Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14114
• Subject: XM_005247358.3
• Aligned Length: 2847
• Identities: 2615
• Gaps: 232

Alignment

Query    1  ATGAAGGTTGCACGTTTTCAAAAAATACCTAATGGTGAAAATGAGACAATGATTCCTGTATTGACATCAAAAAA  74
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------------------------ATGATTCCTGTATTGACATCAAAAAA  26

Query   75  AGCAAGTGAATTACCAGTCAGTGAAGTTGCAAGCATTCTCCAAGCTGATCTTCAGAATGGTCTAAACAAATGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   27  AGCAAGTGAATTACCAGTCAGTGAAGTTGCAAGCATTCTCCAAGCTGATCTTCAGAATGGTCTAAACAAATGTG  100

Query  149  AAGTTAGTCATAGGCGAGCCTTTCATGGCTGGAATGAGTTTGATATTAGTGAAGATGAGCCACTGTGGAAGAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  101  AAGTTAGTCATAGGCGAGCCTTTCATGGCTGGAATGAGTTTGATATTAGTGAAGATGAGCCACTGTGGAAGAAG  174

Query  223  TATATTTCTCAGTTTAAAAATCCCCTTATTATGCTGCTTCTGGCTTCTGCAGTCATCAGTGTTTTAATGCATCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  175  TATATTTCTCAGTTTAAAAATCCCCTTATTATGCTGCTTCTGGCTTCTGCAGTCATCAGTGTTTTAATGCATCA  248

Query  297  GTTTGATGATGCCGTCAGTATCACTGTGGCAATACTTATCGTTGTTACAGTTGCCTTTGTTCAGGAATATCGTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  GTTTGATGATGCCGTCAGTATCACTGTGGCAATACTTATCGTTGTTACAGTTGCCTTTGTTCAGGAATATCGTT  322

Query  371  CAGAAAAATCTCTTGAAGAATTGAGTAAACTTGTGCCACCAGAATGCCATTGTGTGCGTGAAGGAAAATTGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  323  CAGAAAAATCTCTTGAAGAATTGAGTAAACTTGTGCCACCAGAATGCCATTGTGTGCGTGAAGGAAAATTGGAG  396

Query  445  CATACACTTGCCCGAGACTTGGTTCCAGGTGATACAGTTTGCCTTTCTGTTGGGGATAGAGTTCCTGCTGACTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  397  CATACACTTGCCCGAGACTTGGTTCCAGGTGATACAGTTTGCCTTTCTGTTGGGGATAGAGTTCCTGCTGACTT  470

Query  519  ACGCTTGTTTGAGGCTGTGGATCTTTCCATTGATGAGTCCAGCTTGACAGGTGAGACAACGCCTTGTTCTAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  471  ACGCTTGTTTGAGGCTGTGGATCTTTCCATTGATGAGTCCAGCTTGACAGGTGAGACAACGCCTTGTTCTAAGG  544

Query  593  TGACAGCTCCTCAGCCAGCTGCAACTAATGGAGATCTTGCATCGAGAAGTAACATTGCCTTTATGGGAACACTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  545  TGACAGCTCCTCAGCCAGCTGCAACTAATGGAGATCTTGCATCGAGAAGTAACATTGCCTTTATGGGAACACTG  618

Query  667  GTCAGATGTGGCAAAGCAAAGGGTGTTGTCATTGGAACAGGAGAAAATTCTGAATTTGGGGAGGTTTTTAAAAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  619  GTCAGATGTGGCAAAGCAAAGGGTGTTGTCATTGGAACAGGAGAAAATTCTGAATTTGGGGAGGTTTTTAAAAT  692

Query  741  GATGCAAGCAGAAGAGGCACCAAAAACCCCTCTGCAGAAGAGCATGGACCTCTTAGGAAAACAACTTTCCTTTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  GATGCAAGCAGAAGAGGCACCAAAAACCCCTCTGCAGAAGAGCATGGACCTCTTAGGAAAACAACTTTCCTTTT  766

Query  815  ACTCCTTTGGTATAATAGGAATCATCATGTTGGTTGGCTGGTTACTGGGAAAAGATATCCTGGAAATGTTTACT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  767  ACTCCTTTGGTATAATAGGAATCATCATGTTGGTTGGCTGGTTACTGGGAAAAGATATCCTGGAAATGTTTACT  840

Query  889  ATTAGTGTAAGTTTGGCTGTAGCAGCAATTCCTGAAGGTCTCCCCATTGTGGTCACAGTGACGCTAGCTCTTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  ATTAGTGTAAGTTTGGCTGTAGCAGCAATTCCTGAAGGTCTCCCCATTGTGGTCACAGTGACGCTAGCTCTTGG  914

