Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13944
• Subject: XM_005254584.5
• Aligned Length: 1432
• Identities: 1396
• Gaps: 30

Alignment

Query    1  ATGAT--------GT--------ATTTTGTGATCGCAG---CGATGAA---------AGCTCAAATTGAAATTA  46
            |||.|        ||        ||||.|| |||.|||   |||.|||         |.|||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTCACGGGGAGTCAGTCAACATTTGGT-ATCTCAGTAACGAAGAAGACACATACATCTCAAATTGAAATTA  73

Query   47  TTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGC  120
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  TTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGC  147

Query  121  TTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAAC  194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  TTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAAC  221

Query  195  CAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAAAAT  268
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  CAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAAAAT  295

Query  269  TTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAG  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  TTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAG  369

Query  343  CGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGAC  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  CGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGAC  443

Query  417  GGAACTTCACGACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCA  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GGAACTTCACGACGACCTCAGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCA  517

Query  491  GCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCA  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  GCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCA  591

Query  565  ATATGTGACTACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGT  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  ATATGTGACTACACACCAGCATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGT  665

Query  639  GTCCATGGCAGAATTAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAG  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  GTCCATGGCAGAATTAGAACACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAG  739

Query  713  AAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAG  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  AAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAG  813

Query  787  GTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGA  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  GTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGA  887

Query  861  TGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCA  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  TGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCA  961

Query  935  GAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTC  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  GAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTC  1035

Query 1009  AAATCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGAC  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  AAATCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGAC  1109

Query 1083  TGAAGATGAAATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAA  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  TGAAGATGAAATTGCATTATTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAA  1183

Query 1157  AAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGA  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  AAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGA  1257

Query 1231  ATACTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGTCTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGC  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  ATACTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGTCTACCTTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGC  1331

Query 1305  ATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAAT  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  ATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAAT  1405

Query 1379  TTGAGCCAGCAATGC-AATTGATGGG  1403
            ||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1406  TTGAGCCAGCAATGCAAATTGATGGG  1431