Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_13944
- Subject:
- XM_006510877.3
- Aligned Length:
- 1561
- Identities:
- 1279
- Gaps:
- 159
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAAGGAGCTCATGTGGCTCTCTCATTGCTTCCCTTCCCCGTCTGTAGAATGGGAGCGCGAACAGTTGCCTCC 74
Query 1 --------------------------------------ATGATGT-----ATTTTG------------------ 13
|.||.|| |.||||
Sbjct 75 TTCAGGGATGCTGTGCACACGGAAGTCAAAACAAGCTAACGAGGTCCAAAACTTTGAAAACCGCACAGAGCTCT 148
Query 14 ------------TGATCG-CAGCGAT----GAAA-----GCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGG 65
|| ||| |||.|.| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGAACTCTGGGCTG-TCGTCAGTGCTGCCGGAAAATGGCGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGG 221
Query 66 AGACAAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGC 139
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 222 AGACAAATCGTCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACGTGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGC 295
Query 140 AAAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAA 213
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 296 AGAGCAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGGACCAGCAGAAACCGCTGCCAG 369
Query 214 CACTGTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAA 287
||.|||||..|.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||
Sbjct 370 CATTGTCGGCTGCAGAAATGCCTGGCCGTGGGGATGTCTCGAGATGCTGTCAAGTTTGGTCGGATGTCCAAGAA 443
Query 288 GCAGAGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGC 361
||||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 444 GCAGAGAGACAGCTTGTACGCCGAGGTGCAGAAGCACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGAGACCACCAGCAGCAGC 517
Query 362 CTGGAGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTC 435
||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 518 CTGGGGAGGCGGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCAGCCAATGGGCTGACGGAACTGCATGATGACCTC 591
Query 436 AGTAACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACAT 509
||.|.|||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 592 AGCACCTATATGGATGGGCACACCCCCGAGGGCAGCAAGGCCGACTCAGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACAT 665
Query 510 ACAGCCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACTACACACCAG 583
.|||||.||||||||||||||.||..|.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 666 CCAGCCCTCCCCAGACCAGTCGGGATTGGACATCAATGGGATCAAACCCGAACCCATATGTGACTACACACCAG 739
Query 584 CATCAGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAA 657
||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 740 CATCTGGCTTCTTCCCCTACTGTTCCTTCACCAACGGAGAGACTTCCCCAACCGTGTCCATGGCAGAACTAGAA 813
Query 658 CACCTTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAAC 731
||||||||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||||
Sbjct 814 CACCTTGCCCAGAACATATCCAAATCCCACCTGGAAACCTGCCAGTACTTGCGGGAAGAGCTCCAGCAGATAAC 887
Query 732 GTGGCAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTG 805
||||||||||||..|.|||||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.||||||||||||||..||||||
Sbjct 888 GTGGCAGACCTTCCTGCAGGAGGAGATTGAAAACTACCAGAACAAGCAGAGAGAGGTGATGTGGCAGCTGTGTG 961
Query 806 CCATCAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAACTGTGT 879
|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 962 CCATCAAGATTACAGAAGCTATCCAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAGCTGTGT 1035
Query 880 CAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGA 953
||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1036 CAAAATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGCTCGCTAGAGGTGGTGTTTATTAGGATGTGCCGTGCCTTTGA 1109
Query 954 CTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAG 1027
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||||||||||
Sbjct 1110 CTCTCAGAACAACACCGTGTACTTTGACGGGAAGTATGCGAGCCCCGATGTCTTCAAGTCCCTAGGTTGTGAAG 1183
Query 1028 ACTTTATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTA 1101
||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct 1184 ACTTCATCAGCTTTGTGTTTGAATTTGGGAAGAGTTTGTGTTCTATGCACCTGACCGAAGACGAAATCGCGTTA 1257
Query 1102 TTTTCTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACA 1175
|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1258 TTTTCTGCATTCGTACTGATGTCAGCGGATCGCTCGTGGCTTCAGGAAAAGGTAAAAATAGAAAAGCTGCAACA 1331
Query 1176 GAAAATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAAAGTTAATAT 1249
||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||.||||||
Sbjct 1332 GAAAATTCAGCTGGCCCTTCAGCACGTCCTACAGAAGAACCACCGAGAAGATGGAATTCTAACCAAGCTAATAT 1405
Query 1250 GCAAGGTGTCTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCA 1323
|||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406 GCAAGGTGTCTACGTTAAGAGCCCTATGTGGACGACATACGGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCA 1479
Query 1324 GACATTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCAATGC-AAT 1396
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||| |||
Sbjct 1480 GACATTGTGCGACTCCATTTTCCTCCATTATACAAGGAATTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCCATGCAAAT 1553
Query 1397 TGATGGG 1403
.||||||
Sbjct 1554 CGATGGG 1560