Query  963  TGTTATGAGAATGGTGAAGAAAAGGGCCATTGTGAAAAAGCTGCCTATTGTTGAAACTCTGGGCTGCTGTAATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  TGTTATGAGAATGGTGAAGAAAAGGGCCATTGTGAAAAAGCTGCCTATTGTTGAAACTCTGGGCTGCTGTAATG  988

Query 1037  TGATTTGTTCAGATAAAACTGGAACACTGACGAAGAATGAAATGACTGTTACTCACATATTTACTTCAGATGGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  989  TGATTTGTTCAGATAAAACTGGAACACTGACGAAGAATGAAATGACTGTTACTCACATATTTACTTCAGATGGT  1062

Query 1111  CTGCATGCTGAGGTTACTGGAGTTGGCTATAATCAATTTGGGGAAGTGATTGTTGATGGTGATGTTGTTCATGG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063  CTGCATGCTGAGGTTACTGGAGTTGGCTATAATCAATTTGGGGAAGTGATTGTTGATGGTGATGTTGTTCATGG  1136

Query 1185  ATTCTATAACCCAGCTGTTAGCAGAATTGTTGAGGCGGGCTGTGTGTGCAATGATGCTGTAATTAGAAACAATA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137  ATTCTATAACCCAGCTGTTAGCAGAATTGTTGAGGCGGGCTGTGTGTGCAATGATGCTGTAATTAGAAACAATA  1210

Query 1259  CTCTAATGGGGAAGCCAACAGAAGGGGCCTTAATTGCTCTTGCAATGAAGATGGGTCTTGATGGACTTCAACAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211  CTCTAATGGGGAAGCCAACAGAAGGGGCCTTAATTGCTCTTGCAATGAAGATGGGTCTTGATGGACTTCAACAA  1284

Query 1333  GACTACATCAGAAAAGCTGAATACCCTTTTAGCTCTGAGCAAAAGTGGATGGCTGTTAAGTGTGTACACCGAAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285  GACTACATCAGAAAAGCTGAATACCCTTTTAGCTCTGAGCAAAAGTGGATGGCTGTTAAGTGTGTACACCGAAC  1358

Query 1407  ACAGCAGGACAGACCAGAGATTTGTTTTATGAAAGGTGCTTACGAACAAGTAATTAAGTACTGTACTACATACC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359  ACAGCAGGACAGACCAGAGATTTGTTTTATGAAAGGTGCTTACGAACAAGTAATTAAGTACTGTACTACATACC  1432

Query 1481  AGAGCAAAGGGCAGACCTTGACACTTACTCAGCAGCAGAGAGATGTGTACCAACAAGAGAAGGCACGCATGGGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433  AGAGCAAAGGGCAGACCTTGACACTTACTCAGCAGCAGAGAGATGTGTACCAACAAGAGAAGGCACGCATGGGC  1506

Query 1555  TCAGCGGGACTCAGAGTTCTTGCTTTGGCTTCTGGTCCTGAACTGGGACAGCTGACATTTCTTGGCTTGGTGGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507  TCAGCGGGACTCAGAGTTCTTGCTTTGGCTTCTGGTCCTGAACTGGGACAGCTGACATTTCTTGGCTTGGTGGG  1580

Query 1629  AATCATTGATCCACCTAGAACTGGTGTGAAAGAAGCTGTTACAACACTCATTGCCTCAGGAGTATCAATAAAAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581  AATCATTGATCCACCTAGAACTGGTGTGAAAGAAGCTGTTACAACACTCATTGCCTCAGGAGTATCAATAAAAA  1654

Query 1703  TGATTACTGGAGATTCACAGGAGACTGCAGTTGCAATCGCCAGTCGTCTGGGATTGTATTCCAAAACTTCCCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655  TGATTACTGGAGATTCACAGGAGACTGCAGTTGCAATCGCCAGTCGTCTGGGATTGTATTCCAAAACTTCCCAG  1728

Query 1777  TCAGTCTCAGGAGAAGAAATAGATGCAATGGATGTTCAGCAGCTTTCACAAATAGTACCAAAGGTTGCAGTATT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729  TCAGTCTCAGGAGAAGAAATAGATGCAATGGATGTTCAGCAGCTTTCACAAATAGTACCAAAGGTTGCAGTATT  1802

