Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14105
• Subject: NM_015565.3
• Aligned Length: 1766
• Identities: 1760
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSQSDLGYVPAIQGAEEIDSLVDSDFRMVLRKLSK  74
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Sbjct    1  MGGKNKQRTKGNLRPSNSGRAAELLAKEQGTVPGFIGFGTSQSDLGYVPAIQGAEEIDSLVDSDFRMVLRKLSK  74

Query   75  KDVTTKLKAMQEFGTMCTERDTETVKGVLPYWPRIFCKISLDHDRRVREATQQAFEKLILKVKKQLAPYLKSLM  148
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Sbjct   75  KDVTTKLKAMQEFGTMCTERDTETVKGVLPYWPRIFCKISLDHDRRVREATQQAFEKLILKVKKQLAPYLKSLM  148

Query  149  GYWLMAQCDTYTPAAFAAKDAFEAAFPPSKQPEAIAFCKDEITSVLQDHLIKETPDTLSDPQTVPEEEREAKFY  222
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Sbjct  149  GYWLMAQCDTYTPAAFAAKDAFEAAFPPSKQPEAIAFCKDEITSVLQDHLIKETPDTLSDPQTVPEEEREAKFY  222

Query  223  RVVTCSLLALKRLLCLLPDNELDSLEEKFKSLLSQNKFWKYGKHSVPQIRSAYFELVSALCQRIPQLMKEEASK  296
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Sbjct  223  RVVTCSLLALKRLLCLLPDNELDSLEEKFKSLLSQNKFWKYGKHSVPQIRSAYFELVSALCQRIPQLMKEEASK  296

Query  297  VSPSVLLSIDDSDPIVCPALWEAVLYTLTTIEDCWLHVNAKKSVFPKLSTVIREGGRGLATVIYPYLLPFISKL  370
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Sbjct  297  VSPSVLLSIDDSDPIVCPALWEAVLYTLTTIEDCWLHVNAKKSVFPKLSTVIREGGRGLATVIYPYLLPFISKL  370

Query  371  PQSITNPKLDFFKNFLTSLVAGLSTERTKTSSSESSAVISAFFECLRFIMQQNLGEEEIEQMLVNDQLXPFIDA  444
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Sbjct  371  PQSITNPKLDFFKNFLTSLVAGLSTERTKTSSLESSAVISAFFECLRFIMQQNLGEEEIEQMLVNDQLIPFIDA  444

Query  445  VLKDPGLQHGQLFNHLAETLSSWEAKADTEKDEKTAHNLENVLIHFWERLSEICVAKISEPEADVESVLGVSNL  518
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Sbjct  445  VLKDPGLQHGQLFNHLAETLSSWEAKADTEKDEKTAHNLENVLIHFWERLSEICVAKISEPEADVESVLGVSNL  518

Query  519  LQVLQKPKSSLKSSKKKNXKVRFADEILESNKENEKCVSSEGEKIEGWELTTEPSLTHNSSGLLSPLRKKPLED  592
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Sbjct  519  LQVLQKPKSSLKSSKKKNGKVRFADEILESNKENEKCVSSEGEKIEGWELTTEPSLTHNSSGLLSPLRKKPLED  592

Query  593  LVCKLADISINYVNERKSEQHLRFLSTLLDSFSSSRVFKMLLGDEKQSIVQAKPLEIAKLVQKNPAVQFLYQKL  666
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Sbjct  593  LVCKLADISINYVNERKSEQHLRFLSTLLDSFSSSRVFKMLLGDEKQSIVQAKPLEIAKLVQKNPAVQFLYQKL  666

Query  667  IGWLNEDQRKDFGFLVDILYSALRCCDNDMERKKVLDDLTKVDLKWNSLLKIIEKACPSSDKHALVTPWLKGDI  740
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Sbjct  667  IGWLNEDQRKDFGFLVDILYSALRCCDNDMERKKVLDDLTKVDLKWNSLLKIIEKACPSSDKHALVTPWLKGDI  740

Query  741  LGEKLVNLADCLCNEDLESRVSSESHFSERWTLLSLVLSQHVKNDYLIGDVYVERIIVRLHETLFKTKKLSEAE  814
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Sbjct  741  LGEKLVNLADCLCNEDLESRVSSESHFSERWTLLSLVLSQHVKNDYLIGDVYVERIIVRLHETLFKTKKLSEAE  814

Query  815  SSDSSVSFICDVAYNYFSSAKGCLLMPSSEDLLLTLFQLCAQSKEKTHLPDFLICKLKNTWLSGVNLLVHQTDS  888
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Sbjct  815  SSDSSVSFICDVAYNYFSSAKGCLLMPSSEDLLLTLFQLCAQSKEKTHLPDFLICKLKNTWLSGVNLLVHQTDS  888

