Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13930
• Subject: XM_017027001.2
• Aligned Length: 1040
• Identities: 852
• Gaps: 77

Alignment

Query    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACAGAGCACATCAAATGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||..|||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGGTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCAAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAATCCGCCCACAACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|...||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTGCTGGCTACATTTGGTACAAAGGGCAAATGACATAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATATAGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAAGAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAGCATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCGGGAGGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAGAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACGCAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  370

Query  371  TCATAAAGCGAGGTGATGGGACTAGAGGAGTAACTGGATATTTCACCTTCACCTTATACCTGGAGACT-CCCAA  443
            |||||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||...|| || .||||
Sbjct  371  TCATAAAGCGACGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTACACCCAAAG-CTGTCCAA  443

Query  444  GCCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAAACTG---TGATCTTAACCTGTGATCCTG  514
            |||||.||||.|.|.||.|||||||||||||||.|||...|.|||   ||   |.|.|||.||||||||.|||.
Sbjct  444  GCCCTACATCACAATCAACAACTTAAACCCCAGAGAGAATAAGGA---TGTCTTAACCTTCACCTGTGAACCTA  514

Query  515  AGACTCCGGAC-ACAAGCTACCAGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGGTTTCAGCTGTC  587
            |||.|..|.|| || |.||||...||||||.|.||||||||||||||||||.|.|.||.||||.|..||| |.|
Sbjct  515  AGAGTAAGAACTAC-ACCTACATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCTGTCAGTCCCAGGGTAAAGC-GAC  586

Query  588  C----GAAACCAACAGGACCCTCTTTCTATTTGGTGTCAC---AAAGTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAA  654
            |    |||   |||||||.||||.|||||.....||||||   |||..|.|   |||||||.|||.||||||||
Sbjct  587  CCATTGAA---AACAGGATCCTCATTCTACCCAATGTCACGAGAAATGAAA---CAGGACCTTATCAATGTGAA  654

Query  655  ATACGGAACTCAGGGA----GTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCATGGTCCAGACCTCC  724
            ||||||.||    .||    |||.||.|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  655  ATACGGGAC----CGATATGGTGGCATCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCC  724

Query  725  CCAGAATTCACCCTTCATACACCAATTACCGTTCAGGAGATAACCTCTACTTGTCTTGCTTCGCGAACTCTAAC  798
            ||||.|||.|||||||||.||||.||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||..|.||||||
Sbjct  725  CCAGCATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTTCAGGAGAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTCGCCGAGTCTAAC  798

Query  799  CCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCAATCAGGACAAAATCTGTTTATCCCCCAAAT  872
            ||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|.||||||||||||
Sbjct  799  CCACGGGCACAATATTCTTGGACAATTAATGGGAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTCTATCCCCCAAAT  872

Query  873  TACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGTTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCGAGGAAAGCTCCACGTCGT  946
            .||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||..||..
Sbjct  873  AACTACAAAGCATAGTGGGCTCTATGCTTGCTCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCA  946

Query  947  TGACAGTCAAAGTCTCTGCTTCTACAAG--------------------AATAGGACTTCTTCCTCTCCTTATCC  1000
            |.||||||||||||||||.|     |||                    ||||||..||                
Sbjct  947  TCACAGTCAAAGTCTCTGGT-----AAGTGGATCCCAGCATCCTTGGCAATAGGGATT----------------  999

Query 1001  AACA  1004
                
Sbjct 1000  ----  999