGTGCTCAGCATTGCCTGAATAACCTATTGCAAGG 74
Query 75 AGAATATTTTAGCCCCGTGGAATTATCCTCAATTGCACATCAGCTGGATGAGGAGGAGAGGATGAGAATGGCAG 148
|||.|||||||||||.|||||..||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||
Sbjct 75 AGAGTATTTTAGCCCTGTGGAGCTATCCTCAATTGCACACCAGCTGGATGAAGAGGAGAGGCTGAGAATGGCAG 148
Query 149 AAGGAGGAGTTACTAGTGAAGATTATCGCACGTTTTTACAGCAGCCTTCTGGAAATATGGATGACAGTGGTTTT 222
||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 149 AAGGGGGAGTCACTAGTGAAGACTACCGCACATTTTTACAGCAGCCTTCTGGAAATATGGATGACAGCGGCTTT 222
Query 223 TTCTCTATTCAGGTTATAAGCAATGCCTTGAAAGTTTGGGGTTTAGAACTAATCCTGTTCAACAGTCCAGAGTA 296
|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTCTCTATTCAAGTTATAAGCAATGCTTTGAAAGTTTGGGGTTTAGAACTAATCCTGTTCAACAGTCCAGAGTA 296
Query 297 TCAGAGGCTCAGGATCGATCCTATAAATGAAAGATCATTTATATGCAATTATAAGGAACACTGGTTTACAGTTA 370
.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAGAGGCTCAGAATTGATCCTATAAACGAAAGATCCTTTATATGCAATTATAAAGAACACTGGTTTACAGTTA 370
Query 371 GAAAATTAGGAAAACAGTGGTTTAACTTGAATTCTCTCTTGACGGGTCCAGAATTAATATCAGATACATATCTT 444
||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 371 GAAAATTAGGCAAGCAGTGGTTTAACTTGAATTCTCTGTTGACGGGTCCAGAATTAATATCAGATACATACCTC 444
Query 445 GCACTTTTCTTGGCTCAATTACAACAGGAAGGTTATTCTATATTTGTCGTTAAGGGTGATCTGCCAGATTGCGA 518
|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 445 GCACTATTCTTGGCTCAATTACAGCAAGAAGGTTATTCTATATTTGTTGTTAAGGGTGATCTGCCAGATTGTGA 518
Query 519 AGCTGACCAACTCCTGCAGATGATTAGGGTCCAACAGATGCATCGACCAAAACTTATTGGAGAAGAATTAGCAC 592
||||||||||||..||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||
Sbjct 519 AGCTGACCAACTTTTGCAGATGATCAAGGTCCAACAGATGCATCGACCAAAACTTATTGGAGAGGAACTTGCAC 592
Query 593 AACTAAAAGAGCAAAGAGTCCATAAAACAGACCTGGAACGAGTGTTAGAAGCAAATGATGGCTCAGGAATGTTA 666
|.||.||||||||.||.|.||..|||.||||||||||.||.||.|||||||||..||||||.||.||.||.||.
Sbjct 593 ATCTGAAAGAGCAGAGTGCCCTCAAAGCAGACCTGGAGCGCGTCTTAGAAGCAGCTGATGGGTCGGGCATATTT 666
Query 667 GACGAAGATGAGGAGGATTTGCAGAGGGCTCTGGCACTAAGTCGCCAAGAAATTGACATGGAAGATGAGGAAGC 740
||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||..||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 667 GATGAAGATGAGGATGATTTACAGAGGGCTCTAGCCATAAGTCGCCAGGAAATCGACATGGAGGATGAAGAAGC 740
Query 741 AGATCTCCGCAGGGCTATTCAGCTAAGTATGCAAGGTAGTTCCAGAAACATATCTCAAGATATGACACAGACAT 814
.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||..||.|.|.||.|||...|||||||||
Sbjct 741 TGATCTCCGCAGGGCCATTCAGCTCAGTATGCAAGGTAGTTCCAGAAGTATGTGTGAAAATAGTCCACAGACAT 814
Query 815 CAGGTACAAATCTTACTTCAGAAGAGCTTCGGAAGAGACGAGAAGCCTACTTTGAAAAACAGCAGCAAAAGCAG 888
||.||.||.||||..|||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 815 CAAGTCCAGATCTCTCTTCAGAAGAGCTGCGGAGGAGACGAGAAGCCTACTTTGAAAAG--------------- 873
Query 889 CAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGACCTATCAGGACAGAG 962
Sbjct 874 -------------------------------------------------------------------------- 873
Query 963 TTCACATCCATGTGAAAGGCCAGCCACCAGTTCAGGAGCACTTGGGAGTGATCTAGGTGATGCTATGAGTGAAG 1036
Sbjct 874 -------------------------------------------------------------------------- 873
Query 1037 AAGACATGCTTCAGGCAGCTGTGACCATGTCTTTAGAAACTGTCAGAAATGATTAGAAAACAAAAGGAAAAAAA 1110
Sbjct 874 -------------------------------------------------------------------------- 873