Query  889  SYKESTFLHLSALWLKNQVQASSLDINSLQVLLSAVDDLLNTLLESEDSYLMGVYIGSVMPNDSEWEKMRQSLP  962
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Sbjct  889  SYKESTFLHLSALWLKNQVQASSLDINSLQVLLSAVDDLLNTLLESEDSYLMGVYIGSVMPNDSEWEKMRQSLP  962

Query  963  MQWLHRPLLEGRLSLNYECFKTDFKEQDIKTLPSHLCTSALLSKMVLIALRKETVLENNELEKIIAELLYSLQW  1036
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Sbjct  963  MQWLHRPLLEGRLSLNYECFKTDFKEQDIKTLPSHLCTSALLSKMVLIALRKETVLENNELEKIIAELLYSLQW  1036

Query 1037  CEELDNPPIFLIGFCEILQKMNITYDNLRVLGNTSGLLQLLFNRSREHGTLWSLIIAKLILSRSISSDEVKPHY  1110
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Sbjct 1037  CEELDNPPIFLIGFCEILQKMNITYDNLRVLGNTSGLLQLLFNRSREHGTLWSLIIAKLILSRSISSDEVKPHY  1110

Query 1111  KRKESFFPLTEGNLHTIQSLCPFLSKEEKKEFSAQCIPALLGWTKKDLCSTNGGFGHLAIFNSCLQTKSIDDGE  1184
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Sbjct 1111  KRKESFFPLTEGNLHTIQSLCPFLSKEEKKEFSAQCIPALLGWTKKDLCSTNGGFGHLAIFNSCLQTKSIDDGE  1184

Query 1185  LLHGILKIIISWKKEHEDIFLFSCNLSEASPEVLGVNIEIIRFLSLFLKYCSSPLAESEWDFIMCSMLAWLETT  1258
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Sbjct 1185  LLHGILKIIISWKKEHEDIFLFSCNLSEASPEVLGVNIEIIRFLSLFLKYCSSPLAESEWDFIMCSMLAWLETT  1258

Query 1259  SENQALYSIPLVQLFACVSRDLACDLSAFFDSTTLDTIGNLPVNLISEWKEFFSQGIHSLLLPILVTVTGENKD  1332
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Sbjct 1259  SENQALYSIPLVQLFACVSCDLACDLSAFFDSTTLDTIGNLPVNLISEWKEFFSQGIHSLLLPILVTVTGENKD  1332

Query 1333  VSETSFQNAMLKPMCETLTYISKEQLLSHKLPARLVADQKTNLPEYLQTLLNTLAPLLLFRARPVQIAVYHMLY  1406
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Sbjct 1333  VSETSFQNAMLKPMCETLTYISKEQLLSHKLPARLVADQKTNLPEYLQTLLNTLAPLLLFRARPVQIAVYHMLY  1406

Query 1407  KLMPELPQYDQDNLKSYGDEEEEPALSPPAALMSLLSIQEDLLENVLGCIPVGQIVTIKPLSEDFCYVLGYLLT  1480
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Sbjct 1407  KLMPELPQYDQDNLKSYGDEEEEPALSPPAALMSLLSIQEDLLENVLGCIPVGQIVTIKPLSEDFCYVLGYLLT  1480

Query 1481  WKLILTFFKAASSQLRALYSMYLRKTKSLNKLLYHLFRLMPENPTYAETAVEVPNKDPKTFFTEELQLSIRETT  1554
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Sbjct 1481  WKLILTFFKAASSQLRALYSMYLRKTKSLNKLLYHLFRLMPENPTYAETAVEVPNKDPKTFFTEELQLSIRETT  1554

Query 1555  MLPYHIPHLACSVYHMTLKDLPAMVRLWWNSSEKRVFNIVDRFTSKYVSSVLSFQEISSVQTSTQLFNGMTVKA  1628
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Sbjct 1555  MLPYHIPHLACSVYHMTLKDLPAMVRLWWNSSEKRVFNIVDRFTSKYVSSVLSFQEISSVQTSTQLFNGMTVKA  1628

Query 1629  RATTREVMATYTIEDIVIELIIQLPSNYPLGSIIVESGKRVGVAVQQWRNWMLQLSTYLTHQNGSIMEGLALWK  1702
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Sbjct 1629  RATTREVMATYTIEDIVIELIIQLPSNYPLGSIIVESGKRVGVAVQQWRNWMLQLSTYLTHQNGSIMEGLALWK  1702

Query 1703  NNVDKRFEGVEDCMICFSVIHGFNYSLPKKACRTCKKKFHSACLYKWFTSSNKSTCPLCRERFS  1766
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Sbjct 1703  NNVDKRFEGVEDCMICFSVIHGFNYSLPKKACRTCKKKFHSACLYKWFTSSNKSTCPLCRETFF  1766