Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13944
• Subject: XM_011521878.2
• Aligned Length: 1404
• Identities: 1156
• Gaps: 247

Alignment

Query    1  ATGATGTATTTTGTGATCGCAGCGATGAAAGCTCAAATTGAAATTATTCCATGCAAGATCTGTGGAGACAAATC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ATCAGGAATCCATTATGGTGTCATTACATGTGAAGGCTGCAAGGGCTTTTTCAGGAGAAGTCAGCAAAGCAATG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CCACCTACTCCTGTCCTCGTCAGAAGAACTGTTTGATTGATCGAACCAGTAGAAACCGCTGCCAACACTGTCGA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TTACAGAAATGCCTTGCCGTAGGGATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGA  296
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------ATGTCTCGAGATGCTGTAAAATTTGGCCGAATGTCAAAAAAGCAGAGAGA  50

Query  297  CAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   51  CAGCTTGTATGCAGAAGTACAGAAACACCGGATGCAGCAGCAGCAGCGCGACCACCAGCAGCAGCCTGGAGAGG  124

Query  371  CTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTAACTAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  125  CTGAGCCGCTGACGCCCACCTACAACATCTCGGCCAACGGGCTGACGGAACTTCACGACGACCTCAGTAACTAC  198

Query  445  ATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  199  ATTGACGGGCACACCCCTGAGGGGAGTAAGGCAGACTCCGCCGTCAGCAGCTTCTACCTGGACATACAGCCTTC  272

Query  519  CCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACTACACACCAGCATCAGGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  273  CCCAGACCAGTCAGGTCTTGATATCAATGGAATCAAACCAGAACCAATATGTGACTACACACCAGCATCAGGCT  346

Query  593  TCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAACACCTTGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  347  TCTTTCCCTACTGTTCGTTCACCAACGGCGAGACTTCCCCAACTGTGTCCATGGCAGAATTAGAACACCTTGCA  420

Query  667  CAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  CAGAATATATCTAAATCGCATCTGGAAACCTGCCAATACTTGAGAGAAGAGCTCCAGCAGATAACGTGGCAGAC  494

Query  741  CTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  495  CTTTTTACAGGAAGAAATTGAGAACTATCAAAACAAGCAGCGGGAGGTGATGTGGCAATTGTGTGCCATCAAAA  568

Query  815  TTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  569  TTACAGAAGCTATACAGTATGTGGTGGAGTTTGCCAAACGCATTGATGGATTTATGGAACTGTGTCAAAATGAT  642

Query  889  CAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  643  CAAATTGTGCTTCTAAAAGCAGGTTCTCTAGAGGTGGTGTTTATCAGAATGTGCCGTGCCTTTGACTCTCAGAA  716

Query  963  CAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  717  CAACACCGTGTACTTTGATGGGAAGTATGCCAGCCCCGACGTCTTCAAATCCTTAGGTTGTGAAGACTTTATTA  790

Query 1037  GCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTTCTGCA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  791  GCTTTGTGTTTGAATTTGGAAAGAGTTTATGTTCTATGCACCTGACTGAAGATGAAATTGCATTATTTTCTGCA  864

Query 1111  TTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  865  TTTGTACTGATGTCAGCAGATCGCTCATGGCTGCAAGAAAAGGTAAAAATTGAAAAACTGCAACAGAAAATTCA  938

Query 1185  GCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  939  GCTAGCTCTTCAACACGTCCTACAGAAGAATCACCGAGAAGATGGAATACTAACAAAGTTAATATGCAAGGTGT  1012

Query 1259  CTACATTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTG  1332
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1013  CTACCTTAAGAGCCTTATGTGGACGACATACAGAAAAGCTAATGGCATTTAAAGCAATATACCCAGACATTGTG  1086

Query 1333  CGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCAATGC-AATTGATGGG  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct 1087  CGACTTCATTTTCCTCCATTATACAAGGAGTTGTTCACTTCAGAATTTGAGCCAGCAATGCAAATTGATGGG  1158