Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_14172
• Subject: NM_001368996.1
• Aligned Length: 1026
• Identities: 762
• Gaps: 264

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGATGCGGGTGTGCTGGTTGGTGAGACAGGACAGCCGGCACCAGCGAATCAGACTTCCACATTTGGAAGCAGT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  TGTGATTGGGCGTGGCCCAGAGACCAAGATCACTGATAAGAAATGTTCTCGACAGCAAGTACAGTTGAAAGCAG  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  AGTGTAACAAGGGATATGTCAAGGTAAAGCAGGTAGGAGTCAATCCCACCAGCATTGACTCAGTCGTAATTGGG  222

Query    1  ------------------------------------------ATGGTGAATGAACTTTATCCATATATTGTAGA  32
                                                      ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGGACCAAGAGGTGAAGCTGCAGCCTGGCCAGGTTCTCCACATGGTGAATGAACTTTATCCATATATTGTAGA  296

Query   33  GTTTGAGGAAGAGGCAAAGAACCCTGGCCTGGAAACACACAGGAAGAGAAAGAGATCAGGCAACAGTGATTCTA  106
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTTTGAGGAAGAGGCAAAGAACCCTGGCCTGGAAACACACAGGAAGAGAAAGAGATCAGGCAACAGTGATTCTA  370

Query  107  TAGAAAGGGATGCTGCTCAGGAAGCTGAGGCTGGGACAGGGCTGGAACCTGGGAGCAACTCTGGCCAATGCTCT  180
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGAAAGGGATGCTGCTCAGGAAGCTGAGGCTGGGACAGGGCTGGAACCTGGGAGCAACTCTGGCCAATGCTCT  444

Query  181  GTGCCCCTAAAGAAGGGAAAAGATGCACCTATCAAAAAGGAATCCCTGGGCCACTGGAGTCAAGGCTTGAAGAT  254
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGCCCCTAAAGAAGGGAAAAGATGCACCTATCAAAAAGGAATCCCTGGGCCACTGGAGTCAAGGCTTGAAGAT  518

Query  255  TTCTATGCAGGACCCCAAAATGCAGGTTTACAAAGATGAGCAGGTGGTGGTGATAAAGGATAAATACCCAAAGG  328
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTCTATGCAGGACCCCAAAATGCAGGTTTACAAAGATGAGCAGGTGGTGGTGATAAAGGATAAATACCCAAAGG  592

Query  329  CCCGTTACCATTGGCTGGTCTTACCGTGGACCTCCATTTCCAGTCTGAAGGCTGTGGCCAGGGAACACCTTGAA  402
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCGTTACCATTGGCTGGTCTTACCGTGGACCTCCATTTCCAGTCTGAAGGCTGTGGCCAGGGAACACCTTGAA  666

Query  403  CTCCTTAAGCATATGCACACTGTGGGGGAAAAGGTGATTGTAGATTTTGCTGGGTCCAGCAAACTCCGCTTCCG  476
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTCCTTAAGCATATGCACACTGTGGGGGAAAAGGTGATTGTAGATTTTGCTGGGTCCAGCAAACTCCGCTTCCG  740

Query  477  ATTGGGCTACCACGCCATTCCGAGTATGAGCCATGTACATCTTCATGTGATCAGCCAGGATTTTGATTCTCCTT  550
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTGGGCTACCACGCCATTCCGAGTATGAGCCATGTACATCTTCATGTGATCAGCCAGGATTTTGATTCTCCTT  814

Query  551  GCCTTAAAAACAAAAAACATTGGAATTCTTTCAATACAGAATACTTCCTAGAATCACAAGCTGTGATCGAGATG  624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCTTAAAAACAAAAAACATTGGAATTCTTTCAATACAGAATACTTCCTAGAATCACAAGCTGTGATCGAGATG  888

Query  625  GTACAAGAGGCTGGTAGAGTAACTGTCCGAGATGGGATGCCTGAGCTCTTGAAGCTGCCCCTTCGTTGTCATGA  698
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTACAAGAGGCTGGTAGAGTAACTGTCCGAGATGGGATGCCTGAGCTCTTGAAGCTGCCCCTTCGTTGTCATGA  962

Query  699  GTGCCAGCAGCTGCTGCCTTCCATTCCTCAGCTGAAAGAACATCTCAGGAAGCACTGGACACAG  762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTGCCAGCAGCTGCTGCCTTCCATTCCTCAGCTGAAAGAACATCTCAGGAAGCACTGGACACAG  1026