Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13944
• Subject: NM_013646.2
• Aligned Length: 1577
• Identities: 1273
• Gaps: 182

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGAGTCAGCTCCGGCAGCCCCCGACCCCGCCGCCAGCGAACCGGGCAGCAGCGGCTCGGAGGCGGCCGCGGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTCCAGGGAGACCCCGCTGACCCAGGACACGGGCCGCAAGAGCGAGGCACCGGGCGCGGGGCGCAGGCAGAGCT  148

Query    1  AT-------------GATGTATTTTGTGATCGCAG---CGATGAA---------AGCTCAAATTGAAATTATTC  49
            ||             ||.||        |||.|||   |||.|||         |.||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGCGAGCTCCAGCCGAGGT--------ATCTCAGTCACGAAGAAGACACACACATCTCAAATTGAAATTATTC  214

Query   50  CATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGCTTT  123
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  215  CATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCGTCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACGTGTGAAGGCTGCAAGGGCTTT  288

Query  124  TTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAG  197
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  289  TTCAGGAGAAGTCAGCAGAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGGACCAG  362

Query  198  TAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTG  271
            .||||||||||||||.||.|||||..|.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct  363  CAGAAACCGCTGCCAGCATTGTCGGCTGCAGAAATGCCTGGCCGTGGGGATGTCTCGAGATGCTGTCAAGTTTG  436

Query  272  GCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGC  345
            |.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  437  GTCGGATGTCCAAGAAGCAGAGAGACAGCTTGTACGCCGAGGTGCAGAAGCACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGA  510

Query  346  GACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGA  419
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  511  GACCACCAGCAGCAGCCTGGGGAGGCGGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCAGCCAATGGGCTGACGGA  584

Query  420  ACTTCACGACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCA  493
            |||.||.||.||||||||.|.|||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  585  ACTGCATGATGACCTCAGCACCTATATGGATGGGCACACCCCCGAGGGCAGCAAGGCCGACTCAGCCGTCAGCA  658

Query  494  GCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATA  567
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||..|.||.||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct  659  GCTTCTACCTGGACATCCAGCCCTCCCCAGACCAGTCGGGATTGGACATCAATGGGATCAAACCCGAACCCATA  732

Query  568  TGTGACTACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTC  641
            ||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  733  TGTGACTACACACCAGCATCTGGCTTCTTCCCCTACTGTTCCTTCACCAACGGAGAGACTTCCCCAACCGTGTC  806

Query  642  CATGGCAGAATTAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAG  715
            ||||||||||.|||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|.||||
Sbjct  807  CATGGCAGAACTAGAACACCTTGCCCAGAACATATCCAAATCCCACCTGGAAACCTGCCAGTACTTGCGGGAAG  880

Query  716  AGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTG  789
            ||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.||||||
Sbjct  881  AGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTCCTGCAGGAGGAGATTGAAAACTACCAGAACAAGCAGAGAGAGGTG  954

Query  790  ATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGG  863
            ||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  ATGTGGCAGCTGTGTGCCATCAAGATTACAGAAGCTATCCAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGG  1028

Query  864  ATTTATGGAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAA  937
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1029  ATTTATGGAGCTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGCTCGCTAGAGGTGGTGTTTATTAGGA  1102

Query  938  TGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAA  1011
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 1103  TGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGACGGGAAGTATGCGAGCCCCGATGTCTTCAAG  1176

Query 1012  TCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGA  1085
            |||.||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 1177  TCCCTAGGTTGTGAAGACTTCATCAGCTTTGTGTTTGAATTTGGGAAGAGTTTGTGTTCTATGCACCTGACCGA  1250

Query 1086  AGATGAAATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAA  1159
            |||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1251  AGACGAAATCGCGTTATTTTCTGCATTCGTACTGATGTCAGCGGATCGCTCGTGGCTTCAGGAAAAGGTAAAAA  1324

Query 1160  TTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATA  1233
            |.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1325  TAGAAAAGCTGCAACAGAAAATTCAGCTGGCCCTTCAGCACGTCCTACAGAAGAACCACCGAGAAGATGGAATT  1398

Query 1234  CTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGTCTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATT  1307
            |||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1399  CTAACCAAGCTAATATGCAAGGTGTCTACGTTAAGAGCCCTATGTGGACGACATACGGAAAAGCTAATGGCATT  1472

Query 1308  TAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTG  1381
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1473  TAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACTCCATTTTCCTCCATTATACAAGGAATTGTTCACTTCAGAATTTG  1546

Query 1382  AGCCAGCAATGC-AATTGATGGG  1403
            |||||||.|||| |||.||||||
Sbjct 1547  AGCCAGCCATGCAAATCGATGGG  1569