Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_13958
• Subject: XM_011514819.2
• Aligned Length: 1552
• Identities: 1313
• Gaps: 238

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGGGCTAAACTTGGTAATCCTAGAAAGTCAATATTGTGTAAAGTTGAGAGAAAAGTCTTCACAGCGGAAGAA  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  GAAATCACTTTTTTGTCCCGAATCAGTGGGTGGAGGCAAAACCCTTCAGCAAGAAGAGAAGCAACTTCAGCCGT  148

Query    1  --ATGCAAATGGATAACCGGTTGCCTCCCAAAAAAGTTCCAGGTTTCTGTTCCTTTCGCTATGGATTGTCTTTC  72
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATGCAAATGGATAACCGGTTGCCTCCCAAAAAAGTTCCAGGTTTCTGTTCCTTTCGCTATGGATTGTCTTTC  222

Query   73  CTTGTGCACTGTTGTAATGTTATAATAACAGCACAGCGTGCGTGCCTGAACCTCACAATGGTAGTCATGGTGAA  146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTGTGCACTGTTGTAATGTTATAATAACAGCACAGCGTGCGTGCCTGAACCTCACAATGGTAGTCATGGTGAA  296

Query  147  TAGCACAGATCCACATGGTTTGCCCAACACCTCCACAAAGAAGCTCCTGGATAATATAAAGAACCCTATGTATA  220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TAGCACAGATCCACATGGTTTGCCCAACACCTCCACAAAGAAGCTCCTGGATAATATAAAGAACCCTATGTATA  370

Query  221  ATTGGAGCCCAGATATCCAGGGAATCATCTTGAGTTCCACCTCCTATGGTGTCATCATCATCCAAGTTCCTGTT  294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTGGAGCCCAGATATCCAGGGAATCATCTTGAGTTCCACCTCCTATGGTGTCATCATCATCCAAGTTCCTGTT  444

Query  295  GGATACTTCTCTGGAATATATTCTACAAAGAAAATGATTGGCTTTGCATTATGCCTCAGCTCTGTGTTAAGCCT  368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGATACTTCTCTGGAATATATTCTACAAAGAAAATGATTGGCTTTGCATTATGCCTCAGCTCTGTGTTAAGCCT  518

Query  369  GCTCATCCCACCAGCAGCTGGAATTGGAGTAGCTTGGGTCGTTGTATGTCGAGCAGTTCAGGGAGCAGCCCAGG  442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTCATCCCACCAGCAGCTGGAATTGGAGTAGCTTGGGTCGTTGTATGTCGAGCAGTTCAGGGAGCAGCCCAGG  592

Query  443  GGATAGTTGCAACAGCCCAGTTTGAAATATATGTCAAATGGGCTCCTCCCCTGGAACGAGGCCGACTTACTTCT  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGATAGTTGCAACAGCCCAGTTTGAAATATATGTCAAATGGGCTCCTCCCCTGGAACGAGGCCGACTTACTTCT  666

Query  517  ATGAGTACATCAGGGTTTTTGCTGGGACCCTTTATTGTCCTACTTGTGACTGGAGTTATCTGTGAATCTCTGGG  590
            ||||||||||||                                                              
Sbjct  667  ATGAGTACATCA--------------------------------------------------------------  678

Query  591  CTGGCCCATGGTCTTCTATATTTTTGGTGCTTGTGGCTGTGCCGTATGTCTTCTCTGGTTCGTTCTGTTTTATG  664
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  679  -------------------------GGTGCTTGTGGCTGTGCCGTATGTCTTCTCTGGTTCGTTCTGTTTTATG  727

Query  665  ATGACCCCAAAGACCACCCATGTATAAGCATCAGTGAAAAGGAATACATCACATCCTCCCTGGTCCAGCAGGTC  738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  728  ATGACCCCAAAGACCACCCATGTATAAGCATCAGTGAAAAGGAATACATCACATCCTCCCTGGTCCAGCAGGTC  801

Query  739  AGTTCAAGTAGACAATCTCTGCCTATCAAGGCTATACTTAAGTCGCTTCCAGTCTGGGCTATTTCCACTGGTAG  812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  802  AGTTCAAGTAGACAATCTCTGCCTATCAAGGCTATACTTAAGTCGCTTCCAGTCTGGGCTATTTCCACTGGTAG  875

Query  813  TTTTACGTTTTTCTGGTCACATAACATCATGACACTATACACTCCAATGTTTATCAACTCCATGCTTCATGTTA  886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  876  TTTTACGTTTTTCTGGTCACATAACATCATGACACTATACACTCCAATGTTTATCAACTCCATGCTTCATGTTA  949

Query  887  ATATAAAAGAGAATGGGTTCTTGTCTTCCCCTTCCCTATTTGTTTGCCTGGATCTGTGGTAACCTAGCAGGTCA  960
            ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  950  ATATAAAAGAGAATGGGTTCTTGTCTT-CCCTTCCCTATTTGTTTGCCTGGATCTGTGGTAACCTAGCAGGTCA  1022

Query  961  GTTATCAGACTTCTTCCTGACCAGGAATATTCTCAGCGTAATTGCTGTCCGGAAACCCTTCACAGCAGCAGGAT  1034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1023  GTTATCAGACTTCTTCCTGACCAGGAATATTCTCAGCGTAATTGCTGTCCGGAAACTCTTCACAGCAGCAGGAT  1096

Query 1035  TTCTCCTTCCTGCAATCTTTGGTGTCTGCCTGCCTTACCTGAGTTCCACCTTCTACAGCATTGTCATTTTCCTA  1108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097  TTCTCCTTCCTGCAATCTTTGGTGTCTGCCTGCCTTACCTGAGTTCCACCTTCTACAGCATTGTCATTTTCCTA  1170

Query 1109  ATACTTGCTGGTGCAACAGGCAGCTTTTGCTTGGGTGGAGTGTTTATAAATGGCTTGGATATTGCTCCCAGATA  1182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171  ATACTTGCTGGTGCAACAGGCAGCTTTTGCTTGGGTGGAGTGTTTATAAATGGCTTGGATATTGCTCCCAGATA  1244

Query 1183  TTTTGGATTTATTAAAGCATGTTCAACTTTAACTGGAATGATAGGAGGACTAATTGCTTCCACTTTGACTGGAT  1256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1245  TTTTGGATTTATTAAAGCATGTTCAACTTTAACTGGAATGATAGGAGGACTAATTGCTTCCACTTTGACTGGAT  1318

Query 1257  TGATCCTTAAGCAGGATCCGGAATCCGCCTGGTTTAAAACCTTCATCCTGATGGCAGCCATTAATGTGACTGGC  1330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1319  TGATCCTTAAGCAGGATCCGGAATCCGCCTGGTTTAAAACCTTCATCCTGATGGCAGCCATTAATGTGACTGGC  1392

Query 1331  CTAATTTTCTACCTTATAGTTGCTACAGCAGAAATTCAGGACTGGGCTAAAGAAAAACAACACACACGTCTC  1402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393  CTAATTTTCTACCTTATAGTTGCTACAGCAGAAATTCAGGACTGGGCTAAAGAAAAACAACACACACGTCTC  1464