Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13944
• Subject: XM_011521877.3
• Aligned Length: 1409
• Identities: 1390
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGATGTATTTTGTG-----ATCGCAGCGATGAAAGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGAC  69
            ||||  .||||.|||     |.||||      |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGA--AATTTCGTGAAGGAACCGCA------ATAGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGAC  66

Query   70  AAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAG  143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  AAATCATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAG  140

Query  144  CAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACT  217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  141  CAATGCCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACT  214

Query  218  GTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAG  291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  GTCGATTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAG  288

Query  292  AGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGG  365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  AGAGACAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGG  362

Query  366  AGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTA  439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  AGAGGCTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTA  436

Query  440  ACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAG  513
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  ACTACATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAG  510

Query  514  CCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACTACACACCAGCATC  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  CCTTCCCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACTACACACCAGCATC  584

Query  588  AGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAACACC  661
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  AGGCTTCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAACACC  658

Query  662  TTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGG  735
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  TTGCACAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGG  732

Query  736  CAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCAT  809
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  CAGACCTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCAT  806

Query  810  CAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAA  883
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  CAAAATTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAA  880

Query  884  ATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCT  957
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  ATGATCAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCT  954

Query  958  CAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAGACTT  1031
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  CAGAACAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAGACTT  1028

Query 1032  TATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTT  1105
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  TATTAGCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTT  1102

Query 1106  CTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAA  1179
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103  CTGCATTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAA  1176

Query 1180  ATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAAAGTTAATATGCAA  1253
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177  ATTCAGCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAAAGTTAATATGCAA  1250

Query 1254  GGTGTCTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACA  1327
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251  GGTGTCTACCTTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACA  1324

Query 1328  TTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCAATGC-AATTGAT  1400
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
Sbjct 1325  TTGTGCGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCAATGCAAATTGAT  1398

Query 1401  GGG  1403
            |||
Sbjct 1399  GGG  1401