Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14105
• Subject: NM_001320766.2
• Aligned Length: 1766
• Identities: 1746
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSQSDLGYVPAIQGAEEIDSLVDSDFRMVLRKLSK  74
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Sbjct    1  MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSQSDLGYVPAIQGAEEIDSLVDSDFRMVLRKLSK  74

Query   75  KDVTTKLKAMQEFGTMCTERDTETVKGVLPYWPRIFCKISLDHDRRVREATQQAFEKLILKVKKQLAPYLKSLM  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  KDVTTKLKAMQEFGTMCTERDTETVKGVLPYWPRIFCKISLDHDRRVREATQQAFEKLILKVKKQLAPYLKSLM  148

Query  149  GYWLMAQCDTYTPAAFAAKDAFEAAFPPSKQPEAIAFCKDEITSVLQDHLIKETPDTLSDPQTVPEEEREAKFY  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GYWLMAQCDTYTPAAFAAKDAFEAAFPPSKQPEAIAFCKDEITSVLQDHLIKETPDTLSDPQTVPEEEREAKFY  222

Query  223  RVVTCSLLALKRLLCLLPDNELDSLEEKFKSLLSQNKFWKYGKHSVPQIRSAYFELVSALCQRIPQLMKEEASK  296
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Sbjct  223  RVVTCSLLALKRLLCLLPDNELDSLEEKFKSLLSQNKFWKYGKHSVPQIRSAYFELVSALCQRIPQLMKEEASK  296

Query  297  VSPSVLLSIDDSDPIVCPALWEAVLYTLTTIEDCWLHVNAKKSVFPKLSTVIREGGRGLATVIYPYLLPFISKL  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  VSPSVLLSIDDSDPIVCPALWEAVLYTLTTIEDCWLHVNAKKSVFPKLSTVIREGGRGLATVIYPYLLPFISKL  370

Query  371  PQSITNPKLDFFKNFLTSLVAGLSTERTKTSSSESSAVISAFFECLRFIMQQNLGEEEIEQMLVNDQLXPFIDA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  371  PQSITNPKLDFFKNFLTSLVAGLSTERTKTSSLESSAVISAFFECLRFIMQQNLGEEEIEQMLVNDQLIPFIDA  444

Query  445  VLKDPGLQHGQLFNHLAETLSSWEAKADTEKDEKTAHNLENVLIHFWERLSEICVAKISEPEADVESVLGVSNL  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  VLKDPGLQHGQLFNHLAETLSSWEAKADTEKDEKTAHNLENVLIHFWERLSEICVAKISEPEADVESVLGVSNL  518

Query  519  LQVLQKPKSSLKSSKKKNXKVRFADEILESNKENEKCVSSEGEKIEGWELTTEPSLTHNSSGLLSPLRKKPLED  592
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  LQVLQKPKSSLKSSKKKNGKVRFADEILESNKENEKCVSSEGEKIEGWELTTEPSLTHNSSGLLSPLRKKPLED  592

Query  593  LVCKLADISINYVNERKSEQHLRFLSTLLDSFSSSRVFKMLLGDEKQSIVQAKPLEIAKLVQKNPAVQFLYQKL  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  LVCKLADISINYVNERKSEQHLRFLSTLLDSFSSSRVFKMLLGDEKQSIVQAKPLEIAKLVQKNPAVQFLYQKL  666

Query  667  IGWLNEDQRKDFGFLVDILYSALRCCDNDMERKKVLDDLTKVDLKWNSLLKIIEKACPSSDKHALVTPWLKGDI  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              ||||||||||||||||||||
Sbjct  667  IGWLNEDQRKDFGFLVDILYSALRCCDNDMERKKVLDDLT--------------KACPSSDKHALVTPWLKGDI  726

Query  741  LGEKLVNLADCLCNEDLESRVSSESHFSERWTLLSLVLSQHVKNDYLIGDVYVERIIVRLHETLFKTKKLSEAE  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  727  LGEKLVNLADCLCNEDLESRVSSESHFSERWTLLSLVLSQHVKNDYLIGDVYVERIIVRLHETLFKTKKLSEAE  800

Query  815  SSDSSVSFICDVAYNYFSSAKGCLLMPSSEDLLLTLFQLCAQSKEKTHLPDFLICKLKNTWLSGVNLLVHQTDS  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  801  SSDSSVSFICDVAYNYFSSAKGCLLMPSSEDLLLTLFQLCAQSKEKTHLPDFLICKLKNTWLSGVNLLVHQTDS  874