Query 1851  TTACAGAGCTAGCCCAAGGCACAAGATGAAAATTATTAAGTCGCTACAGAAGAACGGTTCAGTTGTAGCCATGA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803  TTACAGAGCTAGCCCAAGGCACAAGATGAAAATTATTAAGTCGCTACAGAAGAACGGTTCAGTTGTAGCCATGA  1876

Query 1925  CAGGAGATGGAGTAAATGATGCAGTTGCTCTGAAGGCTGCAGACATTGGAGTTGCGATGGGCCAGACTGGTACA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877  CAGGAGATGGAGTAAATGATGCAGTTGCTCTGAAGGCTGCAGACATTGGAGTTGCGATGGGCCAGACTGGTACA  1950

Query 1999  GATGTTTGCAAAGAGGCAGCAGACATGATCCTAGTGGATGATGATTTTCAAACCATAATGTCTGCAATCGAAGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951  GATGTTTGCAAAGAGGCAGCAGACATGATCCTAGTGGATGATGATTTTCAAACCATAATGTCTGCAATCGAAGA  2024

Query 2073  GGGTAAAGGGATTTATAATAACATTAAAAATTTCGTTAGATTCCAGCTGAGCACGAGTATAGCAGCATTAACTT  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025  GGGTAAAGGGATTTATAATAACATTAAAAATTTCGTTAGATTCCAGCTGAGCACGAGTATAGCAGCATTAACTT  2098

Query 2147  TAATCTCATTGGCTACATTAATGAACTTTCCTAATCCTCTCAATGCCATGCAGATTTTGTGGATCAATATTATT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099  TAATCTCATTGGCTACATTAATGAACTTTCCTAATCCTCTCAATGCCATGCAGATTTTGTGGATCAATATTATT  2172

Query 2221  ATGGATGGACCCCCAGCTCAGAGCCTTGGAGTAGAACCAGTGGATAAAGATGTCATTCGTAAACCTCCTCGCAA  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2173  ATGGATGGACCCCCAGCTCAGAGCCTTGGAGTAGAACCAGTGGATAAAGATGTCATTCGTAAACCTCCTCGCAA  2246

Query 2295  CTGGAAAGACAGCATTTTGACTAAAAACTTGATACTTAAAATACTTGTTTCATCAATAATCATTGTTTGTGGGA  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2247  CTGGAAAGACAGCATTTTGACTAAAAACTTGATACTTAAAATACTTGTTTCATCAATAATCATTGTTTGTGGGA  2320

Query 2369  CTTTGTTTGTCTTCTGGCGTGAGCTACGAGACAATGTGATTACACCTCGAGACACAACAATGACCTTCACATGC  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2321  CTTTGTTTGTCTTCTGGCGTGAGCTACGAGACAATGTGATTACACCTCGAGACACAACAATGACCTTCACATGC  2394

Query 2443  TTTGTGTTTTTTGACATGTTCAATGCACTAAGTTCCAGATCCCAGACCAAGTCTGTGTTTGAGATTGGACTCTG  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2395  TTTGTGTTTTTTGACATGTTCAATGCACTAAGTTCCAGATCCCAGACCAAGTCTGTGTTTGAGATTGGACTCTG  2468

Query 2517  CAGTAATAGAATGTTTTGCTATGCAGTTCTTGGATCCATCATGGGACAATTACTAGTTATTTACTTTCCTCCGC  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2469  CAGTAATAGAATGTTTTGCTATGCAGTTCTTGGATCCATCATGGGACAATTACTAGTTATTTACTTTCCTCCGC  2542

Query 2591  TTCAGAAGGTTTTTCAGACTGAGAGCCTAAGCATACTGG-----------------------------------  2629
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                   
Sbjct 2543  TTCAGAAGGTTTTTCAGACTGAGAGCCTAAGCATACTGGATCTGTTGTTTCTTTTGGGTCTCACCTCATCAGTG  2616

Query 2630  --------------------------------------------------------------------------  2629
                                                                                      
Sbjct 2617  TGCATAGTGGCAGAAATTATAAAGAAGGTTGAAAGGAGCAGGGAAAAGATCCAGAAGCATGTTAGTTCGACATC  2690

Query 2630  ----------------GTCTGGCTCTGGGAGAGGAGTGGACAGCAGC-GGT-----------------------  2663
                            ||||||||||||||||||||||||||||||| |||                       
Sbjct 2691  ATCATCTTTTCTTGAAGTCTGGCTCTGGGAGAGGAGTGGACAGCAGCTGGTTGAGATACATCCCCATCTGGAGA  2764

Query 2664  -----------------------------------  2663
                                               
Sbjct 2765  CAGGACTGCCACTGACAGAAGATGTGAGCTGTGTC  2799