Query  889  SYKESTFLHLSALWLKNQVQASSLDINSLQVLLSAVDDLLNTLLESEDSYLMGVYIGSVMPNDSEWEKMRQSLP  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  875  SYKESTFLHLSALWLKNQVQASSLDINSLQVLLSAVDDLLNTLLESEDSYLMGVYIGSVMPNDSEWEKMRQSLP  948

Query  963  MQWLHRPLLEGRLSLNYECFKTDFKEQDIKTLPSHLCTSALLSKMVLIALRKETVLENNELEKIIAELLYSLQW  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  949  MQWLHRPLLEGRLSLNYECFKTDFKEQDIKTLPSHLCTSALLSKMVLIALRKETVLENNELEKIIAELLYSLQW  1022

Query 1037  CEELDNPPIFLIGFCEILQKMNITYDNLRVLGNTSGLLQLLFNRSREHGTLWSLIIAKLILSRSISSDEVKPHY  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1023  CEELDNPPIFLIGFCEILQKMNITYDNLRVLGNTSGLLQLLFNRSREHGTLWSLIIAKLILSRSISSDEVKPHY  1096

Query 1111  KRKESFFPLTEGNLHTIQSLCPFLSKEEKKEFSAQCIPALLGWTKKDLCSTNGGFGHLAIFNSCLQTKSIDDGE  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1097  KRKESFFPLTEGNLHTIQSLCPFLSKEEKKEFSAQCIPALLGWTKKDLCSTNGGFGHLAIFNSCLQTKSIDDGE  1170

Query 1185  LLHGILKIIISWKKEHEDIFLFSCNLSEASPEVLGVNIEIIRFLSLFLKYCSSPLAESEWDFIMCSMLAWLETT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1171  LLHGILKIIISWKKEHEDIFLFSCNLSEASPEVLGVNIEIIRFLSLFLKYCSSPLAESEWDFIMCSMLAWLETT  1244

Query 1259  SENQALYSIPLVQLFACVSRDLACDLSAFFDSTTLDTIGNLPVNLISEWKEFFSQGIHSLLLPILVTVTGENKD  1332
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Sbjct 1245  SENQALYSIPLVQLFACVSCDLACDLSAFFDSTTLDTIGNLPVNLISEWKEFFSQGIHSLLLPILVTVTGENKD  1318

Query 1333  VSETSFQNAMLKPMCETLTYISKEQLLSHKLPARLVADQKTNLPEYLQTLLNTLAPLLLFRARPVQIAVYHMLY  1406
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Sbjct 1319  VSETSFQNAMLKPMCETLTYISKEQLLSHKLPARLVADQKTNLPEYLQTLLNTLAPLLLFRARPVQIAVYHMLY  1392

Query 1407  KLMPELPQYDQDNLKSYGDEEEEPALSPPAALMSLLSIQEDLLENVLGCIPVGQIVTIKPLSEDFCYVLGYLLT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1393  KLMPELPQYDQDNLKSYGDEEEEPALSPPAALMSLLSIQEDLLENVLGCIPVGQIVTIKPLSEDFCYVLGYLLT  1466

Query 1481  WKLILTFFKAASSQLRALYSMYLRKTKSLNKLLYHLFRLMPENPTYAETAVEVPNKDPKTFFTEELQLSIRETT  1554
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Sbjct 1467  WKLILTFFKAASSQLRALYSMYLRKTKSLNKLLYHLFRLMPENPTYAETAVEVPNKDPKTFFTEELQLSIRETT  1540

Query 1555  MLPYHIPHLACSVYHMTLKDLPAMVRLWWNSSEKRVFNIVDRFTSKYVSSVLSFQEISSVQTSTQLFNGMTVKA  1628
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Sbjct 1541  MLPYHIPHLACSVYHMTLKDLPAMVRLWWNSSEKRVFNIVDRFTSKYVSSVLSFQEISSVQTSTQLFNGMTVKA  1614

Query 1629  RATTREVMATYTIEDIVIELIIQLPSNYPLGSIIVESGKRVGVAVQQWRNWMLQLSTYLTHQNGSIMEGLALWK  1702
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Sbjct 1615  RATTREVMATYTIEDIVIELIIQLPSNYPLGSIIVESGKRVGVAVQQWRNWMLQLSTYLTHQNGSIMEGLALWK  1688

Query 1703  NNVDKRFEGVEDCMICFSVIHGFNYSLPKKACRTCKKKFHSACLYKWFTSSNKSTCPLCRERFS  1766
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Sbjct 1689  NNVDKRFEGVEDCMICFSVIHGFNYSLPKKACRTCKKKFHSACLYKWFTSSNKSTCPLCRETFF  1752